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2009 Fiscal Year Annual Research Report

比較トランスクリプトミクスを利用したザゼンソウ低温応答遺伝子群の解析

Research Project

Project/Area Number 20780070
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

稲葉 靖子  Iwate University, 農学部, 学術研究員 (80400191)

Keywords発熱植物 / ザゼンソウ / 低温応答 / トランスクリプトミクス / SuperSAGE
Research Abstract

寒冷地に自生するザゼンソウは、開花後1-2週間にわたり生殖器官である肉穂花序で発熱することが知られている。多くの植物において見出されている凍結耐性誘導型の低温ストレス回避機構とは異なり、ザゼンソウは発熱することにより低温ストレスを回避していると考えられている。本研究では、ザゼンソウの低温応答遺伝子群を同定して、モデル植物シロイヌナズナ等ですでに報告されている低温応答遺伝子群との比較解析を行うことにより、両者の共通点および相違点を探ることを目的としている。
当該年度はまず、発熱するザゼンソウ花序の低温誘導前後のサンプルから調製した26bpのSuperSAGEタグと本植物花序のESTライブラリーとのアノテーションを行い、シロイヌナズナ等の他のモデル植物におけるタグデータベースとの比較解析を行った。その結果、ザゼンソウでは低温誘導前後に関係なく、ミトコンドリアの生合成や呼吸機能に関わる遺伝子群の発現レベルが高くなっていることが明らかとなった。一方で、生化学および形態学的な手法により、ザゼンソウの発熱組織では呼吸機能の活発なミトコンドリアが豊富に含まれていることが明らかとなり、この特徴は近縁種であり発熱しないミズバショウと比べても顕著であった。以上の結果から、ザゼンソウの発熱組織はミトコンドリア機能を活発に動作させるための堅固な生体システムを構築していることが示唆された。現在、低温誘導前後で発現パターンの変動する遺伝子群を抽出する作業に着手しており、他植物における低温応答遺伝子群との相違について検討を進めている。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Developmental changes and organelle biogenesis in the reproductive organ of thermogenic skunk cabbage(Symplocarpus renifolius)2009

    • Author(s)
      稲葉靖子
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany 60

      Pages: 3909-3922

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] What is critical for plant thermogenesis? Differences in mitochondrial activity and protein expression between thermogenic and non-thermogenic skunk cabbages2009

    • Author(s)
      稲葉靖子
    • Journal Title

      Planta 231

      Pages: 121-130

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 発熱するザゼンソウ-大量のミトコンドリアを発見-2009

    • Author(s)
      稲葉靖子
    • Journal Title

      科研費NEWS 3

      Pages: 16-16

  • [Presentation] ザゼンソウとミズバショウの比較による植物熱産生機構の解析2010

    • Author(s)
      稲葉靖子
    • Organizer
      日本農芸化学会 2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] Developmental changes and organelle biogenesis in the reproductive organs of thermogenic skunk cabbage2009

    • Author(s)
      稲葉靖子
    • Organizer
      Plant Biology 2009
    • Place of Presentation
      ハワイコンベンションセンター(ハワイ・ホノルル)
    • Year and Date
      20090718-20090722

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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