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2009 Fiscal Year Annual Research Report

"環境的要因"が関わる低温活性金属酵素の低温適応機構の解明とその応用

Research Project

Project/Area Number 20780074
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

鶴田 宏樹  Kobe University, 連携創造本部, 准教授 (20346282)

Keywords低温活性金属酵素 / 好冷性細菌 / 低温適応 / X線結晶構造解析 / 触媒反応効率 / フォスファターゼ
Research Abstract

好冷菌産生酵素の低温での高い活性の発現能(低温活性発現能)にとって、触媒部位に位置する求核基が、低温から常温における触媒反応時に効率よく基質分子に作用することが重要である。多くの加水分解酵素では、求核攻撃を担う求核基は補因子である金属イオンにより脱プロトン化されたOH^-分子であり、基質に対する求核攻撃に適した空間に配置されている。その適切な空間配置は金属イオンの種類に支配されると考えられ、その金属を配位させる機構が低温活性発現能を導く"環境的要因"であると考えられる。本研究では,好冷菌Shewanella sp.が産生し、触媒部位中に2個の金属を配位しているCold-active phosphataseに着目した。平成21年度には、(1)配位金属をMgイオンに置換したMg型酵素の構造特性をZn型酵素と構造を比較すること、(2) Shewanella sp.における金属濃度環境を制御する因子(金属輸送蛋白質など)の探索を試みた。(1)については、Mg型酵素の構造モデルを分解能1.3Åで決定した。決定した構造とZn型酵素の構造との比較解析を行うことで金属置換によって柔軟性が変動した領域が分子表面から触媒部位近傍構造までつながっていることを明示した。柔軟性の高い領域の分布から、Mg型酵素では、低温において低下した溶媒の分子運動が効率よく触媒部位に伝達されることで低温活性発現が可能となると示唆した。(2)に関しては、海水に含まれる2価イオンの存在・非存在下で培養したShewanella sp.で発現している蛋白質を2次元電気泳動法で比較した。その結果、2価金属イオンが培地中に海水濃度で存在することによって、2種の塩基性蛋白質(約20kD)の発現誘導を確認した。現在、これらの蛋白質をアミノ酸配列分析によって同定し、低温活性酵素の低温環境適応能に対する"環境的要因"との相関を確認しつつある。

  • Research Products

    (3 results)

All 2010 2009

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of cold-active alkaline phosphatase from psychrophile Shewanella sp.2010

    • Author(s)
      H.Tsuruta, et al.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 74

      Pages: 69-74

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mgイオン存在下で再生したCold-active protein tyrosine phosphataseの立体構造解析2010

    • Author(s)
      鶴田宏樹、三上文三
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 好冷菌Shewanella sp.が産生するCold-active alkaline phosphataseの結晶構造2009

    • Author(s)
      鶴田宏樹、三上文三、東哲生、相薗泰生
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-22

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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