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2008 Fiscal Year Annual Research Report

魚類資源における日本海-太平洋間の適応的分化の検出 : エコゲノミクス解析

Research Project

Project/Area Number 20780139
Research InstitutionFukui Prefectural University

Principal Investigator

小北 智之  Fukui Prefectural University, 生物資源学部, 講師 (60372835)

Keywords適応進化 / 魚類 / 自然淘汰 / 海洋生態系 / 遺伝資源
Research Abstract

日本各地に生息する遡河回遊魚シロウオには、研究代表者の研究によって、1)日本海型と太平洋型といった2つの地理的分化集団が存在すること、2)個体の適応度に関与していると考えられるいくつかの形質に対照的な表現型分化が生じていることが明らかとなっており、このような変異は過去に激しい環境変動を経験した日本海に生息する系統の適応進化の産物であることが示唆されている。このようなシロウオ日本海型と太平洋型間の適応的分化の痕跡を探索するために、新規に単離・マーカー化したマイクロサテライト100遺伝子座のジェノタイピングデータを基にした集団ゲノム学的解析を行った。その結果、日本海型に正の淘汰が生じた可能性を示唆するいくつかの遺伝子座を検出した。さらに、シロウオ日本海型は太平洋型よりも摂餌行動が活発で、成長速度が速く、その結果として、体サイズが大きいことがこれまでの研究で判明している。このような日本海型の形質に関与する候補遺伝子群として、成長関連遺伝子群(成長ホルモン遺伝子、成長ホルモンレセプター遺伝子、IGF-1遺伝子)と食欲関連遺伝子群(亢進性のタンパクを対象 : NPY遺伝子、ガラニン遺伝子、アグーチ遺伝子、MCH遺伝子、グレリン遺伝子、オレキシン遺伝子)をターゲットとし、これら遺伝子のcDNAクローニングを実施した。このうち平成20年度には、成長ホルモン遺伝子、NPY遺伝子、ガラニン遺伝子、アグーチ遺伝子、MCH遺伝子のcDNAクローニングに成功した。今後、これらの遺伝子を集団ゲノム学的解析に用いるために、イントロン部位やUTR部位の多型部位を対象とした分子マーカー化にも成功した。

  • Research Products

    (5 results)

All 2008

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Isolation and characterization of polymorphic trinucleotide and dinucleotide microsateRite loci for the ice goby, Leucopsarion petersii2008

    • Author(s)
      T. Kokita, S. Takahashi
    • Journal Title

      Molecular Ecology Resources 8

      Pages: 305-307

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Population genetic structure of the neon damselfish(Pomacentrus coeles tis)in the northwest Pacific Ocean2008

    • Author(s)
      SY. Liu, T. Kokita, CF. Dai
    • Journal Title

      Marine Biology 154

      Pages: 745-753

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロウオ日本海型と太平洋型の適応的分化に関与した遺伝子座の探索 : ゲノムスキャンを用いた解析2008

    • Author(s)
      高橋明香・小北智之
    • Organizer
      2008年度日本魚類学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛大学(松山)
    • Year and Date
      2008-09-22
  • [Presentation] ハリヨ雄の子の保護行動における集団間変異2008

    • Author(s)
      小北智之・森誠一
    • Organizer
      2008年度日本魚類学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛大学(松山)
    • Year and Date
      2008-09-22
  • [Presentation] 「海洋環境変化と生物の小進化」ワークショップ「人為的環境下における進化のメカニズム、及び保全策への応用」2008

    • Author(s)
      小北智之
    • Organizer
      日本進化学会第10回大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2008-08-23

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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