地球上の重要生産者である珪藻類の動態はウイルス感染の影響をどの程度受けるか

2008 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20780149
• Research Institution: Fisheries Research Agency
• Principal Investigator: 外丸 裕司 Fisheries Research Agency, 瀬戸内海区水産研究所・赤潮環境部, 研究員 (10416042)
• Keywords: 珪藻 / ウイルス / 生態 / 水産学

Research Abstract

珪藻ウイルスの現場動態をMPN法(限界希釈法)により広島湾で測定した結果,ウイルス出現量に季節的変動が認められた.しかしながら,とくにキートセロス属の種判別は困難であったため,宿主動態との関係にはさらなる検討が必要と思われた.この問題を解決するため,様々な珪藻種を分離培養し,各種遺伝子を標的とした塩基配列解析を行い,客観的な分子定量技術を開発するための基盤整備を行った.
沿岸域ブルーム原因珪藻キートセロス・テヌイッシマス14株と同種感染性ウイルス9株との間で交差試験を行った.その結果,9株のウイルスの内2株が明らかに他ウイルス株と異なる宿主株感染特異性を示した.このことは本種個体群とウイルス個体群との間に複雑な感染-被感染性の関係を示すものと思われた.また感染特異性の異なる2株のウイルスは,いずれもDNAウイルスであることが明らかになった.その内1株を珪藻ウイルスCtenDNAV(粒径37±2nm)と命名しさらなる解析を行った結果,本ウイルスは38.5kDaの主要タンパク質を持つ環状1本鎖DNAウイルスであることが明らかになった.共通の珪藻宿主を持つゲノムタイプの異なるウイルス(RNA,DNA)の分離に成功したのは,本研究が初めてである.
これまでに性状が明らかにされている珪藻感染性1本鎖RNAウイルス3種(CtenRNAV,RsRNAV,CsfrRNAV)のRNA依存性RNAポリメラーゼドメインを対象としたNJ法による系統学的解析を行った結果,それらは明らかな単系統を形成し,また塩基配列を用いたBLASTによる相同性解析でも,それらがお互いにきわめて近しい関係にあることが示された.以上の結果により,海洋環境中に進化的に近しい珪藻感染性ssRNAウイルスグループが存在するものと推定された.

Research Products

• [Journal Article] Characterization of the Chaetoceros salsugineum nuclear inclusion virus coat protein gene. (2009)
  • Author(s): Park, Y., Jung, S. -E., Tomaru, Y., Choi, W. -B., Mizumoto, H., Nagasaki, K., Choi, T. -J.
  • Journal Title: Virus Research (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus infecting the bloom forming diatom Chaetoceros socialis. (2009)
  • Author(s): Tomaru, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
  • Journal Title: Appl. Environ. Microbiol. (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros tenuissmus Meunier. (2008)
  • Author(s): Shirai, Y., Tomaru, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
  • Journal Title: Appl. Environ. Microbiol. 74 Pages: 4022-4027
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 珪藻に感染するウイルス-これまでの研究と今後の展望- (2009)
  • Author(s): 外丸裕司,豊田健介,白井葉子,高尾祥丈,水本祐之,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
  • Organizer: 日本藻類学会第33回大会講演要旨集
  • Place of Presentation: 沖縄県(琉球大学)
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] 海産浮遊性珪藻類の分子生物学的手法による種識別・検出・定量解析について (2009)
  • Author(s): 豊田健介,長崎慶三,外丸裕司
  • Organizer: 日本藻類学会第33回大会講演要旨集
  • Place of Presentation: 沖縄県(琉球大学)
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] ガラス質の鎧を纏う珪藻類もウイルスの攻撃を受ける (2008)
  • Author(s): 長崎慶三,豊田健介,白井葉子,外丸裕司
  • Organizer: 第56回日本ウイルス学会学術集会抄録集
  • Place of Presentation: 岡山県(岡山コンベンションセンター)
  • Year and Date: 2008-10-27
• [Presentation] 海産珪藻Chaetoceros socialis f. radiansに感染するRNAウイルスの基本性状. (2008)
  • Author(s): 外丸裕司,高尾祥丈,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
  • Organizer: 日本珪藻学会第28回研究集会講演要旨集
  • Place of Presentation: 山梨県(富士桜山荘)
  • Year and Date: 2008-10-25
• [Presentation] 珪藻Chaetoceros socialisに感染するRNAウイルス(CsfrRNAV)の生理・生態・遺伝学的性状. (2008)
  • Author(s): 外丸裕司,高尾祥丈,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
  • Organizer: 2008年度日本海洋学会秋季大会講演要旨集
  • Place of Presentation: 広島県(広島国際大学)
  • Year and Date: 2008-09-27
• [Presentation] Diatom viruses infectious to genera Rhizosolenia and Chaetoceros. (2008)
  • Author(s): Tomaru, Y., Shirai, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
  • Organizer: 20th International Diatom Symposium 2008
  • Place of Presentation: クロアチア(ドブロブニク)
  • Year and Date: 2008-09-09
• [Presentation] 珪藻類のリアルタイムPCR法による検出・定量解析の試み. (2008)
  • Author(s): 豊田健介,長崎慶三,外丸裕司
  • Organizer: 2008年日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会in熊本講演要旨集
  • Place of Presentation: 熊本県(熊本県立大学)
  • Year and Date: 2008-09-06
• [Presentation] Identification and characterization of the putative coat protein gene in Chaetoceros salsugineum nuclear inclusion virus. (2008)
  • Author(s): Park, Y., Tomaru, Y., Lee, K., Nagasaki, K., Choi, T.
  • Organizer: Abstracts of The 5th Aquatic Virus Workshop
  • Place of Presentation: カナダ(バンクーバー)
  • Year and Date: 2008-07-08
• [Presentation] Fateful encounter of virology and diatomology. (2008)
  • Author(s): Tomaru, Y., Shirai, Y., Takao, Y., Mizumoto, H., Suzuki, H., Nagumo, T., Toyoda, K., Nagasaki, K.
  • Organizer: Abstracts of The 5th Aquatic Virus Workshop
  • Place of Presentation: カナダ(バンクーバー)
  • Year and Date: 2008-07-08
• [Presentation] ガラスの鎧を持つ珪藻類はウイルスに感染するか? (2008)
  • Author(s): 長崎慶三,豊田健介,白井葉子,外丸裕司
  • Organizer: 第7回GS特別研究プロジェクト公開シンポジウム講演要旨集
  • Place of Presentation: 高知県(高知大学)
  • Year and Date: 2008-05-23
• [Remarks]
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/cgi-bin/htmlgen/htmllab.cgi?seigyo