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2008 Fiscal Year Annual Research Report

生体内分子機能の融合活用を目指した2本鎖DNA標的人工核酸の開発研究

Research Project

Project/Area Number 20790013
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

谷口 陽祐  Kyushu University, 薬学研究院, 助教 (00452714)

Keywords機能性人工核酸 / W-字型人工核酸 / アンチジーン / 3本鎖DNA / 分子認識 / 機能融合
Research Abstract

ヒトゲノムの全遺伝子配列が解読され、ポストゲノムシーケンス時代に突入した現在、ゲノム配列情報を利用した病気の診断や治療など、様々な研究への展開が盛んに行われている。本研究では、遺伝子を直接認識する機能性人工分子を用いることによって生体内に内在するたんぱく質本来の機能との相互作用を利用することで、人工分子と生体内分子の機能を融合活用する革新的な遺伝子発現制御法の開発を目指している。その方法の一つとして、3本鎖DNA形成に着目した。3本鎖DNA形成を利用した遺伝子発現阻害、変異や修復などの生体内反応を惹起する3本鎖DNA形成分子の探索を行うために、本研究室で開発した人工核酸(WNA : W-shaped Nucleoside Analogues)を基本骨格にその誘導体の合成・評価を行った。WNAは認識塩基部位であるヘテロ環と安定化部位である芳香環をビシクロ骨格に別々に結合させた人工核酸である。
これまで合成し評価した種々のWNA誘導体の結果をもとに、新たに設計を行った。その結果、WNAの変換部位の一つである認識塩基部分に5員環構造を有する誘導体を含んだ3本鎖形成オリゴヌクレオチドにより、非選択的な3本鎖DNA形成に成功した。さらにその結果に基づく新たな誘導体の設計・合成を行った。
さらに、がん遺伝子であるbc1-2遺伝子に対する3本鎖形成オリゴヌクレオチドの設計・合成を行った。3本鎖形成能の評価の結果、このオリゴヌクレオチドは3本鎖DNAを形成することが明らかとなった。さらに、WNAを組み込んだ3本鎖形成オリゴヌクレオチドを用いて、細胞増殖阻害能を検討中であり、予備的な結果ではあるが、阻害効果を示した結果が得られた。

  • Research Products

    (22 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (15 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Synthesis of p-amino-WNA derivatives to enhance the stability o f the anti-parallel triplex2008

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi, et.al.
    • Journal Title

      Tetrahedron 64

      Pages: 7164-7170

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design of S-vinylated 6-thioguanosine as a specific modifier of cytidine2008

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka, et.al.
    • Journal Title

      Collection Symp. Ser 10

      Pages: 159-163

  • [Journal Article] Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2-amino-6-v inylpurine to the 2'-deoxyribose skeleton via the methylene linker2008

    • Author(s)
      Yusuke Kurose, et.al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser 54

      Pages: 43-44

  • [Journal Article] Formation of a stable triplex incorporating a CG interrupting sit e by a new WNA derivative containing 3-aminopyrazole as a nu cleobase2008

    • Author(s)
      Yuko Uchida, et.al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser 52

      Pages: 137-138

  • [Journal Article] Site-specific modification by functionality-transfer oligonucleotide with the photo-inducible reactivity2008

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka, et.al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser 52

      Pages: 367-368

  • [Journal Article] Selective fluorescence quenching of the 8-oxoG-clamp by 8-oxodeo xyguanosine in ODN2008

    • Author(s)
      Tamer Nasr, et.al.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett. 19

      Pages: 727-730

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 8-OxoG-clampを用いたDNA配列選択的な8-オキソグアニン蛍光検出法の開発2009

    • Author(s)
      李志春
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20090326-28
  • [Presentation] 5員環認識塩基をもつWNA誘導体による非天然型3本鎖DNAの形成2008

    • Author(s)
      内田祐子
    • Organizer
      第25回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      20081206-07
  • [Presentation] 遺伝子特異的人工核酸のデリバリーシステムを用いた細胞内反応への展開一化学反応による遺伝子修飾および修復を目指して2008

    • Author(s)
      佐々木茂貴
    • Organizer
      第57回高分子討論会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学
    • Year and Date
      20080924-26
  • [Presentation] Formation of a stable triplex incorporating a CG interrupting site by a new WNA derivative containing 3-aminopyrazole as a nucleobase2008

    • Author(s)
      Yuko Uchid
    • Organizer
      Joint Symposium of the 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids and the 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20080908-12
  • [Presentation] Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2'-amino-6-v inylpurine to the 2'-deoxyribose skeleton via the methylene linker2008

    • Author(s)
      Yusuke Kurose
    • Organizer
      Joint Symposium of the 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids and the 35^<th> International Sy mposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20080908-12
  • [Presentation] Site-specific modification by functionality-transfer oligonucleotide with the nhoto-inducible reactivity2008

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Organizer
      Joint Symposium of the 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids and the 35th International Sy mposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20080908-12
  • [Presentation] Design of S-vinylated 6-thioguanosine as a specific modifier of cy tidine2008

    • Author(s)
      Shigeki Sasaki
    • Organizer
      XIV Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
    • Place of Presentation
      Prague in the Czech R epublic
    • Year and Date
      20080608-13
  • [Presentation] Synthesis and properties of 1'-disubstituted Nucleoside Analogues2008

    • Author(s)
      Tamer M. Nasr
    • Organizer
      The First Egypt-Japan International Symposi urn on Science and Technology
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080608-10
  • [Presentation] 生体模倣2核銅錯体による化学発光を利用した遺伝子検出プローブの開発2008

    • Author(s)
      谷口陽祐
    • Organizer
      第3回ケミカルバイオロジー研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080519-20
  • [Presentation] 小さな認識塩基をもつW字型人工核酸の合成と3本鎖形成能の評価2008

    • Author(s)
      内田祐子
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20080326-28
  • [Presentation] 異なる長さのリンカーを有するクロスリンク核酸の合成とその機能評価2008

    • Author(s)
      谷口陽祐
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20080326-28
  • [Presentation] RNAの部位特異的化学修飾を可能にする官能基転移反応2008

    • Author(s)
      鬼塚和光
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20080326-28
  • [Presentation] Molecular design for detection of RNA transcripts, higher order DNA structures and tiny changes of necleobases2008

    • Author(s)
      Shigeki Sasaki
    • Organizer
      BMB2008
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] 官能基転移性DNAプローブによるRNAの部位特異的修飾2008

    • Author(s)
      鬼塚和光
    • Organizer
      第18回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-09-28
  • [Presentation] 機能性核酸を導入したアンチセンス核酸によるサイズの異なるタンパク質の発現2008

    • Author(s)
      谷口陽祐
    • Organizer
      第18回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-09-28
  • [Remarks]

    • URL

      http://bioorg.phar.kyushu-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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