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2009 Fiscal Year Annual Research Report

生体内分子機能の融合活用を目指した2本鎖DNA標的人工核酸の開発研究

Research Project

Project/Area Number 20790013
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

谷口 陽祐  Kyushu University, 大学院・薬学研究院, 助教 (00452714)

Keywords機能性人工核酸 / W字型人工核酸 / アンチジーン / 3本鎖DNA / 分子認識 / 機能融合
Research Abstract

ヒトゲノムの全遺伝子配列が解読され、ゲノム配列情報を利用した病気の診断や治療など、様々な研究展開が盛んに行われている。本研究では、遺伝子を含んでいる2本鎖DNAを直接認識する機能性人工分子を用いることによって生体内に内在するたんぱく質本来の機能との相互作用を利用することで、人工分子と生体内分子の機能を融合活用する革新的な遺伝子発現制御法の開発を目指している。その方法の一つとして、3本鎖DNA形成を利用した遺伝子発現阻害、変異や修復などの生体内反応を惹起する3本鎖DNA形成分子の探索を行う事にした。本研究室で開発した人工核酸(WNA : W-shaped Nucleoside Analog)を基本骨格にその誘導体の合成・評価を行い、それらを搭載したオリゴヌクレオチドを用いて細胞増殖阻害活性を調べることにした。
これまで合成し評価した種々のWNA誘導体の結果をもとに新たに設計を行った。その結果、認識塩基に5員環を有する誘導体によりCGミスマッチサイトの認識、1'2'二置換WNA誘導体により安定性は低いもののミスマッチサイトの認識に成功した。また、糖骨格をシクロヘキサン環構造にすることでは、3本鎖DNA形成が低下することも見いだした。さらに、ガン遺伝子であるbc1-2遺伝子に対するWNA誘導体搭載3本鎖形成オリゴヌクレオチドの設計・合成を行った。3本鎖形成能の評価の結果、このオリゴヌクレオチドは天然型の3本鎖DNAよりもより安定な3本鎖DNAを形成することを見いだした。

  • Research Products

    (26 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (17 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A New Usage of Functionalized Oligodeoxynucleotide Probe for Site-Suecific Modification of a Guanine Base within RNA2010

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res 38

      Pages: 1760-1766

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Alkyl-Connected 2-Amino-6-Vinylprine (AVP) Crosslinking Agent for Improved Selectivity to the Cytosine Base in RNA2010

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective fluorescence quenching of the 8-oxoG-clamp by 8-oxodeo xyguanosine in ODN2009

    • Author(s)
      Tamer Nasr, et sl.
    • Journal Title

      Bioorg. Med.Chem.Lett. 19

      Pages: 727-730

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-Specific Covalent Modification of Nucleic Acids Guided by Functionalitv-Transfer Oligodeoxynucleotides2009

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem. 20

      Pages: 799-803

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A New Odorless Procedure for the synthesis of 2'deoxy-6-thioguanosine and It Incorporation Into Olieonucleotides.2009

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Journal Title

      Nucleoside Nucleotide and Nudge acid 28

      Pages: 752-760

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recognition of the CG interrupting site by W-shaped nucleoside analogs (WNA) having the pyrozole ring in an anti-parallel triplex DNA2009

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi
    • Journal Title

      Bioorg Med.Chem 17

      Pages: 6803-6810

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODN probes2009

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser 53

      Pages: 67-68

  • [Journal Article] Evaluation of the antisense effect of PEGylated oligodeoxynucleotides containing intelligent nucleoside analogues2009

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser 53

      Pages: 167-168

  • [Presentation] 3本鎖DNA形成を志向した新規二置換ヌクレオシドアナログの開発2010

    • Author(s)
      高木智子、谷口陽祐、石橋直人、佐々木茂貴
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] 高感度遺伝子検出を目指した銅錯体-DNAプローブの創製2010

    • Author(s)
      谷口陽祐
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] エチレンリンカーを導入したチオグアノシン誘導体の合成と機能評価2010

    • Author(s)
      西岡尊真
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] 3本鎖DNA形成を志向した新規1',2'-二置換ヌクレオシドアナログの開発2009

    • Author(s)
      高木智子
    • Organizer
      第26回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2009-12-13
  • [Presentation] 新規二核銅錯体-DNAコンジュゲートプローブを用いた高感度遺伝子検出法の開発2009

    • Author(s)
      新田晃子
    • Organizer
      第26回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] 8-オキソグアノシン特異的応答を示す蛍光プローブの開発2009

    • Author(s)
      李志春
    • Organizer
      第35回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2009-11-17
  • [Presentation] エチルリンカーを導入したチオグアノシン誘導体の合成と機能性核酸への展開2009

    • Author(s)
      西岡尊真
    • Organizer
      第35回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2009-11-17
  • [Presentation] 非天然型3本鎖DNA形成を可能にするW字型ビシクロ核酸誘導体の合成と機能評価2009

    • Author(s)
      谷口陽祐
    • Organizer
      第35回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2009-11-17
  • [Presentation] Site-Selective Chemical Modification of mRNA and its Effects on Polymerization and Translation2009

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Organizer
      Joint Symposium of 5th Annual Meeting of Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-11-04
  • [Presentation] APPLICATION OF THE THIONUCLEOSIDE ANALOG FOR BASE- SELECTIVE PHOTO-CROSS LINKING2009

    • Author(s)
      Takamasa Nishioka
    • Organizer
      Joint Symposium of 5th Annual Meeting of Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-11-04
  • [Presentation] DESIGN OF NEW NUCLEOSIDE ANALOGS FOR THE FORMATION OF STABLE TRIPLEX DNA AND ITS APPLICATION TO ANTIGENE INHIBITION2009

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi
    • Organizer
      Joint Symposium of 5th Annual Meeting of Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-11-04
  • [Presentation] ANALYSIS OF TRANSLATED PRODUCTS FROM THE CHEMICALLY MODIFIED mRNA2009

    • Author(s)
      Mohd Shihabuddin Ahmad Noorden
    • Organizer
      Joint Symposium of 5th Annual Meeting of Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-11-04
  • [Presentation] Development of novel disustituted nucleoside analogs for the formation of triplex DNA2009

    • Author(s)
      Tomoko Takaki, Yosuke Taniguchi, Naoto Ishibashi, Shigeki Sasaki
    • Organizer
      Asian Federation for Pharmaceutical Sciences 2009
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-10-17
  • [Presentation] EVALUATION OF THE RNA EDITING EFFICIENCY USING ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES CONTAINING THE FUNCTIONAL NUCLEOSIDE2009

    • Author(s)
      Mohd Shihabuddin Ahmad Noorden
    • Organizer
      Asian Federation for Pharmaceutical Sciences 2009
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-10-17
  • [Presentation] Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODN probes2009

    • Author(s)
      Kazumitsu Onizuka
    • Organizer
      The 6th International symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Gifu
    • Year and Date
      2009-09-27
  • [Presentation] Evaluation of the antisense effect of PEGylated oligodeoxynucleotides containing intelligent nucleoside analogues2009

    • Author(s)
      Yosuke Taniguchi
    • Organizer
      The 6th International symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Gifu
    • Year and Date
      2009-09-27
  • [Presentation] RNAの部位特異的修飾能をもつ官能基転移性ODNプローブの開発2009

    • Author(s)
      鬼塚和光
    • Organizer
      第4回ケミカルバイオロジー研究会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-05-18
  • [Remarks]

    • URL

      http://bioorg.phar.kyushu-u.ac.jp

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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