2008 Fiscal Year Final Research Report

Photoreaction mechanisms in photoreceptor proteins

Research Project

Project/Area Number	20870010
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
Allocation Type	Single-year Grants
Research Field	Biophysics
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	ISHIKITA Hiroshi Kyoto University, 医学研究科, 助教 (00508111)
Project Period (FY)	2007 – 2008
Keywords	生物物理 / 蛋白質 / 酵素反応 / 生体生命情報学 / コンピューターシミュレーション
Research Abstract	光受容体蛋白質BLUF (blue light sensing using FAD, FAD : flavin adenine dinucleotide)の光反応機構を理論計算的手法で解析した。BLUFの蛋白質立体構造データに基づき、静電ポテンシャル計算によってBLUF活性部位であるflavin, Tyr-21及びTrp-104の酸化還元電位を計算し、BLUFの電子移動反応の駆動力を求めた。その結果、活性時の蛋白質コンフォメーションを反映している立体構造を同定できた。