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2008 Fiscal Year Annual Research Report

植物における時計関連タンパク質の生化学的解析

Research Project

Project/Area Number 20870040
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

中道 範人  The Institute of Physical and Chemical Research, 生産制御研究チーム, 基礎科学特別研究員 (90513440)

Keywords植物 / シロイヌナズナ / 生物時計 / 概日リズム / 低温ストレス / DNAアレイ / PRR / インフォマティクス
Research Abstract

シロイヌナズナの生物時計は、MYB様転写因子をコードするCIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1(CCA1)遺伝子、LATE ELONGATED HYPOCOTYL(LHY)遺伝子とPSEUDO RESPONSE REGULATOR遺伝子群(PRR9、PRR7、PRR5、PRR1)らの相互の転写制御によって成り立つことが示唆されている。しかしながらPRRタンパクの生化学的な機能は分かっておらず、実際の時計の分子機構はまだ推測の域をでない。
本年度、私は、時計変異体セットの中でも最も厳しい時計形質(概日リズムの無周期)を示すprr9prr7prr5三重変異体(以下、d975と略す)のDNAアレイ解析を行い、1)d975では時計出力遺伝子のほぼ全てのリズム成分が無くなる事、2)d975では体内時間の位相が主観的昼で止まっている事を発見、報告した(発表論文1)。つまりPRR9、PRR7、PRR5は植物ゲノムの転写レベルの日内の時間変遷(朝から夕)に必須であると強く示唆された。また野生型に比べて、d975で発現異常を示す遺伝子をおよそ600個見つけた。この研究により、PRRタンパクは生理的に昼ごろに機能する事と、PRRタンパクのゲノムワイドなターゲット遺伝子の候補が見つかった。これらは、今後のPRRタンパク質機能の同定にたいして有用な情報である。
またPRRタンパクの主要な細胞内局在を核内と決定する事ができた(未発表)。さらにPRRタンパクのターゲット候補の遺伝子のプロモーター活性を、過剰なPRR遺伝子の発現により、抑制あるいは誘導できるかを確認する実験が完了している。これらの結果はPRRタンパクが転写調節因子の働きを持つ事を示唆している。

  • Research Products

    (5 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Transcript Profiling of an Arabidopsis PSEUDO RESPONSE REGULATOR Arrhythmic Triple Mutant Reveals a Role for the Circadian Clock in Cold Stress Response2009

    • Author(s)
      Nakamichi N, et al.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Genetic Study of the Arabidopsis Circadian Clock with Reference to the TIMING OF CAB EXPRESSION 1 (TOC1) Gene2008

    • Author(s)
      Ito S, et al.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Involvement of Arabidopsis clock-associated pseudo-response regulators in diurnal oscillations of gene expression in the presence of environmental time cues2008

    • Author(s)
      Yamashino T, et al.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol 49

      Pages: 1839-1850

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 植物時計変異体のDNAアレイ解析2008

    • Author(s)
      中道範人, ら
    • Organizer
      第15回時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2008-11-08
  • [Remarks]

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/brt/index.html

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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