2022 Fiscal Year Annual Research Report
Decoding the code for the lncRNA function to induce intracellular phase separation
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20H00448
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
廣瀬 哲郎 大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (30273220)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | RNA / 超分子複合体 / 核構造・機能 / 細胞小器官 / タンパク質 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、NEAT1 lncRNAを骨格に相分離形成されるパラスペックル構造体をモデルにして、相分離構造体の構築機構、相分離構造体の作動機構、新規arcRNAの探索を進めている。本年度は、これまでに推進してきたNEAT1ブロック共重合体のミセル化を介したパラスペックル構造体の特徴的な二層構造の形成機構を担うタンパク質因子の解析を進めた。特にこれまでに明らかでなかったパラスペックル二層構造の親水性シェルの形成を担う因子として昨年度同定した核内の代表的なRNA結合タンパク質の解析をさらに進め、このタンパク質の機能ドメイン、また細胞内に存在するパラログの機能性を検証した。さらに核内におけるパラスペックルが他の非膜オルガネラのスペックルから分離独立して存在する機構についても解析を進め、これまでに当グループで明らかにしていた分離独立を促進する因子に加えて、逆にスペックルへの取り込みを促進する因子の存在を明らかにした。これによって２つの非膜オルガネラの相対的な存在様式は、分離と取り込みの相反する機構のバランスから成り立っていることを明らかにした。またこれらの２つの活性はNEAT1の特定領域に依存していることが示唆された。これによって、NEAT1には単なるパラスペックル形成のためだけでなく、出来上がったパラスペックルが的確に核内に存在するための機構まで暗号として保持していることが示唆された。新規なarcRNA探索については、これまでに実施した様々なストレス条件下の細胞での難溶性RNA-seqデータから血清飢餓ストレスで誘導され、高発現かつ難溶性を示す新規なlncRNAを同定することに成功し、そのRNAが細胞内で非膜オルガネラ様のfociを形成していることを見出した。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] Biomolecular condensates scaffolded by RNAs: towards their theoretical and systematic understandings2022
Author(s)
Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Hyura Yoshino, Hiro Takakuwa, Sylvie Souquere, Wakana Isshiki, Mizuki Iwata, Rie Doi, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
Organizer
第23回日本RNA学会年会
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[Presentation] 理論と構成的アプローチを用いたRNAを足場とする非膜オルガネラの形成原理の解析2022
Author(s)
Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Yamamoto, Hyura Yoshino, Hiro Takakuwa, Sylvie Souquere, Wakana Isshiki, Mizuki Iwata, Rie Doi, Shinichi Nakagawa, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose
Organizer
第45回日本分子生物学会年会
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