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2023 Fiscal Year Annual Research Report

生物の系統・全ゲノム情報を利用した貿易を通じた種多様性・固有性評価に関する研究

Research Project

Project/Area Number 20H00651
Research InstitutionResearch Institute for Humanity and Nature

Principal Investigator

金本 圭一朗  総合地球環境学研究所, 研究部, 准教授 (20736350)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高梨 功次郎  信州大学, 学術研究院理学系, 准教授 (10632119)
土中 哲秀  九州大学, システム情報科学研究院, 准教授 (30824982)
久保田 康裕  琉球大学, 理学部, 教授 (50295234)
筧 雄介  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜花き研究部門, 主任研究員 (50636727)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywordsゲノム / 種 / 生物多様性 / サプライチェーン / 農業
Outline of Annual Research Achievements

私たちの消費は複雑なグローバル・サプライチェーンを通じて、消費している場所とは全く異なる場所で種を絶滅の危機に晒していることが明らかになってきた。例えば、研究代表者らが、Nature誌に掲載してきた研究によって、日本の木造住宅の建設が、日本の製材業、パプアニューギニアでの森林伐採というサプライチェーンを通じて、パプアニューギニアで多くの生物を絶滅の危機に晒していることが明らかになった。研究代表者らのこれまでの研究では、生物多様性を定量化するために、種数を使うことでサプライチェーンを通じた生物多様性への影響を明らかにしてきた。しかしながら、種数などの多くの既存指標には問題があり、より多面的な生物情報を使うことが求められる。本研究では、主に2つの研究を実施した。第一に、種分布モデルなどを利用して、農作物生産と生物多様性の保全優先度との関連を明らかにした。さらに、その生産から消費までのサプライチェーンをたどることで、各国の農作物の消費と保全優先度との関係を明らかにした。もう一つの成果は、木本植物のゲノム情報を利用することで、様々な種類の酵素別に木本植物の分布を明らかにしたことである。ゲノム情報の中にある、酵素の情報を1434種の木本植物について取り出した。そして、それぞれの種の種分布情報から、どの酵素が、どのような地域に偏在しているのかを明らかにした。その結果、創薬関連の酵素は、全体としては特定の地域に依存してはないものの、特定の酵素に対してはかなり依存していることが明らかになった。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ノルウェー科学技術大学(ノルウェー)

    • Country Name
      NORWAY
    • Counterpart Institution
      ノルウェー科学技術大学
  • [Int'l Joint Research] ライデン大学(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      ライデン大学
  • [Journal Article] Mapping Natural Product Biosynthetic Hotspots: Prioritizing Conservation for Medicinal Resources2023

    • Author(s)
      Fahmi Muhamad、Takanashi Kojiro、Kakei Yusuke、Kubota Yasuhiro、Kanemoto Keiichiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: NA Pages: NA

    • DOI

      10.1101/2023.08.12.553062

    • Open Access
  • [Journal Article] Mapping potential conflicts between global agriculture and terrestrial conservation2023

    • Author(s)
      Hoang Nguyen Tien、Taherzadeh Oliver、Ohashi Haruka、Yonekura Yusuke、Nishijima Shota、Yamabe Masaki、Matsui Tetsuya、Matsuda Hiroyuki、Moran Daniel、Kanemoto Keiichiro
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 120 Pages: e2208376120

    • DOI

      10.1073/pnas.2208376120

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mapping Natural Product Biosynthetic Hotspots: Prioritizing Conservation for Drug Discovery Potential2024

    • Author(s)
      Fahmi Muhamad, Kojiro Takanashi, Yusuke Kakei, Yasuhiro Kubota, Keiichiro Kanemoto
    • Organizer
      日本LCA学会
  • [Presentation] Mapping Natural Product Biosynthetic Hotspots in Woody Plants: Prioritizing Conservation for Drug Discovery Potential2024

    • Author(s)
      Fahmi Muhamad, Kojiro Takanashi, Yusuke Kakei, Yasuhiro Kubota, Keiichiro Kanemoto
    • Organizer
      The 11th Biennial Conference of the International Biogeography Society
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] Spatial Footprint

    • URL

      https://agriculture.spatialfootprint.com/biodiversity

URL: 

Published: 2024-12-25  

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