遺伝的に多様な純系を作出するための遺伝資源評価パイプラインの構築

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20H00975
• Research Category: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: 3110:Agricultural chemistry, agricultural and environmental biology, forestry and forest products science, applied aquatic science, agricultural economics and rural sociology, agricultural engineering, veterinary medical science, animal science, and related fields
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: Ohta Atsushi 京都大学, 農学研究科, 技術職員
• Project Period (FY): 2020-04-01 –
• Keywords: コムギ近縁野生種 / Aegilops bicornis / 純系 / ヘテロ接合度 / 系統解析 / 集団構造 / 主成分分析 / GRAS-Di

Outline of Final Research Achievements

本研究では、複数の純系で構成された「遺伝的に多様な純系集団」を整備するために、新たな純系候補を選抜するパイプラインの構築をおこなった。構築したパイプラインは、二段階選抜で純系候補を選ぶ: 第一に、SNP情報で系統解析をおこない、純系を含まない系統群を一次選抜する。第二に、表現型情報で二次選抜する。コムギ近縁野生種Aegilops bicornis に対して、このパイプラインを適用し、新たな純系候補を選抜した。そして、選ばれた系統を純系化するために播種・栽培した。

Free Research Field

植物遺伝資源学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ゲノム情報は、ジーンバンクの系統保存や系統集団の作成のために、広く活用されており、また、今後も益々が活用されるであろう。本研究の「純系候補選抜パイプライン」の構築とその利用は、ジーンバンクにおけるゲノム情報活用の一例である。
純系候補選抜パイプラインの使用は、ゲノムワイドSNP情報と表現型情報を定量的に扱うことで、より効率的に遺伝的に多様な純系集団を作成できる。このパイプラインは、コムギ遺伝資源系統だけでなく、様々な生物種にも適用可能であろう。