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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Unseen deep biosphere: organic molecules in anoxic primitive prokaryotic cell.

Research Project

Project/Area Number 20H02019
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

高野 淑識  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋機能利用部門(生物地球化学センター), センター長代理 (80399815)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywordsアーキア(古細菌) / ロキアーキオータ / 共通祖先
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、炭素源となる有機酸系、炭素・窒素源となるアミノ酸とともに、硫黄源の給源を考慮し、単離株を用いた栄養性の応答の動態解析を行った。その解析には、ペプチド結合を介在した分子自身の性質(易分解性)に加え、試料由来の有機・無機マトリックス効果の除去、分子種の多様性など分析上の克服点が多少存在した。それゆえに、アミノ酸に比べて、詳細な動態や知見が遅れ気味であったという側面があるため、分析の最適化の意義は大きいと考えられた。この点は、産業技術総合研究所との共同研究で相互補完した。

具体的には、1)短鎖ペプチド類には、同じ化学組成で、同じ質量数の分子が存在することから、クロマトグラフ
ィーによる分離が必須であり、オンライン質量分析法の最適化を行った。2)濃度既知のスタンダードを用いることで、シグナルの積分値から未知試料の濃度換算ができるので、その定量性のダイナミックレンジを検証した。3)オンライン分析法のトリプル四重極質量分析計による多重反応モニタリング法(Multiple Reaction Monitoring, MRM)により、極微量化(~フェムトモル)スケールでの確度保証を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

基礎調査の成果公表とともにプレスリリースを行い、社会的な反響がそれなりに大きかった。

[注釈]Covid-19の影響でフィールド調査(越県および入域の制約)および室内実験(化学分析・質量分析など)の予定変更を余儀なくされたため、一部の研究成果について、2021-2022年の間で連続的な調査研究を行っています。

Strategy for Future Research Activity

未発表の内容について、成果を論文にまとめる。

  • Research Products

    (7 results)

All 2021

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Detection of planktonic coenzyme factor 430 in a freshwater lake: small-scale analysis for probing archaeal methanogenesis2021

    • Author(s)
      Urai Atsushi、Matsushita Makoto、Park Ho-Dong、Imachi Hiroyuki、Ogawara Miyuki、Iwata Hiroki、Kaneko Masanori、Ogawa Nanako O.、Ohkouchi Naohiko、Takano Yoshinori
    • Journal Title

      Progress in Earth and Planetary Science

      Volume: 8 Pages: 62

    • DOI

      10.1186/s40645-021-00450-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Insights into the Methanogenic Population and Potential in Subsurface Marine Sediments Based on Coenzyme F430 as a Function-Specific Biomarker2021

    • Author(s)
      Kaneko Masanori、Takano Yoshinori、Kamo Masashi、Morimoto Kazuya、Nunoura Takuro、Ohkouchi Naohiko
    • Journal Title

      JACS Au

      Volume: 1 Pages: 1743~1751

    • DOI

      10.1021/jacsau.1c00307

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 補酵素F430を経由するメタン生成とメタン酸化の多次元炭素同位体フィンガープリント法の展開2021

    • Author(s)
      高野 淑識, 浦井 暖史, 金子 雅紀, 大河内 直彦
    • Journal Title

      日本アイソトープ協会誌 Isotope News

      Volume: 778 Pages: 36-40

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 15Nに富むアミノ酸の分子レベル安定窒素同位体比測定における分析精度の検証2021

    • Author(s)
      菅原 春菜・高野 淑識・滝沢 侑子・力石 嘉人
    • Organizer
      日本有機地球化学会
  • [Presentation] Assessing the irradiation effects by a synchrotron X-ray micro-computed tomography on the organic materials in carbonaceous chondrite: Examination at Spring-8 facility2021

    • Author(s)
      Haruna Sugahara, Yoshinori Takano, Toshihiro Yoshimura, Nanako O. Ogawa, Naohiko Ohkouchi, Masayuki Uesugi, Akira Tsuchiyama
    • Organizer
      Japan Geoscience Union Meeting 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Recent development of seamless procedures on wet chemistry, cation-exchange chromatography and ion-pair chromatography with high-precision mass spectrometry for short-chain peptide molecules.2021

    • Author(s)
      Yoshinori Takano, Yasuhiro Oba, and Naohiko Ohkouchi
    • Organizer
      Japan Geoscience Union Meeting 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sub-microgram sulfur isotope analysis for the biological, geological, and extraterrestrial samples by sensitivity-improved EA/IRMS2021

    • Author(s)
      Nanako O. Ogawa, Toshihiro Yoshimura, Takeru Kochi, Junichiro Kuroda, Yoshinori Takano, Naohiko Ohkouchi
    • Organizer
      Japan Geoscience Union Meeting 2021
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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