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2022 Fiscal Year Annual Research Report

動作中のミトコンドリア膜透過装置TOM複合体を通過する前駆体タンパク質の動態解析

Research Project

Project/Area Number 20H02583
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

荒磯 裕平  金沢大学, 保健学系, 助教 (20753726)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsミトコンドリア / タンパク質輸送 / TOM複合体 / 高速原子間力顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

界面活性剤を含む溶液中のTOM複合体のダイナミクスを高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)によって解析した。試料精製・観察条件の最適化をさらに進め、TOM複合体粒子を再現性良く観察することが可能となった。その結果、精製TOM複合体粒子は均一な3量体構造をとっているが、観察を続けていく中で2量体と単量体に容易に解離することが明らかになった。ここで得られた3量体、2量体のHS-AFM像は、3量体のモデル構造、2量体のクライオ電顕構造から生成した予測AFM像とよく一致することも示され、TOM複合体の3量体と2量体の関係性が明らかとなった。これらの結果より、TOM複合体はミトコンドリア膜上で3量体として機能するが、等価な3つの単量体が集合しているのではなく、安定な2量体コア構造に不安定な単量体が結合した(2+1)型の3量体構造をとっていることが考察できる。さらに、TOM複合体によるタンパク質の認識・取り込み機構を解析するためTOM複合体に基質タンパク質を添加し、HS-AFMによって分子動態を観察した。モデル基質にはATP合成酵素由来のミトコンドリア行きシグナル配列(pSu9)を持つ人工基質タンパク質(pSu9-DHFR)を用いた。観察中のTOM複合体にpSu9-DHFRを添加したところ、pSu9-DHFRが3量体、及び2量体のTOM複合体粒子に相互作用する様子をリアルタイムで可視化することに成功した。現在は、任意のHS-AFMデータにおいてTOM複合体とpSu9-DHFRの位置情報を数値化し、TOM複合体における基質タンパク質結合部位の同定を試みている。解析が順調に進めば、3量体TOM複合体の基質認識部位が明らかとなり、ミトコンドリアタンパク質輸送の新規分子メカニズムの解明が期待できる。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural overview of the translocase of the mitochondrial outer membrane complex2022

    • Author(s)
      Araiso Yuhei、Endo Toshiya
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 19 Pages: n/a~n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0022

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体の構造とダイナミクス2023

    • Author(s)
      荒磯裕平、小林菜々子、Romain Amyot、九笹加菜、今井大達、川合志朋、今井賢一郎、 稲津明広、古寺哲幸、遠藤斗志也
    • Organizer
      令和4年度生物物理学会中部支部講演会(名古屋)
  • [Presentation] ミトコンドリア膜透過装置TOM複合体の高速原子間力顕微鏡解析2022

    • Author(s)
      小林菜々子、九笹加菜、今井大達、川合志朋、槙野愛実、稲津明広、古寺哲幸、遠藤斗志也、荒磯裕平
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会(千葉)
  • [Presentation] High-speed atomic force microscopy analysis of the mitochondrial import gate TOM complex2022

    • Author(s)
      荒磯裕平、九笹加菜、小林菜々子、今井大達、槙野愛実、稲津明広、古寺哲幸、遠藤斗志也
    • Organizer
      第60回 日本生物物理学会年会(函館)
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によって明らかになったミトコンドリアタンパク質搬入ゲート TOM複合体の構造とダイナミクス2022

    • Author(s)
      九笹加菜、小林菜々子、今井大達、槙野愛実、稲津明広、古寺哲幸、遠藤斗志也、荒磯裕平
    • Organizer
      第22回日本蛋白質科学会年会(筑波)
  • [Presentation] ミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体の構造とダイナミクス2022

    • Author(s)
      荒磯裕平
    • Organizer
      日本生化学会北陸支部会 第40回大会(富山)
    • Invited
  • [Remarks] 金沢大学 研究者情報

    • URL

      https://ridb.kanazawa-u.ac.jp/public/detail.php?id=4773

URL: 

Published: 2023-12-25  

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