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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Visualizing protein motions using molecular photoswitching

Research Project

Project/Area Number 20H02695
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

水野 操  大阪大学, 理学研究科, 助教 (10464257)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywordsタンパク質ダイナミクス / 分子光スイッチング / 時間分解紫外共鳴ラマン分光法
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質の機能は、外部刺激による構造変化により生み出される。タンパク質機能を生み出す過渡的な分子運動の観測には、反応のタイミングが同期した分子アンサンブルのスペクトルを計測し、時間的精度が高い良質なスペクトルを得る必要である。これに対して、光による反応タイミング制御がきわめて有効である。実際に、光受容タンパク質では光が外部刺激として構造変化を誘発するため、反応中間体の構造研究が多く行われている。一方、多くのタンパク質では、機能発現スイッチに光が利用されることはなく、時間的精度が高いダイナミクス観測が困難であった。
本研究では、機能発現スイッチとして光反応により分子長や電荷分布が変化する小分子をタンパク質に導入し、反応タイミングの同期を行う(分子光スイッチング)。光によって誘起したタンパク質構造変化のダイナミクスを、芳香族アミノ酸残基および主鎖に由来するラマンバンドをプローブとして、時間分解紫外共鳴ラマン分光法により観測する。これにより、原子レベルの空間スケールかつピコ秒からサブ秒までの幅広い時間スケールで、機能発現に関わる構造ダイナミクスを観測する手法を確立する。
本年度は、分光測定の実施に必要な大量の精製タンパク質試料を得るため、光スイッチングを行うアゾベンゼンやスピロピランを導入したタンパク質試料調製方法を検討した。これと並行して、異なる波長の吸収帯をもつ多様なスイッチング分子の光反応に応用できるように、新たな光源を導入し既存の分光システムを改良した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

分光測定を行うには、大量の精製タンパク質試料が必要なため、光スイッチングを行うアゾベンゼンやスピロピランを導入したタンパク質試料の調製方法の確立に時間を要している。このためタンパク質ダイナミクス観測を行うまで研究を推進できなかった。
一方、異なる波長の吸収帯をもつ多様なスイッチング分子の光反応へ応用できるように分光システムを改良した。

Strategy for Future Research Activity

研究対象となる光スイッチングタンパク質(分子認識・分子ゲート・基質結合アロステリック制御)試料の調製方法を引き続き検討し確立する。
スペクトル計測を行うための分光システムはすでに稼働しているため、これを用いて光スイッチングタンパク質のダイナミクス観測を行い、それらの機能発現における分子機構を解明する。

  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] High Suitability of Tryptophan Residues as a Spectroscopic Thermometer for Local Temperature in Proteins under Nonequilibrium Conditions2022

    • Author(s)
      Satoshi Yamashita, Misao Mizuno, Yasuhisa Mizutani
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 156 Pages: 075101

    • DOI

      10.1063/5.0079797

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Resonance Raman Determination of Chromophore Structures of Heliorhodopsin Photointermediates2021

    • Author(s)
      Taito Urui, Misao Mizuno, Akihiro Otomo, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 125 Pages: 7155-7162

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c04010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strongly hydrogen-bonded Schiff base and adjoining polyene twisting in the retinal chromophore of schizorhodopsins2021

    • Author(s)
      Tomomi Shionoya, Misao Mizuno, Manish Singh, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 60 Pages: 3050-3057

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.1c00529

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Time-resolved Resonance Raman Observation of Quaternary Structural Changes of Dimeric Hemoglobin2022

    • Author(s)
      Xiang Gao, Misao Mizuno, Haruto Ishikawa, Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      日本化学会第102春季年会
  • [Presentation] Time-resolved resonance Raman observation of the chromophore structure in primary intermediates of microbial rhodopsins2022

    • Author(s)
      Zixuan Li, Misao Mizuno, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      日本化学会第102春季年会
  • [Presentation] 共鳴ラマン分光法による祖先型グロビンフォールドタンパク質のヘム-軸配位子構造の解明2022

    • Author(s)
      入谷 悠、石川 春人、水野 操、水谷 泰久
    • Organizer
      日本化学会第102春季年会
  • [Presentation] 内向きプロトンポンプシゾロドプシンにみられる複数のM中間体の発色団構造解析2022

    • Author(s)
      林 航平、水野 操、神取 秀樹、水谷 泰久
    • Organizer
      日本化学会第102春季年会
  • [Presentation] Characterization of the chromophore structure in the photocycle of a new type of chloride ion-pumping rhodopsin2021

    • Author(s)
      Misao Mizuno, Naito Ishimoto, Sam-Yong Park, Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      Twentieth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Interaction between retinal chromophore and opsin to enable proton transport in a light-driven proton pump GR2021

    • Author(s)
      Tomomi Shionoya, Misao Mizuno, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      Twentieth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Resonance Raman Determination of Chromophore Structures of Heliorhodopsin Photointermediates2021

    • Author(s)
      Taito Urui, Misao Mizuno, Akihiro Otomo, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      Twentieth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 新規光駆動塩化物イオンポンプの光反応中間体の発色団構造解析2021

    • Author(s)
      水野操、石本 直偉士、朴 三用、水谷 泰久
    • Organizer
      第15回分子科学討論会
  • [Presentation] レチナールアナログ置換によるヘリオロドプシン発色団の構造特異性の解明2021

    • Author(s)
      潤井 泰斗、水野 操、水谷 泰久
    • Organizer
      第15回分子科学討論会
  • [Presentation] Role of atomic contacts in vibrational energy transfer in protein2021

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Organizer
      Pacifichem2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 大阪大学大学院理学研究科化学専攻生物物理化学研究室

    • URL

      http://www.chem.sci.osaka-u.ac.jp/lab/mizutani/index-jp.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

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