• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

Visualizing protein motions using molecular photoswitching

Research Project

Project/Area Number 20H02695
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

水野 操  京都大学, 理学研究科, 准教授 (10464257)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords時間分解共鳴ラマン分光法 / タンパク質ダイナミクス / 分子光スイッチング
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質の機能は、外部刺激による構造変化により生み出される。タンパク質機能を生み出す過渡的な分子運動の観測には、反応のタイミングが同期した分子アンサンブルのスペクトルを計測し、時間的精度が高い良質なスペクトルを得る必要がある。これに対して、光による反応タイミングの制御はきわめて有効である。実際に、光受容タンパク質では光が外部刺激として構造変化を誘発するため、反応中間体の構造研究が多く行われている。一方、多くのタンパク質では、機能発現スイッチに光が利用されることはなく、時間的精度が高いダイナミクス観測が困難であった。本研究では、機能発現スイッチとして光反応により分子長や電荷分布が変化する小分子をタンパク質に導入し、反応タイミングの同期(分子光スイッチング)によるタンパク質構造ダイナミクスを、時間分解共鳴ラマン分光法により観測することで、タンパク質機能発現に関わる構造ダイナミクスを観測する手法を確立することを目指した。
本年度は前年度から継続して、光スイッチングを行うアゾベンゼンやスピロピランを導入した光スイッチングタンパク質試料作製し、タンパク質ダイナミクス観測研究の推進を図ったが、分光測定に必要な試料を十分に得ることができなかった。一方、本研究ではこれまでに、新しい時間分解ラマン分光システムの開発に成功しており、分子光スイッチングを用いたタンパク質ダイナミクス観測法の確立による広範なタンパク質の機能発現機構の解明を継続して目指していく。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Cis-Trans Reisomerization Preceding Reprotonation of the Retinal Chromophore Is Common to the Schizorhodopsin Family: A Simple and Rational Mechanism for Inward Proton Pumping2024

    • Author(s)
      Urui Taito、Hayashi Kouhei、Mizuno Misao、Inoue Keiichi、Kandori Hideki、Mizutani Yasuhisa
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 128 Pages: 744~754

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c07510

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unique Vibrational Characteristics and Structures of the Photoexcited Retinal Chromophore in Ion-Pumping Rhodopsins2023

    • Author(s)
      Li Zixuan、Mizuno Misao、Ejiri Tomo、Hayashi Shigehiko、Kandori Hideki、Mizutani Yasuhisa
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 127 Pages: 9873~9886

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c02146

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heme Pocket Structure and Its Functional Implications in an Ancestral Globin Protein2023

    • Author(s)
      Iritani Yu、Ishikawa Haruto、Mizuno Misao、Mizutani Yasuhisa
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 62 Pages: 2727~2737

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.3c00203

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 時間分解共鳴ラマン分光法によるイオンポンプロドプシンの構造ダイナミクス観測2023

    • Author(s)
      水野 操
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Observing of structural changes critical to the functioning of ion-pumping rhodopsins2023

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Organizer
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems (9IDMRCS)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 時間分解アンチストークスラマン分光法によるタンパク質分子内振動エネルギー移動の観測2023

    • Author(s)
      水野 操
    • Organizer
      第23回日本光生物学協会年会
    • Invited
  • [Presentation] Unique vibrational characters and structures of the photoexcited retinal chromophore in ion-pumping rhodopsins2023

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Organizer
      8th Asian Spectroscopy Conference (ASC2023)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Spatiotemporal mapping of vibrational energy flow in proteins2023

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Invited
  • [Remarks] 京都大学大学院理学研究科化学専攻 量子化学分科 水野グループ

    • URL

      https://sites.google.com/kyoto-u.ac.jp/kuchem-mizuno/

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi