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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Development of topology-selective light-up G4 ligand

Research Project

Project/Area Number 20H02876
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

長澤 和夫  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (10247223)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsグアニン四重鎖 / ライトアップ型プローブ / G4リガンド / G4トポロジー
Outline of Annual Research Achievements

グアニン残基を豊富に含む核酸の1本鎖配列で、核酸の高次構造の一つであるグアニン四重鎖 (G4) 構造が動的に形成されると考えられている。近年G4が形成されることで、DNA の複製、遺伝子の転写調節などの生命現象が、直接的に制御する例が、多数報告されている(in vitro)。しかしG4は、生細胞内の「どこで」「いつ」形成されるのか、また複製や転写等の生命現象との直接的な関連は明らかにされていない。これらの課題に対し本研究では、生細胞内で動的に形成されるG4を可視化し観察するためのツールとして、ライトアップ型G4リガンドの創製を目的とした。特にG4に特有な3つの各トポロジー(アンチパラレル、パラレル、ハイブリッド)を区別しながらG4の動的形成を可視化することを目的とした。
昨年までに、これまで研究室で開発してきた、G4と特異的かつ強力に相互作用する大環状ポリオキキサゾール型G4リガンドである6OTDにライトアップ機能を有する官能基を導入し、加えて側鎖構造に着目した構造展開を行うことで、トポロジー選択的なライトアップ型G4リガンド創製のための基本戦略を構築した。一方当該リガンドは、G4との相互作用が極めて強力なため、動的なG4の形成を観察するために課題があることがわかった。そこで今年度は、これまでの六つのオキサゾールを持つリガンドに代わり、そこで6OTDよりG4との相互作用が弱い三つのオキサゾールを有する鎖状3OTD化合物を用いこれにビニルナフチル誘導体を導入した新規プローブを合成した。3OTDについて評価を行ったところ、トポロジー選択的なライトアップ機能を有し、かつ相補鎖を加えた際、その蛍光が短時間で消失することがわかった。これよりG4からランダム構造への過程を観察することが可能となった。本研究により生細胞中での動的G4の形成と崩壊観察のための基盤を構築することができた。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Regulation of thrombin activity by ligand-induced topological alteration in a thrombin-binding aptamer2023

    • Author(s)
      Sasaki Shogo、Ma Yue、Hirokawa Takatsugu、Ikebukuro Kazunori、Tera Masayuki、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 59 Pages: 8862~8865

    • DOI

      10.1039/D3CC02308G

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] クリックケミストリーを用いたトポロジー選択的なG4リガンドの合成研究2024

    • Author(s)
      島澤優莉,佐々木捷悟,馬悦,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      日本化学会 第104春季年会
  • [Presentation] グアニン四重鎖のトポロジー選択的かつ動的な検出を目的としたライトアップ型蛍光リガンドの創製2024

    • Author(s)
      藤田春希,綿谷成恭,佐々木捷悟,馬悦,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      日本化学会 第104春季年会
  • [Presentation] 大環状ヘキサオキサゾール型G4リガンド類による液滴内での化学反応評価2024

    • Author(s)
      大山 彩,佐々木捷悟,三好大輔,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      日本化学会 第104春季年会
  • [Presentation] G4-PROTAC リガンドによる細胞内グアニン四重鎖結合タンパク質の分解2024

    • Author(s)
      野原玲奈,棚谷優磨,馬悦,長澤和夫,寺正行
    • Organizer
      日本化学会 第104春季年会
  • [Presentation] グアニン四重鎖-タンパク質間を連結するリガンドの合成2023

    • Author(s)
      指田万奈帆,笹沼博之,正井久雄,長澤和夫,寺正行
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会
  • [Presentation] トリオキサゾールを母骨格としたturn-on型蛍光リガンドの合成および種々G4に対する蛍光特性の比較2023

    • Author(s)
      藤田春希,綿谷成恭,佐々木捷悟,馬悦,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会
  • [Presentation] グアニン四重鎖の構造特異的な検出を目的とした新規蛍光リガンドの開発2023

    • Author(s)
      藤田春希,綿谷成恭,佐々木捷悟,馬悦,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      先端モデル動物支援プラットフォーム 若手支援技術講習会
  • [Presentation] グアニジウム/次亜ヨウ素酸塩触媒を用いたオキシインドール類の3位アリール化反応の開発2023

    • Author(s)
      清水祐汰,森偉央,小田木陽,長澤和夫
    • Organizer
      第16回 有機触媒シンポジウム
  • [Presentation] グアニン四重鎖特異的なタンパク質リクルート法の開発2023

    • Author(s)
      指田万奈帆,寺正行、長澤和夫、笹沼博之、正井久雄
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会
  • [Presentation] 新規ライトアップ型G4リガンドの合成とトポロジー選択性の評価2023

    • Author(s)
      藤田春希,綿谷成恭,佐々木捷悟,馬悦,寺正行,長澤和夫
    • Organizer
      有機合成化学協会 第85回関東支部シンポジウム
  • [Presentation] Development of PROTAC ligands for G-quadruplex binding proteins2023

    • Author(s)
      RenaNohara,YuumaTanaya.YueMa,KazuoNagasawa,MasayukiTera
    • Organizer
      第50回国際核酸化学シンポジウム
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2024-12-25  

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