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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Creation of microbial cells as the innovative chassis for isoprenoid production

Research Project

Project/Area Number 20H02899
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

邊見 久  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (60302189)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 海野 英昭  長崎大学, 工学研究科, 准教授 (10452872)
伊藤 智和  名古屋大学, 生命農学研究科, 講師 (90584970)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsイソプレノイド / 大腸菌 / メバロン酸経路 / 古細菌
Outline of Annual Research Achievements

イソプレノイドは自然界最大の天然化合物群であり、その中には膨大な数の有用物質が含まれる。これまでに、微生物による有用イソプレノイ ドの発酵生産を高効率化する目的で、その前駆体供給経路であるメバロン酸経路を使った代謝工学的な試みがなされてきた。しかし、微生物に対するそれらの代謝経路のエネルギー負荷は大きく、生産量の向上には限界があった。そこで本研究では、申請者らが古細菌から見出した、ATP消費量の少ない「低エネルギー負荷型」の代謝経路である古細菌型メバロン酸経路を大腸菌に導入し、イソプレノイド生産のシャーシ(土台)として広範な目的に利用可能な微生物株の作製を目指した。揮発性セスキテルペンであるファルネセンの合成経路を大腸菌に組み込んでイソプレノイド生産微生物のモデルとし、そこに古細菌型メバロン酸経路と、比較対象として過去に実績のある真核生物型メバロン酸経路を導入した。プロモーターの導入など、複数段階の改善作業を行った結果、古細菌型経路の導入によるファルネセン生産の大幅な向上が達成できた。特に、ファルネセンを捕集するために有機溶媒を重層した、酸素供給が不十分な培養条件において、古細菌型経路が真核生物型経路と同等の効果を発揮したことは重要な発見であった。
また、古細菌型メバロン酸経路に特異的に含まれる複数の酵素について研究を進めた。特にホスホメバロン酸脱水酵素(PMDh)については、活性部位における4Fe-4S型鉄硫黄クラスターの存在を証明し、酸素による同クラスターの分解が、PMDh、ひいては古細菌型メバロン酸経路の酸素感受性の原因となっていることを明らかにした。また、同経路で必要とされるプレニル化FMNという補酵素について、その生合成に関わる酵素を明らかにし、それらの酵素学的な解析を行うなど、古細菌型メバロン酸経路に関する理解を深めることに成功した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California Los Angeles(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California Los Angeles
  • [Journal Article] d‐amino acid auxotrophic Escherichia coli strain for in vivo functional cloning of novel d‐amino acid synthetic enzyme2023

    • Author(s)
      Ito Tomokazu、Muto Natsumi、Sakagami Haruna、Tanaka Miho、Hemmi Hisashi、Yoshimura Tohru
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 290 Pages: -

    • DOI

      10.1111/febs.16734

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A [4Fe-4S] cluster resides at the active center of phosphomevalonate dehydratase, a key enzyme in the archaeal modified mevalonate pathway2023

    • Author(s)
      Komeyama Mutsumi、Kanno Kohsuke、Mino Hiroyuki、Yasuno Yoko、Shinada Tetsuro、Ito Tomokazu、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 14 Pages: 1150353

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1150353

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of mevalonate 3,5-bisphosphate decarboxylase reveals insight into the evolution of decarboxylases in the mevalonate metabolic pathways2022

    • Author(s)
      Aoki Mizuki、Vinokur Jeffrey、Motoyama Kento、Ishikawa Rino、Collazo Michael、Cascio Duilio、Sawaya Michael R.、Ito Tomokazu、Bowie James U.、Hemmi Hisashi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102111~102111

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102111

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 低酸素条件におけるイソプレノイド生産を強化する古細菌型メバロン酸経路2023

    • Author(s)
      高橋拓矢、伊藤智和、邊見 久
    • Organizer
      2023年度日本農芸化学会大会
  • [Presentation] 大腸菌における新奇フォリルポリ-α-グルタミン酸合成酵素の同定と機能解析2023

    • Author(s)
      小瀬有里奈、邊見久、伊藤智和
    • Organizer
      2023年度日本農芸化学会大会
  • [Presentation] アーキア型メバロン酸経路を用いた大腸菌のイソプレノイド生産能強化2022

    • Author(s)
      高橋拓矢、吉田 稜、伊藤智和、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      2022年度日本農芸化学会大会
  • [Presentation] カイコセリンラセマーゼの同定と酵素学的性質の解析2022

    • Author(s)
      田中優衣、伊藤智和、邊見 久、吉村 徹
    • Organizer
      2022年度日本農芸化学会大会
  • [Presentation] Escherichia coliにおけるピリドキシン5’-リン酸の脱リン酸化酵素の同定2022

    • Author(s)
      松尾ひなの、邊見 久、吉村 徹、伊藤智和
    • Organizer
      日本ビタミン学会第74回大会
  • [Presentation] Picrophilus torridus由来3,5-ビスホスホメバロン酸デカルボキシラーゼにおける奇妙な活性制御2022

    • Author(s)
      邊見 久、青木瑞希、本山賢人、石川りの、伊藤智和
    • Organizer
      日本Archaea研究会第34回講演会
  • [Presentation] 超好熱性古細菌Aeropyrum pernix由来ホスホメバロン酸脱水酵素の鉄硫黄クラスターに関する研究2022

    • Author(s)
      菅野航佑、米山 睦、三野広幸、品田哲郎、保野陽子、伊藤智和、吉村 徹、邊見 久
    • Organizer
      第30回イソプレノイド研究会例会
  • [Presentation] Production of archaeal membrane lipids in bacterial cells to overcome lipid divide and engineer a membrane2022

    • Author(s)
      Hisashi Hemmi
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] ゲラニルゲラニル二リン酸による3,5-ビスホスホメバロン酸デカルボキシラーゼの活性制御2022

    • Author(s)
      石川りの、青木瑞希、本山賢人、伊藤智和、邊見 久
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] Escherichia coli におけるビタミンB6発酵生産法の開発2022

    • Author(s)
      松尾ひなの,邊見久,吉村徹,伊藤智和
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 乳酸菌のD-アミノ酸トランスポーターの同定と性状解析2022

    • Author(s)
      青木浩一郎,邊見久,伊藤智和
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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