• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

作物根圏におけるウイルス叢の多様性とその感染動態から紐解く生態的意義

Research Project

Project/Area Number 20H02987
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

近藤 秀樹  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (40263628)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 久野 裕  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (70415454)
鈴木 信弘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (70206514)
兵頭 究  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (80757881)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords作物 / 根圏 / ウイルス / リザーバ / 水平伝搬
Outline of Annual Research Achievements

本課題ではムギ類生存圏(特に根圏)におけるウイルス叢の多様性・普遍性や動態、それらの未知なる生態学的役割の一端を紐解くことを目指している。以下に本年度の研究実績を示す。
柱①ムギ類生存圏のウイルス叢探索と解読:ムギ類の地上部・根系、アブラムシ・うどんこ病菌などのサンプルを用い、引き続きRNA-seqデータの取得を進めた。当該年度のウイルス配列マイニングをほぼ完了しており、オオムギ葉圏、根圏のウイルス叢の普遍性や多様性の一端が紐解かれつつある。なお、一連の解析により、コムギの黄葉症状を示す個体より新規植物クロステロウイルスを見出し、論文として成果報告を行った。
柱②ムギ類生存圏の生物界を跨ぐウイルス水平伝搬の探索・評価:ムギ類の葉圏や根圏に存在する糸状菌類を取得するため、人工合成培地上での分離を進めた。得られた糸状菌系統については、2本鎖RNAをマーカとしたウイルス感染株のスクリーニングを進めた。また、並行して一部の糸状菌株ではRNA-seq 解析を進め、ウイルス配列を取得している。本解析では糸状菌株から植物ウイルスは検出されなかったが、複数の菌類RNAウイルス(新規ウイルスあるいは既存ウイルスの系統)の配列取得に成功している。また、国際共同研究により、圃場作物(野菜・果樹類)における植物ウイルス・ウイロイドの糸状菌類への水平伝搬に関する知見を得た。
柱③ムギ類ウイルスの年次変動と病原性の(再)評価:ムギ類の新規クロステロウイルスについては、ムギクビレアブラムシによる伝搬性の証明や宿主に蓄積するウイルス由来低分子RNA(siRNA)の解析を進めた。しかし、圃場で確認されたコムギの黄葉症状は実験室内で再現できておらず、現在も継続試験中である。簡易ウイルス遺伝子診断法で倉敷圃場におけるウイルスの発生状況を調査し、4月後半にはアブラムシ媒介性ポレロウイルスの感染を複数個体で確認した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Qingdao Agricultural University/Northwest A&F University(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Qingdao Agricultural University/Northwest A&F University
  • [Int'l Joint Research] Swiss Federal Research Institute WSL(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      Swiss Federal Research Institute WSL
  • [Int'l Joint Research] Mendel University(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      Mendel University
  • [Int'l Joint Research] The University of Queensland(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      The University of Queensland
  • [Journal Article] Discovery and genomic characterizations of a closterovirus from wheat plants with yellowing leaf symptoms in Japan2023

    • Author(s)
      Kondo H, Sugahara H, Fujita M, Hyodo K, Andika IB, Hisano H, Suzuki N.
    • Journal Title

      Pathogens

      Volume: 12 Pages: 358

    • DOI

      10.3390/pathogens12030358

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Common but nonpersistent acquisitions of plant viruses by plant-associated fungi2022

    • Author(s)
      Cao X, Liu J, Pang J, Kondo H, Chi S, Zhang J, Sun L, Andika IB
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 14 Pages: 2279

    • DOI

      10.3390/v14102279

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nature cross-kingdom spred of apple scar skin viroid from apple plants to fungi2022

    • Author(s)
      Tian M, Wei S, Bian R, Luo J, Khan HA, Tai H, Kondo H, Hadidi A, Andika IB, Sun L
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 3686

    • DOI

      10.3390/cells11223686

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mycovirus diversity and evolution revealed/inferred from recent studies2022

    • Author(s)
      Kondo, H., Botella, L., Suzuki N.
    • Journal Title

      Annual Review of Phytopathology

      Volume: 60 Pages: 307-336

    • DOI

      10.1146/annurev-phyto-021621-122122

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ICTV Virus Taxonomy Profile: Rhabdoviridae2022

    • Author(s)
      Walker PJ (Kondo, H) et a.l
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 103 Pages: 001689

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001689

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cross-kingdom viral infection in agroecosystems.2023

    • Author(s)
      Kondo, H.
    • Organizer
      38th IPSR International Symposium and 14th Symposium on Plant Stress Sciences. Kurashiki, Japan
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Novel, diverse RNA viruses in the Japanese population of the ash dieback fungus, Hymenoscyphus fraxineus2022

    • Author(s)
      Shamsi, W., Kondo, H., Rigling, D., Prospero, S
    • Organizer
      5th mycovirus symposium, Gargnano, Italy, May 30-June 2, 2022.
    • Int'l Joint Research
  • [Book] The border between kitavirids and nege-like viruses: Tracking the evolutionary pace of plant- and arthropod-infecting viruses2022

    • Author(s)
      Ramos-Gonzlez, P.L., Kondo, H., Morozov, S., Vasilakis, N., Varsani, A., Cao, M. and Freitas-Astua, J.(Eds.)
    • Total Pages
      778
    • Publisher
      Frontiers in Plant Science (ISBN 978-2-88976-368-9)
  • [Remarks] 岡山大学資源植物科学研究所 植物・微生物相互作用グループ

    • URL

      http://www.rib.okayama-u.ac.jp/pmi/index-j.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi