2022 Fiscal Year Annual Research Report
Survival and extinction of subalpine trees since the last glacial, reconstructed by fossil derived DNAs
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20H03020
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
渡辺 洋一 千葉大学, 大学院園芸学研究院, 助教 (30763651)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
百原 新 千葉大学, 大学院園芸学研究院, 教授 (00250150)
陶山 佳久 東北大学, 農学研究科, 教授 (60282315)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 植物化石 / 大型植物遺体 / 古DNA / ancient DNA / 分布変遷 / 系統地理 / 古植生 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生物の分布は中長期的な気候の変動を受けて変化（移動）しつづけている。至近に生じた気候の大きな変化としては約2万年前の最終氷期最寒冷期があげられ、この時期には関東平野にカラマツやトウヒなどの亜寒帯性針葉樹が生育していた。本年度は、古分布変遷が現生集団にどのように影響しているのか、種間交雑に着目して検証を行った。日本固有種の亜寒帯性針葉樹であるカラマツは、最終氷期には低地に広く分布していた。加えてこの時期には近縁種であるグイマツも北方より分布を広げ現在の山形県・宮城県あたりまで南下していたことが化石記録より確認されている。この地域は現在のカラマツ北限であるがこの地域のカラマツは球果形態が他と異なることが知られている。この変異の原因として、過去の2種の分布接触に伴い交雑が生じていたのではないかという仮説が提唱されているが、確証には至っていない。
そこで、本年度は化石記録の整理を行い、最終氷期におけるグイマツの南限とカラマツの北限を検証すると共に、ロシア・日本よりカラマツ・グイマツおよびその近縁種のサンプルを収集して遺伝解析を行った。RAD-seqを用いた遺伝実験はすべて終了した。カラマツを含む針葉樹はゲノムサイズが長大でその中に多くの反復配列を含むため、そのデータ解析は難航している。カラマツの高精度なゲノム配列が順次更新されているため、それを用いて反復配列の検出・除去を行い、残ったゲノム配列中での変異の検出を目指している。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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