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2021 Fiscal Year Annual Research Report

リグニンの多様性と可変性:組換え植物で探る木質の機能と利用へのインパクト

Research Project

Project/Area Number 20H03044
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

飛松 裕基  京都大学, 生存圏研究所, 准教授 (20734221)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 堀 千明  北海道大学, 工学研究院, 助教 (50722948)
久住 亮介  京都大学, 農学研究科, 助教 (70546530)
梅澤 俊明  京都大学, 生存圏研究所, 教授 (80151926)
今井 友也  京都大学, 生存圏研究所, 教授 (90509142)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsリグニン / 細胞壁 / リグノセルロース
Outline of Annual Research Achievements

複雑多様なリグニンの分子構造は、維管束植物の進化・環境適応と密接に関係する木質細胞壁の本質的特徴であると同時に、脱炭素社会構築 を担う木質バイオマス利用の重要阻害要因でもある。しかし、リグニンの分子構造と木質細胞壁の生理機能・超分子構造 ・ 各種バイオマス利用特性の関係性の理解は未だ著しく欠落している。本研究では、木質の構造と特性に及ぼすリグニンの寄与を体系的に明らかにすることを目的とし、リグニンの量・構造を系統的に変化させたリグニン改変組換え植物を作出し、その細胞壁の化学構造・超分子構造・各種特性を体系的に調べ、改変されたリグニンの量・構造との関係性を明らかにする。2021年度は、リグニン及びリグニン-多糖間の架橋に寄与する細胞壁結合型フェルラ酸の形成に寄与する遺伝子群をバイオインフォマティクス解析及び遺伝子発現解析により選定し、それらを標的としたゲノム編集により、リグニン及び細胞壁結合型フェルラ酸改変したイネ変異株の作出に成功した。またこれまでに同定したリグニン生合成遺伝子のうち複数を標的としたゲノム編集により、リグニン中の複数のサブストラクチャーを欠失した多重変異株の作成にも成功した。得られたゲノム編集イネ株の細胞壁の化学構造を各種化学分析及び2D NMR解析により明らかにした。また、種々の植物種におけるリグニン生合成機構の解明、代謝工学、生物分解等を目的とする共同研究において、リグニン構造解析やイメージング解析の実験も行った。これらの成果の一部を纏め、論文発表及び学会発表を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画以上に、多数のリグニン及び細胞壁結合型フェルラ酸改変イネ株(4CL、C4H、ALDH、PMT、各種トリシン生合成酵素ノックアウトイネ)の作出に成功し、過去に作出したリグニン改変組換えイネと共に、細胞壁の化学構造及び超分子構造の解析を進めることができた。得られた成果を纏め2件の論文発表を行った。また、種々の植物種におけるリグニン生合成機構の解明、代謝工学、生物分解等を目的とする共同研究において、リグニン構造解析やイメージング解析の実験で貢献し、3件の共著論文発表も行った。以上のことから、本課題は、当初の計画以上に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度は、これまでに作成したリグニン及び細胞壁結合型フェルラ酸改変イネ株の細胞壁性状解析を中心に進める予定である。とりわけ、固体NMR及びX線を用いた細胞壁の固体高次構造の比較評価を進め、細胞壁超分子構造に及ぼすリグニン及び細胞壁結合型フェルラ酸の寄与の詳細を明らかにする。各種固体NMR及びX線法を用いた細胞壁の固体高次構造評価については、令和2年度までに予備実験を済ませており、問題なく実行できると考えている。

  • Research Products

    (22 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ウィスコンシン大学/ワシントン州立大学/ブルックヘブン国立研究所(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ウィスコンシン大学/ワシントン州立大学/ブルックヘブン国立研究所
  • [Int'l Joint Research] 香港大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      香港大学
  • [Int'l Joint Research] 高等科学研究院(CSIC)(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      高等科学研究院(CSIC)
  • [Int'l Joint Research] 国立研究革新庁(BRIN)(インドネシア)

    • Country Name
      INDONESIA
    • Counterpart Institution
      国立研究革新庁(BRIN)
  • [Int'l Joint Research] 国立農業・食料・環境研究所(INRAE)(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      国立農業・食料・環境研究所(INRAE)
  • [Journal Article] Structural basis of lignocellulose deconstruction by the wood-feeding anobiid beetle Nicobium hirtum2022

    • Author(s)
      Krishanti Ni Putu Ratna Ayu、Tobimatsu Yuki、Miyamoto Takuji、Fujimoto Izumi、Kartika Titik、Umezawa Toshiaki、Hata Toshimitsu、Yoshimura Tsuyoshi
    • Journal Title

      Journal of Wood Science

      Volume: 68 Pages: 10

    • DOI

      10.1186/s10086-022-02017-6

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Tricin Biosynthesis and Bioengineering2021

    • Author(s)
      Lam Pui Ying、Lui Andy C. W.、Wang Lanxiang、Liu Hongjia、Umezawa Toshiaki、Tobimatsu Yuki、Lo Clive
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 12 Pages: 733198

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.733198

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Monolignol acyltransferase for lignin p-hydroxybenzoylation in Populus2021

    • Author(s)
      Zhao Yunjun、Yu Xiaohong、Lam Pui-Ying、Zhang Kewei、Tobimatsu Yuki、Liu Chang-Jun
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 7 Pages: 1288~1300

    • DOI

      10.1038/s41477-021-00975-1

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] New Insights on Structures Forming the Lignin-Like Fractions of Ancestral Plants2021

    • Author(s)
      Rencoret Jorge、Gutierrez Ana、Marques Gisela、del Rio Jose C.、Tobimatsu Yuki、Lam Pui Ying、Perez-Boada Marta、Ruiz-Duenas Francisco Javier、Barrasa Jose M.、Martinez Angel T.
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 12 Pages: 740923

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.740923

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Deficiency in flavonoid biosynthesis genes CHS, CHI, and CHIL alters rice flavonoid and lignin profiles2021

    • Author(s)
      Lam Pui Ying、Wang Lanxiang、Lui Andy C W、Liu Hongjia、Takeda-Kimura Yuri、Chen Mo-Xian、Zhu Fu-Yuan、Zhang Jianhua、Umezawa Toshiaki、Tobimatsu Yuki、Lo Clive
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 188 Pages: 1993~2011

    • DOI

      10.1093/plphys/kiab606

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Lignin complexity and flexibility: how and why do grasses produce lignins different from woods?2021

    • Author(s)
      Yuki Tobimatsu
    • Organizer
      2022 World Wood Day Online Symposium and The Fourth IUFRO Forest Products Culture Colloquium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Biosynthesis and bioengineering of tricin-lignin in grass cell walls2021

    • Author(s)
      Pui Ying Lam, Yuki Tobimatsu, Andy C. W. Lui, Lanxiang Wang, Toshiaki Umezawa, Clive Lo
    • Organizer
      The 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Distinct alterations of lignin biosynthesis in genome-edited rice mutants deficient in two 4-COUMARATE:COENZYME A LIGASE genes2021

    • Author(s)
      Osama Ahmed Afifi, Yuki Tobimatsu, Pui Ying Lam, Andri Fadillah Martin, Takuji Miyamoto, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Toshiaki Umezawa
    • Organizer
      The 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Role of aldehyde dehydrogenases in cell-wall feruloylation in grasses2021

    • Author(s)
      Senri Yamamoto, Yuki Tobimatsu, Pui Ying Lam, Yuri Takeda-Kimura, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Laura E. Bartley, Toshiaki Umezawa
    • Organizer
      The 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Engineering grass cell walls with severe reduction of hydroxycinnamates and lignin for evaluating their structural and physiological roles2021

    • Author(s)
      Nidhi Dwivedi, Senri Yamamoto, Yunjun Zhao, Yuki Tobimatsu, Chang-Jun Liu
    • Organizer
      The 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] イネにおける細胞壁のフェルラ酸架橋構造形成に寄与するアルデヒドデヒドロゲナーゼの同定2021

    • Author(s)
      山本 千莉, 飛松 裕基, プイイン ラム, 木村(武田) ゆり, 刑部 祐里子, 刑部 敬史, バートレイ ローラ, 梅澤 俊明
    • Organizer
      第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会
  • [Presentation] Roles of CINNAMATE 4-HYDROXYLASE in grass lignin biosynthesis investigated through characterizations of genome-edited rice mutants2021

    • Author(s)
      SUPATMI SUPATMI, Tobimatsu Yuki, Lam Pui Ying, Afifi Osama, Osakabe Yuriko, Osakabe Keishi, Umezawa Toshiaki
    • Organizer
      第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会
  • [Presentation] The role of cytosolic ascorbate peroxidase (APX) in lignin biosynthesis in rice2021

    • Author(s)
      Osama A. Afifi, Yuki Tobimatsu, Yuri Takeda-Kimura, Pui Ying Lam, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Toshiaki Umezawa
    • Organizer
      第66回リグニン討論会(リグニン学会第3回年次大会)
  • [Presentation] Roles of CINNAMATE 4-HYDROXYLASE in grass lignin biosynthesis as studied with genome-edited rice mutants2021

    • Author(s)
      SUPATMI, Tobimatsu Yuki, Lam Pui Ying, Afifi Osama, Osakabe Yuriko, Osakabe Keishi, Umezawa Toshiaki
    • Organizer
      第66回リグニン討論会(リグニン学会第3回年次大会)
  • [Presentation] In-depth lignin analyses of rice mutants deficient in p-coumaroyl-CoA:monolignol transferases2021

    • Author(s)
      Pui Ying Lam, Yuki Tobimatsu, Laura E. Bartley, Toshiaki Umezawa
    • Organizer
      第66回リグニン討論会(リグニン学会第3回年次大会)
  • [Presentation] 細胞壁結合型フェルラ酸の形成を抑制したイネALDH変異体のリグノセルロース性状解析2021

    • Author(s)
      山本千莉、飛松裕基、Osama A. Afifi、Pui Ying Lam、梅澤俊明
    • Organizer
      第72回日本木材学会大会(名古屋/岐阜・オンライン)
  • [Remarks] 京都大学森林代謝機能化学分野研究室ウェブサイト

    • URL

      https://www.rish.kyoto-u.ac.jp/lmsfpm/index.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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