In search of genes related to the life-history polymorphism in the Japanese eel Anguilla japonica: a population genomics approach

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20H03065
• Research Institution: Fisheries Research and Education Agency
• Principal Investigator: 關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(横浜), グループ長 (90371799)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 横内 一樹 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(横浜), 主任研究員 (50723839) ; 中道 礼一郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(横浜), 主任研究員 (70401255) ; 白井 厚太朗 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70463908) ; 中村 洋路 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(横浜), 主任研究員 (90463182) ; 山本 佑樹 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(横浜), 研究員 (10881980)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

Outline of Annual Research Achievements

本年度はCOVID-19の影響もあり，サンプリングを計画通りに行うことができなかった．このサンプリングが実施できない状態は当面続くと考えられるため，過去に収集されたサンプルをDNA解析に加えることでこの問題を解決することとした．本年度は、(1) 2016年度に静岡県鷲津地区で収集された下りウナギ35個体、(2)2018年度に愛媛県の西条，河原津および多真浜地区で採集された44個体，および(3)本年度に静岡県鷲津地区で採集された21個体について，DNAを抽出し，RADseq解析による一塩基多型データを収集した．このうち過去のサンプル(1)と(2)については，すでに耳石の微量元素解析が終了しており，(1)では海ウナギが18個体，川ウナギが17個体，(2)では海ウナギが24個体，川ウナギが20個体であった．

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新たなサンプルが入手できなかったという問題はあるが，過去のサンプルの一塩基多型データを用いることで，計画している集団ゲノム解析は可能である．このため計画はおおむね順調であると判断した．

Strategy for Future Research Activity

今後，新たなサンプルは計画通りには入手できないと考えられるが，過去に収集されたサンプルも用いることを前提として課題を進める．