In search of genes related to the life-history polymorphism in the Japanese eel Anguilla japonica: a population genomics approach

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20H03065
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 40030:Aquatic bioproduction science-related
• Research Institution: Fisheries Research and Education Agency
• Principal Investigator: Sekino Masashi 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), グループ長 (90371799)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山本 佑樹 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 研究員 (10881980) ; 横内 一樹 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 主任研究員 (50723839) ; 中道 礼一郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 主任研究員 (70401255) ; 白井 厚太朗 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70463908) ; 中村 洋路 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), 主任研究員 (90463182)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

Outline of Final Research Achievements

Based on population genomics with single nucleotide polymorphisms (SNPs), the present study aimed to identify genomic regions (genes) that distinguish between two ecotypes of Japanese eels Anguilla japonica, i.e., sea-resident and river-resident types. In the most informative SNP set (20 SNPs) in separating the two ecotypes, one SNP was located at the position near genes associated with the regulation of the mechanosenstive sodium channels and proton-activated chloride channel. Those genes that are potentially involved in adapting to differences in salinity (sea and river environments) may play an important role in the occurrence of the ecotypes.

Free Research Field

応用集団遺伝学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の結果から，海域環境下の生存に適した遺伝子型を持つ個体が存在することが示唆された．こうした知見は，資源回復のための成育場保全策を考える上で重要である．さらに本種では，偶発的に来遊した東アジアの河川上流から内湾までの様々な水系に対する環境適応が，生活史戦略の根幹をなしている可能性がある．従って得られる成果は，海域と河川それぞれに適応的な遺伝子資源を保全し，本種の環境適応ポテンシャルの損失を防ぐことの必要性を示す根拠になる．