• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

Study on Structure and Function for Force Generating Mechanism of Bacterial Flagellar Motor

Research Project

Project/Area Number 20H03220
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

本間 道夫  名古屋大学, 理学研究科, 研究員 (50209342)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords生体エネルギー変換 / 細菌べん毛 / モータータンパク質 / 回転子 / 固定子
Outline of Annual Research Achievements

べん毛回転は、細胞膜上の固定子中をイオンが透過し、固定子-回転子間の相互作用が変化し、回転力が生じる。我々の研究で主に使っている海洋性ビブリオ菌のPomAPomBに関して、クライオ電子顕微鏡による構造解析を前年度に引き続き行い、原子レベルの構造構築を行った。しかし、昨年、我々の使っているPomABとほぼ同じタンパク質構造がデンマークのグループによって先に発表されてしまった。そこで、新たな付加価値をつけて投稿するためにイオン結合部位の構造についてさらなる詳細に解析を行い、論文をほぼ投稿できる状態にした。べん毛モーターの試験管内で、機能的なモーターの再構成形を構築するために必要なビブリオ菌由来のMSリングをFliFとFliGを融合したタンパク質を用いて、効率よく精製することに成功して、解析を行い、論文としまとめることができた。さらに、クライオ電子顕微鏡で構造解析をおこない、原子レベルの構造についてSリングの部分については得られた。しかし、MリングやFliGの部分については構造が揺らいているらしく、構造を得ることはできなかった。
FliFにGFPを結合して、MSリング構造を観察できることも示すことができた。このMSリングを膜に埋め込む実験を開始した。また、実際に固定子が回転しているかを検証する為に、GFPタンパク質をPomBに融合し、精製を行い、前年度AFM(原子間力顕微鏡)による観察を行ったが、構造を確認することはできなかった。本年度は、Hisタグを利用して、金粒子に結合することで、観察を行い、固定子の構造を電子顕微鏡とAFMで、固定子の構造を容易に観察することはできるようになった。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Deciphering the genomes of motility-deficient mutants of Vibrio alginolyticus 138-22024

    • Author(s)
      Uesaka Kazuma、Inaba Keita、Nishioka Noriko、Kojima Seiji、Homma Michio、Ihara Kunio
    • Journal Title

      PeerJ

      Volume: 12 Pages: e17126

    • DOI

      10.7717/peerj.17126

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of linker region flanked by transmembrane and peptidoglycan binding region of PomB in energy conversion of the Vibrio flagellar motor2024

    • Author(s)
      Miyamura Yusuke、Nishikino Tatsuro、Koiwa Hiroaki、Homma Michio、Kojima Seiji
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 29 Pages: 282-289

    • DOI

      10.1111/gtc.13102

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ring formation by Vibrio fusion protein composed of FliF and FliG, MS-ring and C-ring component of bacterial flagellar motor in membrane2023

    • Author(s)
      Takahashi Kanji、Nishikino Tatsuro、Kajino Hiroki、Kojima Seiji、Uchihashi Takayuki、Homma Michio
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 20 Pages: e200028

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Changes in the hydrophobic network of the FliGMC domain induce rotational switching of the flagellar motor2023

    • Author(s)
      Nishikino Tatsuro、Hijikata Atsushi、Kojima Seiji、Shirai Tsuyoshi、Kainosho Masatsune、Homma Michio、Miyanoiri Yohei
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 107320

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.107320

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interaction of FlhF, SRP-like GTPase with FliF, MS ring component assembling the initial structure of flagella in marine Vibrio2023

    • Author(s)
      Fukushima Yuria、Homma Michio、Kojima Seiji
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 174 Pages: 125-130

    • DOI

      10.1093/jb/mvad029

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Interaction between the stator and rotor proteins, PomA and FliG, to generate rotational force by ion-motive force in the bacterial flagellar motor2023

    • Author(s)
      Hiroyuki Terashima、Michio Homma、Seiji Kojima
    • Organizer
      Naito Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 海洋性ビブリオ菌べん毛モーター機能を助けるストマチン様タンパク質FliLの構造と生化学性状2023

    • Author(s)
      本間道夫,錦野達郎,竹川宜宏,池田充,多治見祐希,村田和義,今田勝巳,小嶋誠司,内橋貴之
    • Organizer
      ビブリオシンポジウム
  • [Presentation] ビブリオ菌べん毛モーター固定子タンパク質PomBの膜貫通領域とペプチドグリカン結合領域を繋ぐリンカー領域の役割2023

    • Author(s)
      宮村優輔、錦野達郎、小岩大晃、高橋 幹士、多治見祐希、本間道夫、内橋貴之、小嶋誠司
    • Organizer
      日本生化学会大会
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡単粒子解析によるべん毛モーター固定子PomAPomBのNa+イオン透過経路の解明2023

    • Author(s)
      錦野達郎, 竹川宜宏, 岸川淳一, 廣瀬未果, 小嶋誠司, 本間道夫, 加藤貴之, 今田勝巳
    • Organizer
      日本細菌学会中部支部総会
  • [Presentation] Investigation of interaction between flagellar motor stator PomB and stomatin-like protein FliL in marine Vibrio.2023

    • Author(s)
      本間道夫,錦野達郎,竹川宜宏,池田充,多治見祐希,村田和義,今田勝巳,小嶋誠司,内橋貴之
    • Organizer
      日本生物物理学会年会

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi