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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Measuring molecular properties of membrane proteins using a synthetic cell micro-environment conposed of a model cell membrane and a nanometric space

Research Project

Project/Area Number 20H03225
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

森垣 憲一  神戸大学, バイオシグナル総合研究センター, 准教授 (10358179)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 文夫  神戸大学, 理学研究科, 名誉教授 (80093524)
鈴木 健一  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (50423059)
笠井 倫志  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 特任准教授 (20447949)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords生体膜 / 脂質ラフト / 膜タンパク質 / エクソソーム
Outline of Annual Research Achievements

細胞膜の微小ドメイン構造(ラフト)は、膜タンパク質の機能調節に重要な役割を果たすと考えられている。研究代表者は、ラフト領域と非ラフト領域が明確に分かれているパターン化人工膜を用いて、膜タンパク質のラフト親和性を定量する手法を開発した。本研究は、人工膜と接する厚さ100nm以下のナノ空間に、細胞内のような高濃度のタンパク質やリガンドが存在する微小環境を再現し、それらと膜タンパク質との結合・解離を1分子蛍光観察で定量的に評価することを目的とする。2022年度には、①人工膜とナノ空間を一体化したバイオチップ作製、②パターン化人工膜への膜タンパク質の再構成、に関する技術開発を行った。
①人工膜とナノ空間を一体化したバイオチップ作製:人工膜としては、光重合性リン脂質を光リソグラフィー技術でUV重合することでポリマー脂質膜を作製した。ナノ空間は、厚さの制御された接着層(高密度な親水性高分子鎖(高分子ブラシ)を被覆したシリカ微粒子)を用いて人工膜とPDMSを結合することで作製した。粒径100nmのナノ粒子を用いることで、流動性脂質膜部位の膜とPDMSの間に同程度の厚さを持つナノ空間が形成された。
②パターン化人工膜への膜タンパク質の再構成:パターン化人工膜とPDMSとの間に形成されたナノ空間に細胞由来の膜小胞(エクソソーム)を導入し連続した2次元膜を形成する技術を開発した。エクソソームマーカーであるCD81、がんや発生に関与する分泌性タンパク質Wnt4を含むエクソソームを導入して、それらの分子が2次元拡散することを確認した。エクソソーム膜内に含まれる膜タンパク質の動的な挙動を調べる手法はこれまでになく、エクソソーム膜の2次元膜化技術はエクソソーム膜の膜タンパク質を解析する革新的な技術になるものと期待される。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (35 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 12 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Leeds(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Leeds
  • [Int'l Joint Research] University of Siegen(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      University of Siegen
  • [Int'l Joint Research] Weill Cornell Medicine(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Weill Cornell Medicine
  • [Journal Article] Retarded diffusion and confinement of membrane-bound molecules in a patterned hybrid membrane of phospholipid bilayers and monolayers2023

    • Author(s)
      Tanimoto, Y., Yoshimura, Y., Hayashi, F., Morigaki, K.
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 127 Pages: 520-527

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c06053

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Self-Quenching Behavior of a Fluorescent Probe Incorporated within Lipid Membranes Explored Using Electrophoresis and Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy2023

    • Author(s)
      Sophie A. Meredith, Yuka Kusunoki, Simon D. Connell, Kenichi Morigaki, Stephen D. Evans, Peter G. Adams
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 127 Pages: 1715-1727

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c06053

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Single-Molecule Imaging of Ganglioside Probes in Living Cell Plasma Membranes2023

    • Author(s)
      Suzuki Kenichi G. N.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2613 Pages: 215-227

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2910-9_17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Refinement of Singer-Nicolson fluid-mosaic model by microscopy imaging: Lipid rafts and actininduced membrane compartmentalization2023

    • Author(s)
      Suzuki Kenichi G.N.、Kusumi Akihiro
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta

      Volume: 1865 Pages: 184093

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2022.184093

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design of supramolecular hybrid nanomaterials comprising peptide-based supramolecular nanofibers and in situ generated DNA nanoflowers through rolling circle amplification2023

    • Author(s)
      Sugiura Shintaro, Shintani Yuki, Mori Daisuke, Higashi Sayuri L., Shibata Aya, Kitamura Yoshiaki, Kawano Shin-ichiro, Hirosawa Koichiro M., Suzuki Kenichi G. N., Ikeda Masato
    • Journal Title

      Nanoscale

      Volume: 15 Pages: 1024-1031

    • DOI

      10.1039/d2nr04556g

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nanofluidic Model Membrane for the Single-Molecule Observation of Membrane Proteins2022

    • Author(s)
      Ryota Komatsu, Yasushi Tanimoto, Koji Ando, Kazuma Yasuhara, Yasuhiko Iwasaki, Fumio Hayashi, and Kenichi Morigaki
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 38 Pages: 7234-7243

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.2c00724

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enhancing the spectral range of plant and bacterial Light-Harvesting pigment-protein complexes with various synthetic chromophores incorporated into lipid vesicles2022

    • Author(s)
      Hancock, A. M., Swainsbury, D. J. K., Meredith, S. A., Morigaki, K., Hunter, C. N., Adams, P. G.
    • Journal Title

      J. Photochem. Photobiol., B

      Volume: 237 Pages: 112585

    • DOI

      10.1016/j.jphotobiol.2022.112585

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Fluorescence Spectroscopic Analysis of Lateral and Transbilayer Fluidity of Exosome Membranes2022

    • Author(s)
      Yasuda Tomokazu, Watanabe Hirofum, Hirosawa Koichiro M, Suzuki Kenichi G. N, Suga Keish, Hanashima Shinya
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 38 Pages: 14695-14703

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.2c02258

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-acetylglucosaminyltransferase-V (GnT-V)-enriched small extracellular vesicles mediate Nglycan remodeling in recipient cells2022

    • Author(s)
      Hirata Tetsuya, Harada Yoichiro, Hirosawa Koichiro M, Tokoro Yuk, Suzuki Kenichi G.N., Kizuka Yasuhiko
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 105747-105747

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105747

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of lacto-series ganglioside fluorescent probe using late-stage sialylation and behavior analysis with single-molecule imaging2022

    • Author(s)
      Takahashi Maina, Komura Naoko, Yoshida Yukako, Yamaguchi Eriko, Hasegawa Ami, Tanaka Hide-Nori, Imamura Akihiro, Ishida Hideharu, Suzuki Kenichi G. N., Ando Hiromune
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 3 Pages: 868-885

    • DOI

      10.1039/d2cb00083k

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of a Reduction‐responsive DNA Microsphere using a Reduction‐cleavable Spacer based on a Nitrobenzene Scaffold2022

    • Author(s)
      Higashi Sayuri L., Isogami Ayaka, Takahashi Junko, Shibata Aya, Hirosawa Koichiro M., Suzuki Kenichi G. N., Sawada Shunsuke, Tsukiji Shinya, Matsuura Kazunori, Ikeda Masato
    • Journal Title

      Chemistry Asian Journal

      Volume: 17 Pages: e202200142

    • DOI

      10.1002/asia.202200142

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A methodology for creating mutants of G-protein coupled receptors stabilized in active state by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering2022

    • Author(s)
      Yamamoto T, Yasuda S, Kasai RS, Nakano R, Hikiri S, Sugaya K, Hayashi T, Ogasawara S, Shiroishi M, Fujiwara TK, Kinoshita M, Murata T.
    • Journal Title

      Protein Sci.

      Volume: 31 Pages: e4425

    • DOI

      10.1002/pro.4425.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Substrate-supported photosynthetic model thylakoid membrane2023

    • Author(s)
      Yuka Kusunoki, Daisuke Takagi, Seiji Akimoto, Sophie A. Meredith, Ashley M. Hancock, Stephen D. Evans, Peter G. Adams, Kenichi Morigaki
    • Organizer
      13th International Workshop on Nanostructures & Nanoelectronics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 固体基板表面におけるパターン化人工生体膜の創成2022

    • Author(s)
      森垣憲一
    • Organizer
      生体膜デザインコンファレンス
    • Invited
  • [Presentation] Micropatterned model membrane platform for physicochemical and functional analysis of membrane proteins2022

    • Author(s)
      森垣憲一
    • Organizer
      第95回日本生化学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Micropatterned model membrane composed of polymerized and natural lipid bilayers2022

    • Author(s)
      森垣憲一
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] パターン化人工膜へのエクソソーム導入技術の開発2022

    • Author(s)
      吉村 優, 杉町 純音, 林 文夫, 廣澤 幸一朗, 笠井 倫志, 鈴木 健一, 森垣 憲一
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Reconstitution of photoreceptor rhodopsin into a patterned model membrane using peptide nanodisc2022

    • Author(s)
      Masato Koezuka, Fuko Kueda, Fumio Hayashi, Kenichi Morigaki
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 2色同時超解像動画観察によるGPI-アンカー型タンパク質の膜ドメイン形成機構の解明2022

    • Author(s)
      川合登偉、笠井倫志、廣澤幸一朗、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      令和4年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Presentation] 細胞外小胞を介したWnt のシグナル伝達機構の解明2022

    • Author(s)
      笠井倫志、鈴木健一
    • Organizer
      令和4年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Presentation] 細胞外小胞の結合制御機構:超解像・1粒子観察による解明2022

    • Author(s)
      磯貝樹、廣澤幸一朗、菅野未希、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      令和4年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Presentation] 1分子・超解像顕微鏡観察による細胞膜内層シグナル伝達場の可視化解析2022

    • Author(s)
      森俊貴、廣澤幸一朗、笠井倫志、田口友彦、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [Presentation] Regulation mechanisms of EGFR activation by gangliosides as revealed by single-molecule imaging2022

    • Author(s)
      Kenichi G. N. Suzuki
    • Organizer
      JSPS Core-to-core program "Establishment of Glocan Research Institute for Uncovering Glycan Organized Life Principle (UGLIP)"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞外小胞が誘起する標的細胞でのシグナル伝達機構2022

    • Author(s)
      廣澤幸一朗、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第9回日本細胞外小胞学会学術集会
  • [Presentation] 蛍光1粒子観察による細胞外小胞の細胞選択的結合の分子機構解明2022

    • Author(s)
      磯貝樹、廣澤幸一朗、菅野未希、正彩乃、木塚康彦、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第9回日本細胞外小胞学会学術集会
  • [Presentation] Intracellular signagling triggered by small extracellular vesicles as revealed by super-resolution microscopy and single particle tracking2022

    • Author(s)
      廣澤幸一朗、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Molecular mechanisms of selective binding of small extracellular vesicles to recipient cells as revealed by single-particle imaging2022

    • Author(s)
      磯貝樹、廣澤幸一朗、菅野未希、正彩乃、木塚康彦、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Trans-dimer conformations of full-length ectodomains of Celsr cadherin in solution visualized using high-speed atomic force microscopy2022

    • Author(s)
      Nishiguchi S, Kasai R, Uchihashi T.
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Single molecule observation of polarity-related membrane proteins at the cell-cell interface; immobilization and accumulation of Frizzled2022

    • Author(s)
      Kasai RS, Nemoto YL.
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 高速AFMと局在化AFM法を用いた接着GPCRの細胞外領域の構造解析2022

    • Author(s)
      西口 茂孝、笠井 倫志、内橋 貴之
    • Organizer
      令和4年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Remarks] 神戸大学・森垣研究室

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~morigaki/jp/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] エクソソーム膜結合分子の解析方法2022

    • Inventor(s)
      森垣憲一、鈴木健一、笠井倫志、廣澤幸一朗
    • Industrial Property Rights Holder
      神戸大学、岐阜大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2022-132291

URL: 

Published: 2023-12-25  

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