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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Structural analysis of the oxygen evolving center of photosystem II to gain insights into the water splitting reaction

Research Project

Project/Area Number 20H03226
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

菅 倫寛  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 教授 (60634920)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中島 芳樹  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 特任助教 (60847052)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords光合成 / 膜タンパク質 / X線自由電子レーザー / 光化学系II / 水分解反応
Outline of Annual Research Achievements

光合成における水分解・酸素発生反応は光エネルギーを利用して水からプロトンと電子と酸素分子に分ける反応であり、光化学系II(PSII)内部のMn4CaO5クラスターが酸化状態を5段階(S0状態からS4状態へ)に順次変化させて触媒する。このうち,中間体S2状態は電磁性共鳴法により区別されるスピン状態の異なる2つの状態があることが古くから知られているが,結晶構造解析されたのはスピン状態がS=1/2のもののみであり,スピン状態がS=5/2のものは解析されていない。そこで本研究ではPSIIのS=5/2のS2状態を調製して構造解析することを目指してきた。
令和3年度までに中間体状態を得ることを目的として,溶液のpHをアルカリ状態(pH 9以上)にしたものを調製し、固定ターゲット法を用いて回折実験を行った。回折データはCC1/2を基準として、2Aに近い高分解能のデータを取得することに成功した。そこで最終年度はこれらのデータセットの構造解析を進めた。解析の結果,溶液状態がアルカリ状態に変化したことに伴う立体構造の変化を確認することができた。また光励起によって反応中間体へと遷移したことを、S2状態で不安定になることが知られている特定の水分子の挙動から確認した。プロトン排出経路の候補と考えられる水チャネルにおいては酸性アミノ酸に構造変化が見られた。このことは高pH状態を反映していると考えられ、構造変化したところがプロトン排出チャネルとして働くことが示唆された。
これらの成果はちかいうちにとりまとめ、国際学会での発表および投稿論文にて発表する予定である。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Crystal structures of photosystem II from a cyanobacterium expressing psbA2 in comparison to psbA3 reveal differences in the D1 subunit2022

    • Author(s)
      Nakajima Yoshiki、Ugai-Amo Natsumi、Tone Naoki、Nakagawa Akiko、Iwai Masako、Ikeuchi Masahiko、Sugiura Miwa、Suga Michihiro、Shen Jian-Ren
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102668~102668

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102668

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Geometric, electronic and spin structures of the CaMn4O5 catalyst for water oxidation in oxygen-evolving photosystem II. Interplay between experiments and theoretical computations2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Kizashi、Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Kawakami Takashi、Miyagawa Koichi、Suga Michihiro、Akita Fusamichi、Shen Jian-Ren
    • Journal Title

      Coordination Chemistry Reviews

      Volume: 471 Pages: 214742~214742

    • DOI

      10.1016/j.ccr.2022.214742

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural dynamics and substrate binding to the oxygen-evolving complex studied by time-resolved X-ray crystallography of PSII2022

    • Author(s)
      M Suga
    • Organizer
      10th Asian Biological Inorganic Chemnistry Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] X線自由電子レーザーを用いた解析におる光化学系IIの基質水分子の取り込みと水分子の酸化に関する構造的知見2022

    • Author(s)
      菅 倫寛, 中島芳樹, リホンジェ, 沈 建仁
    • Organizer
      第60回 生物物理学会年会
  • [Presentation] Studies on the molecular mechanism for water oxidation in photosystem II2022

    • Author(s)
      菅 倫寛
    • Organizer
      The 22nd annual meeting of the photobiology association of Japan
    • Invited
  • [Presentation] Time-resolved structural studies on photosystem II provide insights into the mechanism of water oxidation and substrate delivery2022

    • Author(s)
      M Suga
    • Organizer
      Satellite Meeting to 18th international congress on photosynthesis research 2022: Mechanism of water oxidation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] X-ray free electron lasers reveal the molecular mechanism for water oxidation in photosystem II.2022

    • Author(s)
      M Suga
    • Organizer
      International congress on photosynthesis research 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Crystal structure analyses of photosystem II isolated from Thermosynechococcus elongatus mutants expressing only psbA2 or psbA3 genes as the D1 protein.2022

    • Author(s)
      Nakajima Y., Ugai-Amo N., Tone N., Nakagawa A., Iwai M., Sugiura M., Ikeuchi M., Suga M. and Shen J. -R.
    • Organizer
      18th International Congress on Photosynthesis Research, Dunedin, New Zealand.
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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