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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Evolutionary biological studies of initial transitions of gender phenotypes

Research Project

Project/Area Number 20H03299
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野崎 久義  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任研究員 (40250104)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山口 晴代  国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 (20722672)
河地 正伸  国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (50260469)
高橋 文雄  立命館大学, 生命科学部, 講師 (60332318)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords緑藻類 / ボルボックス系列 / プレオドリナ / ボルボックス / 交配システム転換進化 / 全ゲノム解析 / ホモタリック / ヘテロタリック
Outline of Annual Research Achievements

長期間にわたる相模川水系の湖沼のフィールド調査と培養・交配実験から緑藻プレオドリナの一種(Pleodorina starrii)において,一倍体生物の種内で初めて単性型オス・単性型メス・両性型の3個の性表現型の共存が見出され,交配実験により両性型は単性型オスと同一の性決定遺伝子MIDをもつ性決定領域(SDR)を有し,常染色体領域中に両性型決定因子の存在が示唆された(Takahashi et al. 2021 Evolution)。更に 3性表現型3株の全ゲノム配列を決定した結果,約185 kbのオスSDRと約137 kbのメスSDRが明らかとなり,両性型株のSDRはオスと同一であった。また,これまでメス特異的遺伝子とされていた配偶子接着遺伝子FUS1が本種では3性表現型の常染色体領域に存在し、配列は基本的に同じであった。
我々はホモタリック種からヘテロタリック種への進化的転換の分子基盤を解明する足掛かりとして,本進化が推測されるボルボックス節のMID ホモログに着目した。本節全種の MID の探索と配列比較の結果,全ての同株種と異株種雄はMID 全長を保持し,同株と異株で分子進化的特徴が同様であることを明らかにした (山岸ら 本学会第45回大会) 。更に、本節のホモタリック種からごく最近ヘテロタリック種に進化したと考えられる Volvox rousseletii のメス株とオス株の全ゲノム解読と近縁な同株種との MID 発現比較を実施した。その結果,雌は雄と同じ MID 配列をもつが,発現は抑制されており,雄は同体種と同様の MID 発現パターンを示した。また,全ゲノムデータから雌雄間の染色体レベルの差異が示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

一倍体生物の種内で初めて単性型オス・単性型メス・両性型の3個の性表現型の共存が見出され,交配実験により両性型は単性型オスと同一の性決定遺伝子MIDをもつ性決定領域(SDR)を有し,常染色体領域中に両性型決定因子の存在が示唆され(Takahashi et al. 2021 Evolution)、これらの分子生物学的基盤のため全ゲノム比較解析を実施できた。また、また、ホモタリックからごく最近ヘテロタリック種に進化したと考えられる Volvox rousseletii のメス株とオス株の全ゲノム解読と近縁な同株種との MID 発現比較を実施した。

Strategy for Future Research Activity

プレオドリナで構築した全ゲノムデータを更に解析し、3種類の性表現型を持ハプロイド種の分子生物学的基盤を明らかにする。更に3個の性表現の保持がヘテロタリック種からホモタリック種への転換進化であるかどうかを近縁な種の全ゲノムデータを構築・比較することから検討する。また、V. rousseletiiに近縁なホモタリック種 V.ferissii の全ゲノムデータを構築し、ホモタリック種からヘテロタリック種への転換進化の分子生物学的基盤を詳細に解明する。

  • Research Products

    (17 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Khon Kaen Universit/Kalasin University(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Khon Kaen Universit/Kalasin University
  • [Journal Article] Morphology, mating system and taxonomy of Volvox africanus (Volvocaceae, Chlorophyceae) from Thailand2022

    • Author(s)
      Nozaki Hisayoshi、Mahakham Wuttipong、Heman Wirawan、Matsuzaki Ryo、Kawachi Masanobu
    • Journal Title

      Botanical Studies

      Volume: 63 Pages: 1

    • DOI

      10.1186/s40529-022-00332-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 湖沼調査から新たなるブレークスルーを目指して2022

    • Author(s)
      野崎久義
    • Journal Title

      藻類 Jpn. J. Phycol.

      Volume: 70 Pages: 1-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Three sex phenotypes in a haploid algal species give insights into the evolutionary transition to a self‐compatible mating system*2021

    • Author(s)
      Takahashi Kohei、Kawai‐Toyooka Hiroko、Ootsuki Ryo、Hamaji Takashi、Tsuchikane Yuki、Sekimoto Hiroyuki、Higashiyama Tetsuya、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      Evolution

      Volume: 75 Pages: 2984~2993

    • DOI

      10.1111/evo.14306

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Rubisco small subunits in the green algal genus Chloromonas provide insights into evolutionary loss of the eukaryotic carbon-concentrating organelle, the pyrenoid2021

    • Author(s)
      Matsuzaki Ryo、Suzuki Shigekatsu、Yamaguchi Haruyo、Kawachi Masanobu、Kanesaki Yu、Yoshikawa Hirofumi、Mori Toshiyuki、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      BMC Ecology and Evolution

      Volume: 21 Pages: 11

    • DOI

      10.1186/s12862-020-01733-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Enigmatic Snow Microorganism, Chionaster nivalis, Is Closely Related to Bartheletia paradoxa (Agaricomycotina, Basidiomycota)2021

    • Author(s)
      Matsuzaki Ryo、Takashima Yusuke、Suzuki Iwane、Kawachi Masanobu、Nozaki Hisayoshi、Nohara Seiichi、Degawa Yousuke
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 36 Pages: ME21011

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME21011

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome sequencing of the multicellular alga Astrephomene provides insights into convergent evolution of germ-soma differentiation2021

    • Author(s)
      Yamashita Shota、Yamamoto Kayoko、Matsuzaki Ryo、Suzuki Shigekatsu、Yamaguchi Haruyo、Hirooka Shunsuke、Minakuchi Yohei、Miyagishima Shin-ya、Kawachi Masanobu、Toyoda Atsushi、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 22231

    • DOI

      10.1038/s41598-021-01521-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The four-celled Volvocales green alga Tetrabaena socialis exhibits weak photobehavior and high-photoprotection ability2021

    • Author(s)
      Tanno Asuka、Tokutsu Ryutaro、Arakaki Yoko、Ueki Noriko、Minagawa Jun、Yoshimura Kenjiro、Hisabori Toru、Nozaki Hisayoshi、Wakabayashi Ken-ichi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16 Pages: e0259138

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0259138

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 4タイプの性表現型をもつ ”ボルボックス・アフリカヌス” の幻の培養株を求め2021

    • Author(s)
      野崎久義・松﨑令・河地正伸
    • Organizer
      日本微生物資源学会第27回大会、オンライン
  • [Presentation] 湖沼調査から新たなるブレークスルーを目指して2021

    • Author(s)
      野崎久義
    • Organizer
      茨城大学理学部理工学研究科セミナー、オンライン
    • Invited
  • [Presentation] アオミドロ類(接合藻類ストレプト植物門)の接合形態比較及び分子系統解析2021

    • Author(s)
      高野智之・野崎久義・坂山英俊
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会、オンライン
  • [Presentation] アストレフォメネの新規ゲノム解読とボルボックス系列緑藻における非生殖細胞分化の平行進化の解析2021

    • Author(s)
      山下翔大・山本荷葉子・松﨑令・鈴木重勝・山口晴代・廣岡俊亮・水口洋平・宮城島進也・河地正伸・豊田敦・野崎久義
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会、オンライン
  • [Presentation] 群体性ボルボックス目(緑藻類)の恒久的保存を目指して2021

    • Author(s)
      野崎久義・森史・松﨑令・山口晴代・河地正伸
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会、オンライン
  • [Presentation] Three sex phenotypes in a haploid algal species give insights into the evolutionary transition to a self-compatible mating system2021

    • Author(s)
      Takahashi, K., Kawai-Toyooka, H., Ootsuki, R., Hamaji, T., Tsuchikane, Y., Sekimoto, H., Higashiyama, T. & Nozaki1, H.
    • Organizer
      75th Annual Meeting of the Phycological Society of America, Online
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Re-discovery of the third mating system of “Volvox africanus“ from cultures originating from the hometown of dinosaurs in Thailand2021

    • Author(s)
      Nozaki H., Wuttipong, M., Heman, W., Matsuzaki, R. & Kawachi, M.
    • Organizer
      75th Annual Meeting of the Phycological Society of America, Online
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 3タイプの性別を藻類・菌類の同一種内で初めて発見

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2021/7451/

  • [Remarks] Species of algae with three sexes

    • URL

      https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/en/press/z0508_00186.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

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