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2022 Fiscal Year Annual Research Report

アルケン型ペプチド結合等価体の分子特性の解明と創薬応用

Research Project

Project/Area Number 20H03363
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

鳴海 哲夫  静岡大学, 工学部, 准教授 (50547867)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords中分子ペプチド / 生物学的等価体 / アルケン / β-ターン構造 / α-ヘリックス構造 / グアニン四重鎖
Outline of Annual Research Achievements

-n→π*相互作用が構造形成に重要なβ-ターン構造をモデルとして、β-ターン構造のミミック効果を精査した。β-ターン構造を形成するテトラペプチドのPro-D-Val結合を種々のアルケン骨格に置換したペプチドミメティックを合成・構造解析したところ、既知の等価体の中では,クロロアルケン型が最も優れたβ-ターンミミックとなることを見出した。また、クロロアルケン型のβ-ターン構造は, 塩素原子の立体効果に加え、立体電子効果によって安定化されていることを見出した。

-五員環状二置換アミノ酸を含むクロロアルケン型ペプチド結合等価体CADIの合成とヘリカルペプチドミミックの合成を検討した。シクロペンタノンから誘導したキラルなイミンに対し, Aza-Darzens縮合を行い、スピロ炭素と四級炭素を含むアジリジン化合物を構築し、順次官能基変換することで所望のAc5c-Leu型CADI を立体選択的に合成した。さらに, 7残基のヘリカルペプチドにCADIを導入したヘリカルペプチドミメティックの合成に成功した。CADIを導入したヘリカルペプチドミメティックの二次構造を解析したところ、右巻きのα-ヘリックス構造を形成していることが示唆された。

-R3年度に構築したRGGペプチドライブラリーのG4結合親和性を評価した結果、RNA由来のグアニン四重鎖TERRAに対し、50 μM以下の結合親和性を示したペプチドを12種見出し、なかには1.47 μMと高い結合親和性を示す新規RGGペプチドを見出した。また、RGGYペプチドの構造を分光学的に解析したところ、天然型は特定の二次構造を形成しないのに対し、クロロアルケン型はターン構造を形成することが明らかになった。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (17 results)

All 2022

All Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Presentation] 特殊ユビキチン鎖プローブの化学合成と応用2022

    • Author(s)
      田口佳紀, 鈴木裕務, 冨田拓哉 , 西澤拓真, 竹内伶音, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大竹史明, 佐伯泰, 鳴海哲夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
  • [Presentation] 共役ジエンの置換基効果に基づくタウ結合性PBB化合物の高度化2022

    • Author(s)
      藤本准子、武田大、佐藤浩平、間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
  • [Presentation] ペプチド・タンパク質の主鎖改変を基盤とする生物有機化学2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会2022 in 名古屋
    • Invited
  • [Presentation] 光反応性向上を指向したキノリニウム型光感受性保護基の構造展開と理論的解析2022

    • Author(s)
      宮田光一、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、野口良史、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
  • [Presentation] Gly-Pro 型フルオロアルケンジペプチドイソスターの立体選択的合成とコラーゲンペプチドへの応用2022

    • Author(s)
      飯尾智裕、外山大地、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
  • [Presentation] アミド結合形成におけるベンゾトリアゾールエステルの隣接基効果に関する理論的解2022

    • Author(s)
      藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
  • [Presentation] アルケン型ペプチド結合等価体を導入したRGGY ペプチドミメティックの合成 および構造解析2022

    • Author(s)
      竹尾沙優里、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
  • [Presentation] クロロアルケンジペプチドイソスターのC 末端エステルにおける加水分解反応の機構解明2022

    • Author(s)
      河原和寿、竹尾沙優里、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
  • [Presentation] Non-covalent interactions of (Z)-fluoroalkene dipeptide isosteres in the backbone of the collagen triple helix2022

    • Author(s)
      Chihiro Iio, Junko Fujimoto, Daichi Toyama, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
  • [Presentation] Diastereoselective synthesis of (Z)-chloroalkene analogue of human NMUR2 selective agonist designed to prevent intramolecular acyl transfer reaction2022

    • Author(s)
      Daichi Toyama, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Kentaro Takayama, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
  • [Presentation] Development of helical peptidomimetics containing (Z)-chloroalkene dipeptide isostere2022

    • Author(s)
      Sayuri Takeo, Yui Suruga, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Masakazu Tanaka, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
  • [Presentation] Chemical synthesis of ubiquitin dimer containing Gly-Gly-type (E)-methylalkene dipeptide isosteres2022

    • Author(s)
      Kohei Watanabe, Hiromu Suzuki, Yoshinori Taguchi, Sayuri Takeo, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
  • [Presentation] α,α-二置換アミノ酸を含むクロロアルケン型ペプチド結合等価体の立体選択合成とペプチドミメティックへの応用2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫, 竹尾沙優里, 駿河唯, 今井咲, 児玉有輝, 藤本准子, 佐藤浩平, 間瀬暢之
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] アルケン型ペプチド結合等価体を利用した非水解性ユビキチン鎖の化学合成と機能評価2022

    • Author(s)
      渡邉紘平, 鈴木裕務, 田口佳紀, 竹尾沙優里, 藤本准子, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] ペプチド主鎖の二面角制御を指向したフルオロアルケン型コラーゲンペプチドミメティックスの合成と構造解析2022

    • Author(s)
      飯尾智裕, 藤本准子, 外山大地, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] タンパク質化学合成を基盤としたユビキチン鎖プローブの創製2022

    • Author(s)
      田口佳紀, 冨田拓哉, 西澤拓真, 竹内伶音, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大竹史明, 佐伯泰, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] Peptidomimetic Synthesis via Amide-to-Alkene Isosteric Switching and Beyond2022

    • Author(s)
      Tetsuo Narumi
    • Organizer
      11th Singapore International Chemical Conference (SICC-11)
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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