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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Development for quantum-theoretical approach by observing hydrogen atom positions in drug target proteins

Research Project

Project/Area Number 20H03377
Research InstitutionNational Institutes for Quantum Science and Technology

Principal Investigator

安達 基泰  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (60293958)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡島 俊英  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (10247968)
高橋 知里  同志社女子大学, 薬学部, 助教 (70833680)
老川 典夫  関西大学, 化学生命工学部, 教授 (80233005)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords酵素 / 結晶構造解析 / 中性子
Outline of Annual Research Achievements

1、human Dihydrofolate Reductase (hDR)に関しては、葉酸とNADPとの3者複合体の回折データを使って、R値18%程度にまで結晶構造の精密化を進めた。しかしながら、分解能が低く、結晶中での非対称単位に4複合体も含まれるため、引き続き、中性子結晶構造解析に適した条件を探索したが、新たな結晶の取得には至っていない。引き続き、プロテアーゼによる部分消化などによって、まずは結晶の取得に向けて活動を続ける。
2、human Monoamine Oxidases (hMO)については、大腸菌での生産量が低かったことから、ラン藻を用いた系を構築することを目的に、すでに作製しているラン藻の発現ベクターをつかって、ラン藻の形質転換を試みたが、コロニーの取得に至っていない。引き続き、ラン藻の形質転換の条件検討を継続する。
3、human Cytochrome P450 2D6 (2D6)創薬標的酵素においては、既報の立体構造解析結果に従い、可溶性向上を目的にF-G loopに位置する230-231位に変異を導入したCYP2D6変異型(L230D/L231R)とCYP2D6野生型の代謝活性の測定を行った。代謝活性が確認できたCYP2D6に対して、X線結晶構造解析に向けた結晶化と等温滴定型カロリメトリー法により、CYP2D6の基質との相互作用の解析を行った。
4、Amino acid Racemase (AR)に関しては、将来の有用化合物合成のための分子設計を見据えて、特徴的なドメイン構造と多量体構造をもつ酵素に着目し、新たな断片化試料に関し、光散乱を用いた分子量の測定を実施した。その結果、断片化したタンパク質を見積もることができ、さらにおおまかな全体構造(多量体構造)を把握することができた。
5、human DOPA decarboxylase (DDC)においても、試料の合成量を増強するために、昨年度作製したラン藻の発現ベクターを使って、ラン藻の形質転換を試みたが、コロニーの取得に至っていない。引き続き、ラン藻の形質転換の条件検討を継続する。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (2 results)

All 2023

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] 等温滴定型カロリメトリーを用いた薬物代謝酵素P450と薬物との相互作用測定法の構築2023

    • Author(s)
      井川 佑美 , 若松 三友紀 , 高橋 知里 , 安達 基泰 , 前川 京子
    • Organizer
      日本薬学会第143回年会
  • [Presentation] 乳酸菌Weissella viridescens JCM1174の新規2ドメイン型アミノ酸ラセマーゼの大腸菌での発現系の構築と酵素科学的特性の解明2023

    • Author(s)
      大島 尚哉 , 安達 基泰 , 加藤 志郎 , 老川 典夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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