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2021 Fiscal Year Annual Research Report

イオンチャネルの動的構造変化の蛍光非天然アミノ酸・遷移金属イオン間FRET解析

Research Project

Project/Area Number 20H03424
Research InstitutionNational Institute for Physiological Sciences

Principal Investigator

久保 義弘  生理学研究所, 分子細胞生理研究領域, 教授 (80211887)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsイオンチャネル / 受容体 / 動的構造変化
Outline of Annual Research Achievements

Two pore channel (TPC3) の膜電位センサーの動的構造変化に焦点をあて、以下の研究を行った。第2リピートの膜電位センサー上のQ507の位置に蛍光をラベルしたコンストラクトを用いたVoltage Clamp Fluorometry (VCF) 解析により、蛍光変化-膜電位関係のプロットにおいて2つの成分が存在すること、その第2相が第1リピートへのPIP2の結合により左側にシフトすること等を明らかにし、その成果を論文として発表した。
さらに、第2リピートの膜電位センサーの動きの2つの相の詳細等を明らかにするために、膜電位固定下tmFRET法の適用に取り組んだ。まず、donor となる蛍光非天然アミノ酸 (fUAA) を第2リピートの膜電位センサーの細胞外側寄りの各アミノ酸残基に一か所ずつ導入し、最適位置としてSer506もしくは Gln508を選択した。次にacceptorとなるTETAC-Cu2+を結合させるためにCys残基を導入する位置の候補を、構造のホモロジーモデル上で上記fUAAの近傍にあることを条件に検討し、第1リピートの第5膜貫通部位の細胞外側寄り、第2リピートの第3膜貫通部位の細胞外側寄りとすることとした。現在、その中から最適コンストラクトの探索を進めている。
また、膜電位センサーを持たないATP受容体チャネルP2X2の動的構造変化と膜電位依存的ゲーティングの分子基盤に関する、fUAAを用いた膜電位固定下蛍光解析法による研究成果をとりまとめ、論文として発表した。
さらに、Gタンパク質結合型内向き整流性K+チャネルを対象に、Gly156Ser等の病態変異体のイオン選択性の異常が第2のイオン透過路の形成によることを明らかにし、論文として発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

蛍光非天然アミノ酸等を用いたイオンチャネルの動的構造変化に関する論文を発表した。また、tmFRET法の確立に向けた実験も進展している。

Strategy for Future Research Activity

TPC3チャネルの膜電位センサーの動的構造変化の2つの相の詳細を明らかにすることを目指し、tmFRET法等の光学解析を用いて研究を推進する。

  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results)

  • [Int'l Joint Research] Univ British Columbia, Vancouver(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      Univ British Columbia, Vancouver
  • [Int'l Joint Research] Sussex Univ(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Sussex Univ
  • [Journal Article] A novel ion conducting route besides the central pore in an inherited mutant of G-protein-gated inwardly rectifying K + channel2022

    • Author(s)
      Chen IS, Eldstrom J, Fedida D, Kubo Y.
    • Journal Title

      Journal of Physiology

      Volume: 600 Pages: 603-622

    • DOI

      10.1113/JP282430.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Phosphoinositide regulates dynamic movement of the S4 voltage sensor in the 2 nd repeat in Two-pore channel 32021

    • Author(s)
      Hirazawa K, Tateyama M, Kubo Y, Shimomura T.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 297 Pages: 101425

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101425.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Voltage-clamp fluorometry analysis of structural rearrangements of ATP-gated channel P2X2 upon hyperpolarization2021

    • Author(s)
      Andriani R, Kubo Y.
    • Journal Title

      Elife

      Volume: 10 Pages: e65822

    • DOI

      10.7554/eLife.65822.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Voltage-clamp fluorometry analysis of the hyperpolarized-induced structural rearrangements of ATP-gated channel P2X22022

    • Author(s)
      Rizki Tsari Andriani, Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
  • [Presentation] Identification of mechanisms underlying the abnormal ion selectivity induced by gene mutations of GIRK2 channel2022

    • Author(s)
      I-Shan Chen and Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
  • [Presentation] Phosphoinositide-dependent modulation of the structural rearrangements of Two-pore channel 3 evoked by depolarization2022

    • Author(s)
      Ki-ichi Hirazawa, Michihiro Tateyama, Takushi Shimomura, Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
  • [Presentation] Analysis of the relationship between channel opening and position of the second S4 helix in two-pore Na+ channel 32022

    • Author(s)
      Takushi Shimomura, Ki-ichi Hirazawa, Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
  • [Presentation] The 4th transmembrane domain of THIK-1 channel plays critical roles in the regulation of the channel activity2022

    • Author(s)
      Michihiro Tateyama, Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
  • [Presentation] Regulation of muscarinic acetylcholine receptor M2 by Sigma-1 receptor2022

    • Author(s)
      Chang Liu, I-Shan Chen, Ruth Murrell-Lagnado, Yoshihiro Kubo
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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