2021 Fiscal Year Annual Research Report
単純ヘルペスウイルス新規遺伝子のさらなる再解読とin depth解析
| Project/Area Number |
20H03492
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
加藤 哲久 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (40581187)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | 単純ヘルペスウイルス / 新規遺伝子 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
近年、リボソーム・プロファイリングや大規模mRNA解析の開発により、ヘルペスウイルスがコードする新規遺伝子に注目が集まっている。最近、申請者は、実際に細胞内で「安定発現」する新規遺伝子を効率的に同定可能な「ウイルス遺伝子decoding法」を開発し、単純ヘルペスウイルス1型(HSV-1)にのみコードされ、脳炎発症を司る非標準的翻訳産物を同定した。本研究では、本技術を基盤に、(i) 長年、解析困難であった「HSV-1リピート領域にコードされる遺伝子」のdecoding法の確立とそのin depth機能解析; (ii) 単純ヘルペスウイルス2型(HSV-2)特異的な遺伝子の同定とそのin depth解析等を実施することで、HSVがコードする遺伝情報のさらなる解読を試みている。
本年度は、昨年に引き続き、上記(i)および(ii)の解析を継続している。(i)に関しては、昨年度、同定したHSV-1リピート領域にコードされる2種類の新規遺伝子に関して、特異的欠損ウイルスの作出を完了した。さらに、培養細胞系およびマウスモデルにおける増殖あるいは病態発現機構の解析を実施したが、野生型ウイルスと有意な差を見出すことはできなかった。一方、HSV-1リピート領域外にコードされる2種類の新規遺伝子を追加同定したことから、これらの新規遺伝子に関しても、特異的欠損ウイルスを作出し、HSV増殖性・病態発現への影響を解析した。興味深いことに、1種類の新規遺伝子において効率的なHSVの神経病原性の発揮への関与が認められた。(ii)に関しては、現在、新規遺伝子を同定するため、質量解析を実施中である。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
昨年度、同定したHSV-1ゲノムのリピート領域にコードされる2種類の新規遺伝子および追加で同定したリピート領域外にコードされる2種類の新規遺伝子に関して、予定していた解析(蛋白質発現の解析・特異的欠損ウイルスの作出・作出した欠損ウイルスの性状解析)を完了し、新規HSV-1神経病原性因子を同定したことから、本申請課題はおおむね順調に進展していると考えられる。また、本年度は、HSV-1およびHSV-2に関して、リピート領域を含む全ウイルスゲノム領域を対象とした新規遺伝子の探索に関する大規模なサンプル調製を完了させ質量解析に着手できた。しかしながら、追加の遺伝子解読は最終的なデータ解析には至っていないこと、同定した新規HSV-1神経病原性因子が如何なる分子機構により、HSV-1の病態発現に関与するのかは不明なままであることから、当初の計画以上に進展しているとは言い難いと考えられる。
|
| Strategy for Future Research Activity |
(i) 同定した新規HSV-1神経病原性因子が、如何なる分子機構により、HSV-1の病態発現に関与するのかをウイルス学的・細胞生物学的解析を通じて明らかとする。特に、電子顕微鏡解析、精製ウイルス粒子への取り込みの有無、細胞内局在の解析、相互作用因子の探索といった解析を実施する。(ii) 着手済みのHSV-1およびHSV-2に関して、リピート領域を含む全ウイルスゲノム領域を対象とした新規遺伝子の探索を完了させ、HSV-1とHSV-2のデータを比較解析することで、血清型特異的なHSV遺伝子の同定を試みる。候補遺伝子に関しては、HSVゲノム編集法を用いて、蛍光蛋白質を候補遺伝子に融合させた形の遺伝子組換えHSVを作出後、FACS解析を実施することで、候補遺伝子の安定発現の有無を検討する。安定的な発現が確認された血清型特異的な新規遺伝子に関しては、定法に従い抗体作出・特異的欠損ウイルスの作出を試みることで、HSV増殖・病態発現機構における役割を順次、解析していく。
|
Research Products
(18 results)
-
[Journal Article] STING signalling is terminated through ESCRT-dependent microautophagy of vesicles originating from recycling endosomes2023
Author(s)
Y. Kuchitsu, K. Mukai, R. Uematsu, Y. Takaada, A. Shinojima, R. Shindo, T. Shoji, S. Hamano, E. Ogawa, R. Sato, K. Miyake, A. Kato, Y. Kawaguchi, M. Nishitani-Isa, K. Izawa, R. Nishikomori, T. Yasumi, T. Suzuki, N. Dohmae, T. Uemura, GN. Barber, H. Arai, S. Waguri and T. Taguchi.
-
Journal Title
Nat Cell Biol.
Volume: 25
Pages: 453-466.
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
-
-
[Journal Article] Role of the orphan transporter SLC35E1 in the nuclear egress of herpes simplex virus 1.2022
Author(s)
F. Maeda, A. Kato, K. Takeshima, M. Shibazaki, R. Sato, T. Shibata, K. Miyake, H. Kozuka-Hata, M. Oyama, E. Shimizu, S. Imoto, S. Miyano, S. Adachi, T. Natsume, K. Takeuchi, Y. Maruzuru, N. Koyanagi, J. Arii, Y. Kawaguchi.
-
Journal Title
J. Virol.
Volume: 96
Pages: e00306-22.
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
