2022 Fiscal Year Annual Research Report
Maximizing the cancer diagnostic information contained in large extracellular vesicles
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20H03538
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
芝 清隆 公益財団法人がん研究会, がん研究所, 特任研究員 (40196415)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大木 暁 公益財団法人がん研究会, 有明病院 消化器化学療法科, 医長 (50348546)
杉山 裕子 公益財団法人がん研究会, 有明病院 細胞診断部, 部長 (80322634)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 細胞外小胞 / Extracellular vesicles / large EVs |
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| Outline of Annual Research Achievements |
細胞外小胞（EV）は、生物体内の液体において、起源や物理化学的性質に関して非常に異質な存在です。EVを診断および治療分野に応用することを考慮して、特定のEVサブクラスを操作的に定義する方法で区別することが非常に重要です。いくつかの区別プロトコルが提案されていますが、それらは主に小型のEVに焦点を当てており、大型EVの異質な性質はまだ十分に調査されていません。本報告では、大型EVを物理化学的性質に基づいてサブグループに分類するために、ヨウ素酸アンモニウムの濃度勾配を用いて粗大な大型EV分画物の中の物質を小型遠心力で移動させ、その後、非階層的データクラスタリングアルゴリズムを用いて勾配を通じた分子の移動パターンを解析する、堆積パターンによるEVの区別（ESP）というプロトコルを開発しました。この方法に基づいて、口腔内液の大型EV分画物中のタンパク質は、小型EV貨物と共有され、免疫関連タンパク質が豊富なタンパク質（グループ1）と、エネルギー代謝およびタンパク質合成に関与するタンパク質（グループ2）、および小胞トラフィックに必要なタンパク質（グループ3）の3つのグループにクラスタリングしました。これらの観察結果は、低速勾配遠心分離法で定義されたEVの物理化学的性質が、細胞内でのその機能と密接に関連していることを示しています。このプロトコルにより、従来の分離法では区別が困難なEV集団の詳細なサブクラス分類が可能になります。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Remarks |
投稿中の論文のbioRxivへのデポジット
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