• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

BRAF変異腫瘍の臓器多様性の解明とtumor agonistic治療への応用

Research Project

Project/Area Number 20H03542
Research InstitutionAichi Cancer Center Research Institute

Principal Investigator

衣斐 寛倫  愛知県がんセンター(研究所), がん標的治療TR分野, 分野長 (00645145)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
KeywordsBRAF / クラス分類 / 獲得変異 / 機能解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、これまで機能が不明とされてきたBRAF変異について、RASを構成するKRAS, NRAS, HRASをすべて欠損したRAS less細胞を用いた機能解析を行ってきた。その結果、2019年時点で機能が明らかでなかったバリアント106種類について、Class 1変異1種類(V600G)、Class 2変異6種類、Class 3変異 10種類を新規に同定するとともに、89種類についてはnon-functional変異であることを明らかにしてきた。本年度は、これら新規に同定された変異について、BRAFタンパク質の配列、構造、相互作用などの公開データを基に立体構造を解析し、機能獲得の理由を明らかにすることを目指し検討を行った。さらに、既知のClass 2、3変異と合わせて、機械学習などの手法を用い、立体構造の変化に基づく、変異BRAF機能予測モデルの作成を試みてきた。機能獲得の理由については構造予測に基づく原因を行っているが、現時点では十分なエビデンスが得られておらず、今後も継続する予定である。機能予測モデルについては、プロトタイプの作成は行えており、今後精度の向上を行う予定である。また、Class I-IIIの各サブタイプについて得られた特徴的な活性化パスウエイについては、現在がん種ごとの違いについて試みている。肺がんについては十分症例が得られていないことから、症例集積が十分であったBRAF変異症例について、Class I-IIIの各サブタイプに特徴的に活性化するパスウエイを明らかにするとともに、腫瘍周囲の微小環境の推定をbioinformaticsの手法用いて解析した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Virginia Commonwealth University/Memorial Sloan Kettering Cancer Center(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Virginia Commonwealth University/Memorial Sloan Kettering Cancer Center
  • [Journal Article] Drug-Tolerant Persister Cells After EGFR Tyrosine Kinase Inhibitor Treatment: Their Origin and the Influences From the Tumor Microenvironment2023

    • Author(s)
      Ebi Hiromichi
    • Journal Title

      Journal of Thoracic Oncology

      Volume: 18 Pages: 399~401

    • DOI

      10.1016/j.jtho.2022.12.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ARAF protein kinase activates RAS by antagonizing its binding to RASGAP NF12022

    • Author(s)
      Su W、Mukherjee R、Yaeger R、Son J、Xu J、Na N、Merna TN、Hechtman J、Paroder V、Lin M、Mattar M、Qiu J、Chang Q、Zhao H、Zhang J、Little M、Adachi Y、Han SW、Taylor BS.、Ebi H、Abdel-Wahab O、de Stanchina E、Rudin CM.、Janne PA.、McCormick F、Yao Z、Rosen N.
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 82 Pages: 2443~2457.e7

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.04.034

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High-risk neuroblastoma with NF1 loss of function is targetable using SHP2 inhibition2022

    • Author(s)
      Cai J、Jacob S、Kurupi R、Dalton KM.、Coon C、Greninger P、Egan RK.、Stein GT.、Murchie E、McClanaghan J、Adachi Y、Hirade K、Dozmorov M、Glod J、Boikos SA.、Ebi H、Hao H、Caponigro G、Benes CH.、Faber AC.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Pages: 111095~111095

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111095

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] KRAS 変異癌における標的治療耐性機構の克服2022

    • Author(s)
      足立 雄太、新津 宏明 、衣斐 寛倫
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] Relationship between circulating tumor DNA and molecular phenotype in colorectal cancer2022

    • Author(s)
      衣斐寛倫
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi