2022 Fiscal Year Annual Research Report
Early diagnosis of pancreatic cancer based on diversity of field defect and molecular genetic approach
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20H03655
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| Research Institution | Asahikawa Medical College |
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Principal Investigator |
水上 裕輔 旭川医科大学, 医学部, 教授 (30400089)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小野 裕介 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院医学研究所, ゲノム診断研究部, 部門長 (40742648)
唐崎 秀則 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院医学研究所, がん生物研究部, 客員研究員 (50374806)
谷上 賢瑞 東京大学, アイソトープ総合センター, 特任准教授 (90648627)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 膵癌 / 多領域シーケンス / IPMN / 早期診断 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
IPMN関連膵癌患者を対象に、切除材料生材料より腫瘍細胞分画を分離し、RNA-seq解析に加えナノポアによるロングリードシーケンシングを行った。各検体において、病理診断用の固定材料を用い、H-E及びCLDN18免疫染色をもとに、切除対象となった主病変（指標病変）並びに上皮内腫瘍から浸潤癌への移行部、多発病変など組織学的な多様性を確認できる多領域分画（関心領域）を設定し、それぞれについてターゲットシーケンシングによる変異プロファイリングを行った。その結果をもとに低異型度から高異型度病変への進展過程で見られる遺伝子異常の蓄積パターンからクローン類縁性の評価と、病変空間内での進化の時間軸の再構築を試みた。また、同一の腫瘍関心領域について、先進ゲノム支援の協力を得て空間トランスクリプトーム解析を行い、遺伝子変異の分布との対比を進めている。現時点でデータ解析中であり、得られた結果をもって2023年度内の論文報告を予定している。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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