• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

The evolutional trajection and precision-medicine to gliomas

Research Project

Project/Area Number 20H03789
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

夏目 敦至  名古屋大学, 未来社会創造機構, 特任教授 (30362255)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大岡 史治  名古屋大学, 医学系研究科, 講師 (10725724)
日野原 邦彦  名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授 (50549467)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords脳腫瘍 / ゲノム
Outline of Annual Research Achievements

我々の基盤研究(Aoki, Natsume, Nat Genet, 2015. Neuro-Oncol 2018)などにより脳腫瘍、特に神経膠腫のゲノム異常が明らかになりつつある。神経膠腫の8割はIDH変異が腫瘍発生に関与し、乏突起膠腫系と星細胞腫系の系譜に分かれ、それぞれ特有の遺伝子変化を獲得しながら、時間空間的に指向性を持って悪性転化・進展する(腫瘍進化的トラジェクション)。また神経膠腫の残り2割はEZH2によるヒストンメチル化が腫瘍発生の契機となる(Ohka, Natsume, Cancer Res, 2019)。予後改善には腫瘍発生から診断から悪性転化から腫瘍死という時間軸のなかで悪性転化を抑制・遅延することが鍵となる。しかしIDH1変異、EZH2過剰発現後、悪性転化に向かう時間空間的な指向は依然不明である。これまでは腫瘍塊からエクソン、RNA、DNAメチル化、全ゲノム、ヒストン修飾を次世代シークエンスして知見を得てきた。そして今後は単一細胞解析が主流となると考えられるが不均一細胞群の個々の標識などに障壁がある。本研究では、単一細胞をDNAバーコードラベルし、20,000種類の単一遺伝子をCRISPR/Cas9ノックアウトするという我々が樹立した新規アプローチで、腫瘍進化的トラジェクションを明らかにすることができた。これにより、次世代個別化医療を目指す基盤ができた。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2023

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Defining super-enhancers by highly ranked histone H4 multi-acetylation levels identifies transcription factors associated with glioblastoma stem-like properties2023

    • Author(s)
      Das Nando D.、Chang Jen-Chien、Hon Chung-Chau、Kelly S. Thomas、Ito Shinsuke、Lizio Marina、Kaczkowski Bogumil、Watanabe Hisami、Katsushima Keisuke、Natsume Atsushi、Koseki Haruhiko、Kondo Yutaka、Minoda Aki、Umehara Takashi
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 24 Pages: 0

    • DOI

      10.1186/s12864-023-09659-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prediction of Tumor Development and Urine-Based Liquid Biopsy for Molecule-Targeted Therapy of Gliomas2023

    • Author(s)
      Kurimoto Michihiro、Rockenbach Yumi、Kato Akira、Natsume Atsushi
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 14 Pages: 1201~1201

    • DOI

      10.3390/genes14061201

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Haploinsufficiency of NFKBIA reshapes the epigenome antipodal to the IDH mutation and imparts disease fate in diffuse gliomas2023

    • Author(s)
      Bredel Markus、Espinosa Llus、Kim Hyunsoo、Scholtens Denise M.、McElroy Joseph P.、Rajbhandari Rajani、Meng Wei、Kollmeyer Thomas M.、Malta Tathiane M.、Quezada Michael A.、Natsume Atsushi、Ogawa Seishi、Weber Ruthild G.、Pugh Stephanie L.、Chakravarti Arnab
    • Journal Title

      Cell Reports Medicine

      Volume: 4 Pages: 101082~101082

    • DOI

      10.1016/j.xcrm.2023.101082

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mutation detection of urinary cell-free DNA via catch-and-release isolation on nanowires for liquid biopsy2023

    • Author(s)
      Takahashi Hiromi、Yasui Takao、Hirano Masaki、Shinjo Keiko、Miyazaki Yusuke、Shinoda Wataru、Hasegawa Takeshi、Natsume Atsushi、Kitano Yotaro、Ida Mikiko、Zhang Min、Shimada Taisuke、Paisrisarn Piyawan、Zhu Zetao、Ohka Fumiharu、Aoki Kosuke、Rahong Sakon、Nagashima Kazuki、Yanagida Takeshi、Baba Yoshinobu
    • Journal Title

      Biosensors and Bioelectronics

      Volume: 234 Pages: 115318~115318

    • DOI

      10.1016/j.bios.2023.115318

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Easy-to-use machine learning system for the prediction of IDH mutation and 1p/19q codeletion using MRI images of adult-type diffuse gliomas2023

    • Author(s)
      Nishikawa Tomohide、Ohka Fumiharu、Aoki Kosuke、Suzuki Hiromichi、Motomura Kazuya、Yamaguchi Junya、Maeda Sachi、Kibe Yuji、Shimizu Hiroki、Natsume Atsushi、Innan Hideki、Saito Ryuta
    • Journal Title

      Brain Tumor Pathology

      Volume: 40 Pages: 85~92

    • DOI

      10.1007/s10014-023-00459-4

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Urine-based genetic diagnosis of brain tumors.2023

    • Author(s)
      Atsushi NATSUME, Takao YASUI, Yoshinobu BABA
    • Organizer
      FIBER International Summit for Nucleic Acids 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA/RNAを移動する電子速度の測定によるIDH1変異の検出2023

    • Author(s)
      夏目敦至、Fun Shuya, 平野雅規、高山和也、橋本克訓、丸山 厚、藤塚 守
    • Organizer
      第41回日本脳腫瘍病理学会
  • [Presentation] Urine-based genetic diagnosis of brain tumors2023

    • Author(s)
      Atsushi NATSUME, Takao YASUI, Yoshinobu BABA
    • Organizer
      第61回日本癌治療学会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi