2022 Fiscal Year Annual Research Report
スーパーエンハンサーを標的とした口腔癌薬剤耐性機構の解明による治療法開発
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20H03883
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
鵜澤 一弘 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (30302558)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊豫田 学 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (40431746)
中嶋 大 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (50431747)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | スーパーエンハンサー / CHIP-Seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
H3K27acおよびBRD4によるCHIP-Seq法で，Cetuximab (CTX) 耐性口腔癌細胞株(HSC-3-R・SAS-R）に特異的なスーパーエンハンサー領域を検索・同定した．CTX耐性口腔癌細胞株に共通したスーパーエンハンサー領域は68領域であり，その領域の標的候補遺伝子を131個同定した．さらに，131の標的候補遺伝子に対してThe Cancer Genome Atlas (TCGA) を用いて臨床検体における標的遺伝子の発現量や5年生存率について統計的に解析した．131遺伝子の中で，34遺伝子が有意に（p＜0.05）口腔癌組織で発現が上昇しており、そのうち4遺伝子（CARD19・CENPA・PISD・TRAF2）は5年生存率と有意な（p＜0.05）相関を示した．UCSC Genome Browserで確認すると，上記の4遺伝子（CARD19・CENPA・PISD・TRAF2）は，SE領域もしくはその上流に位置していた．CTX耐性口腔癌細胞株においてもmRNAレベルで有意な発現亢進を認め，CTX耐性スーパーエンハンサーの標的遺伝子として抽出された．さらに，Gene set enrichment analysis (GSEA)解析では，上記4遺伝子高発現の群ではcell cycleや細胞修復に関する遺伝子セットが有意に濃縮されていた．低発現の群では, PI3K-Akt-mTOR-signalingやchemokine signalingの遺伝子セットが有意に濃縮されていた．本研究によりCTX耐性スーパーエンハンサーの存在が明らかとなった．さらに，口腔癌患者の予後と深く関与するCTX耐性スーパーエンハンサーの標的遺伝子を見出した．今後，同定された標的遺伝子のCTXシグナルにおける詳細な役割を分析することが，CTX耐性克服の新たな治療戦略になると考えられた．
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Genome-Wide Super-Enhancer-Based Analysis: Identification of Prognostic Genes in Oral Squamous Cell Carcinoma2022
Author(s)
Saito T, Asai S, Tanaka N, Nohata N, Minemura C, Koma A, Kikkawa N, Kasamatsu A, Hanazawa T, Uzawa K, Seki N
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Journal Title
Int J Mol Sci.
Volume: 23(16)
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
