2022 Fiscal Year Final Research Report

Uncovering transmission of tuberculosis based on spatial molecular epidemiology with person flow data

Research Project

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Project/Area Number	20H03932
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Allocation Type	Single-year Grants
Section	一般
Review Section	Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
Research Institution	Osaka Metropolitan University (2022) Osaka City University (2020-2021)
Principal Investigator	WADA Takayuki 大阪公立大学, 大学院生活科学研究科, 教授 (70332450)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	藤原直哉東北大学, 情報科学研究科, 准教授 (00637449) 中谷友樹東北大学, 環境科学研究科, 教授 (20298722) 山本香織地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主任研究員 (70649011) 竹内昌平長崎県立大学, 看護栄養学部, 講師 (80432988) 翁長朝功東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (90823922)
Project Period (FY)	2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords	感染症 / 結核 / 分子疫学 / 空間疫学 / ゲノミクス / 人流解析
Outline of Final Research Achievements	Understanding pathogen transmission and implementing preventive measures are essential for public health. It is crucial to comprehend pathogen transmission routes and devise preventive measures against widespread outbreaks. Our study focused on tuberculosis (TB) which can transmit via aerosols. We sequenced TB strains from patients before the COVID-19 era, then used phylogenetic analysis to extract and visualize transmission cases. Furthermore, we evaluated a method for determining local community structure based on aggregated daily contact data obtained from a traffic flow survey. Additionally, we developed a tool utilizing real-time GPS data in our study area to quantify contact between individuals.
Free Research Field	公衆衛生学
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	新型コロナウイルスの感染流行により、病原体伝播が引き起こされる背景を解き明かす研究需要は急激に高まった。本研究は、患者への聞き取り調査や遺伝子解析による伝播経路の解明が進んでいる結核を対象として、その伝播事例を詳細にデータ化するとともに、感染伝播の要因となりうる患者間の地域的近接性や、社会全体の人流との相関を調べようとするものである。ポストコロナ期における「感染症に強い社会」の構築に向けた情報活用のあり方を模索できる点で、社会的意義は大きい。古来より国民病とされてきた結核は今や低蔓延期に移行しつつも、再発や薬剤耐性などの懸念がなお残り、その抑制に向けた結核対策を底上げしうる研究でもある。