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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Rice NLR genes, their function and evolution

Research Project

Project/Area Number 20H05681
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

寺内 良平  京都大学, 農学研究科, 教授 (50236981)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤崎 恒喜  公益財団法人岩手生物工学研究センター, 園芸資源研究部, 主任研究員 (30626510)
阿部 陽  公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主席研究員 (80503606)
清水 元樹  公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主任研究員 (90734343)
Project Period (FY) 2020-08-31 – 2025-03-31
Keywords植物ー病原菌相互作用 / 共進化 / イネ / いもち病 / 抵抗性 / エフェクター
Outline of Annual Research Achievements

(1)英国Banfield教授グループと共同研究を実施し、Pikp-1のIDであるHMAドメインをsHMA1の配列と交換することによりPik-1 NLRをエンジニアし、現在まで認識されなかったいもち病菌エフェクターAVR-PikCおよびAVR-PikFを認識するNLR作成に成功し、論文公表した (Maidement et al. 2023 eLife)。
(2)イネ抵抗性遺伝子Pias-1の単離同定およびPias/Pia遺伝子座の進化解析について論文公表した(Shimizu et al. 2022 PNAS)。
(3) AVR-Pikの宿主標的であるsHMAタンパク質の機能解明を進めた。イネsHMAの一部は、いもち病菌感染にとって重要な罹病性因子であり、AVR-PikはsHMAに結合して安定化することを示した。本成果は現在論文準備中である。
(4) Pikアリルの中で、これまで対応する非病原力エフェクターが未同定であったPikSが認識する新規のイネいもち病菌のエフェクター(Mgk1)を単離同定し、論文公表した(Sugihara et al. 2023 PLoS Biology)。
(5) イネ抵抗性タンパク質Piiは、Pii-2 IDのNOIドメインを介してOsExo70F2/F3と複合体を形成し、後者と結合するAVR-Piiと間接的に相互作用する。OsExo70F2/AVR-Piiの結合結晶構造解明に成功し、論文公表した(De la Concepcion et al. 2022 PNAS)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画に予定した研究が順調に進行していると判断する。

Strategy for Future Research Activity

(1) Pias/AVR-Piasの直接結合の確認を、イネプロトプラストを用いたタンパク質一過的発現により、共免疫沈降法、AlphaScreen法により実施し、PiaとPiasのSensor NLRのID交換によるAVR認識特異性の交換実験をふまえ、任意のIDを挿入しても機能するようなPias/Pia Sensor NLRとHelper NLRの骨格(scaffold)のエンジニアリングに着手する。
(2)イネsHMA遺伝子の機能解明、イネRIN4タンパク質の機能解明。RIN4/Exo70相互作用とAVR-Piiの病原作用の解明、イネDUF761タンパク質の機能解明を進める。
(3)新規に単離同定されたイネNLR-いもち病菌AVRの相互作用を解明する。
(4) NLR遺伝子の体系的なノックアウトにより、NLRによる細胞死を負に制御する遺伝子を同定する。

  • Research Products

    (12 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] The Sainsbury Laboratory/John Innes Centreohn(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      The Sainsbury Laboratory/John Innes Centreohn
  • [Journal Article] Disentangling the complex gene interaction networks between rice and the blast fungus identifies a new pathogen effector2023

    • Author(s)
      Sugihara Yu、Abe Yoshiko、Takagi Hiroki et al. Kamoun Sophien、Terauchi Ryohei、Fujisaki Koki
    • Journal Title

      PLOS Biology

      Volume: 21 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.3001945

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A genetically linked pair of NLR immune receptors shows contrasting patterns of evolution2022

    • Author(s)
      Shimizu Motoki、Hirabuchi Akiko、Sugihara Yu、Abe Akira、Takeda Takumi、Kobayashi Michie、Hiraka Yukie、Kanzaki Eiko、Oikawa Kaori、Saitoh Hiromasa、Langner Thorsten、Banfield Mark J.、Kamoun Sophien、Terauchi Ryohei
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1073/pnas.2116896119

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Rice apoplastic CBM1-interacting protein counters blast pathogen invasion by binding conserved carbohydrate binding module 1 motif of fungal proteins2022

    • Author(s)
      Takeda Takumi、Takahashi Machiko、Shimizu Motoki、Sugihara Yu、Yamashita Tetsuro、Saitoh Hiromasa、Fujisaki Koki、Ishikawa Kazuya、Utsushi Hiroe、Kanzaki Eiko、Sakamoto Yuichi、Abe Akira、Terauchi Ryohei
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 18 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1010792

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A blast fungus zinc-finger fold effector binds to a hydrophobic pocket in host Exo70 proteins to modulate immune recognition in rice2022

    • Author(s)
      De la Concepcion Juan Carlos、Fujisaki Koki、Bentham Adam R.、Cruz Mireles Neftaly、Sanchez de Medina Hernandez Victor、Shimizu Motoki、Lawson David M.、Kamoun Sophien、Terauchi Ryohei、Banfield Mark J.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Pages: 1-8

    • DOI

      10.1073/pnas.2210559119

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation of Pikps, an allele of Pik from the aus rice cultivar Shoni2022

    • Author(s)
      Kovi Basavaraj、Sakai Toshiyuki、Abe Akira、Kanzaki Eiko、Terauchi Ryohei、Shimizu Motoki
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 97 Pages: 229~235

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00002

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Coevolution of rice paired NLRs and Magnaporthe effectors2023

    • Author(s)
      Ryohei Terauchi
    • Organizer
      International Plant Helper- and Paired NLR Mini Symposium, Tuebingen, Germany
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular Interactions between Rice NLRs and Magnaporthe Effectors2022

    • Author(s)
      Ryohei Terauchi
    • Organizer
      12th US-Japan Seminar in Plant Pathology, Cornell University, NY, USA
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Genomics reveals evolution of rice paired NLRs2022

    • Author(s)
      Ryohei Terauchi
    • Organizer
      2nd International Symposium on Plant Biotic Interactions and Plant Health, Wuhan, China
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] イネのいもち病抵抗性機構の解明―イネ抵抗性タンパク質の付加ドメイン―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-07-22-2

  • [Remarks] ゲノム解読による植物病害抵抗性の解明―イネ-いもち病菌「遺伝子対遺伝子」の戦い

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2023-02-01

  • [Remarks] いもち病からイネを守る細胞外タンパク質 (CBMIP) の発見―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-09-30

URL: 

Published: 2023-12-25  

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