2021 Fiscal Year Annual Research Report
膵癌における新規circular RNAの機能解明とバイオマーカーへの応用
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20J11303
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
清宮 崇博 東京大学, 大学院医学系研究科, 特別研究員(PD)
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| Project Period (FY) |
2020-04-24 – 2022-03-31
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| Keywords | circular RNA / 膵癌 / 環状RNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
前年度までに、膵癌と正常膵組織におけるcircRNAの網羅的な発現解析により膵癌で高発現する新規circRNAを同定し、この新規circRNAが膵癌およびIPMNの新たな診断バイオマーカーとして有用である可能性を見出した。
本年度は、さらに多数症例を用いてcircRNAの網羅的な発現解析を行うことにより、膵癌で異常発現するcircRNAを探索した。CPTAC3データベースに公開されている膵癌140例と正常21例における環状RNAの発現を比較し、184個の有意に発現変動する環状RNAを同定した(q<0.05)。膵癌で有意に高発現する環状RNAのうち、正常との発現量の差が最も大きい環状RNA(circX)に着目した。
この環状RNAはX遺伝子のエクソン25の5’末端とエクソン38の3’末端が結合して環状化していることをサンガーシークエンスによって確認した。
このX遺伝子由来環状RNAは、膵癌においては38% (53/140例) で発現していたのに対して、正常における発現は0%（0/21例)であった。
膵癌のcellularityとcircXの発現の関係を明らかにするために、膵癌140例をcellularityの高い群 (n=105) と低い群 (n=35) に分類しcircXの発現を比較した。CircXはcellularityが高い群においては40% (42/105例) で発現していたのに対して、cellularityが低い群においては31% (11/35例) で発現しており、cellularityとcircXの発現の有無には有意な相関を認めなかった。
最後に、circXのバイオマーカーとしての応用可能性を検討するために、膵癌患者と健常者の血清中のcircXの発現量をデジタルPCRで測定した。血清中のcircXの発現量は極めて少なく、膵癌患者と健常者の間で有意な差は認めなかった。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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