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2021 Fiscal Year Annual Research Report

DNA複製複合体の構造変換による、RNAプライマー鎖長の制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20J12260
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

沖 啓輔  九州大学, 生物資源環境科学府, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2022-03-31
Keywordsアーキア / DNA複製 / DNAポリメラーゼ / プライマーゼ / ヘリカーゼ / 超分子複合体
Outline of Annual Research Achievements

アーキアの複製ポリメラーゼであるPolDが、CMGヘリカーゼ (MCM-GINS-GAN複合体) とプライマーゼのブリッジとなることでレプリソームを形成することを昨年度報告した。そこで、CMGヘリカーゼとPolDの複合体形成に関してさらに詳細な解析を行ったところ、GINSが2分子のPolDと強固に結合することが証明された。次にこの相互作用は、PolDのDP1サブユニットのN末端ドメイン(DP1N)とGINSのGins51サブユニットのC末端ドメイン(Gins51C)との結合によることを示し、DP1N-Gins51C-GAN三者複合体の結晶構造解析を行なった。さらに、DP1N-Gins51Cを介した結合が存在する条件でのみ、PolDがCMG様ヘリカーゼの一本鎖DNA依存性のヘリカーゼ活性を促進することを発見した。すなわち、リーディング鎖上を進行するCMGヘリカーゼにPolDが結合することによって、親DNA二本鎖を解く反応が促進されるという、ヘリカーゼ-ポリメラーゼ間の機能的な相互作用を初めて実験的に証明した。これらの結果をまとめて論文発表を行なった。
CMGヘリカーゼとPolDの強固な結合とは対照的に、PolDとプライマーゼの複合体形成はPolD-PCNA-DNA複合体の形成とともに解消される。PolDとプライマーゼの相互作用部位についても詳細な構造解析が必要と考えた。PolDのDP2サブユニットのcPIPを模した合成ペプチドを設計し、精製したPriLのN末端ドメイン (PriLN)と混合して結晶構造解析を行なったところ、PriLNに存在する疎水性ポケットに、ヘリックス構造を形成したDP2cPIPが結合することが明らかとなり、部位特異的変異体を用いた生化学的解析によって複合体の形成における重要性が証明された。これらの結果をまとめて学会発表を行なった。論文投稿準備を進めている。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Family D DNA polymerase interacts with GINS to promote CMG-helicase in the archaeal replisome2021

    • Author(s)
      Keisuke Oki, Nagata Mariko, Takeshi Yamagami, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Takuji Oyama, Yoshizumi Ishino
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/nar/gkab799

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 超好熱性アーキア Thermococcus kodakarensisのレプリソームにおけるPolD上でのプライマーゼからPCNAへの置換による機能変換2021

    • Author(s)
      沖啓輔、山上健、永田麻梨子、真柳浩太、白井剛、安達成彦、沼田倫征、松本俊介、石野園子、石野良純
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
  • [Presentation] Thermococcus kodakarensisのDNA複製複合体レプリソームの機能的構造変換機構2021

    • Author(s)
      沖啓輔、永田麻梨子、山上健、真柳浩太、白井剛、大山拓次、安達成彦、沼田倫征、松本俊介、石野園子、石野良純
    • Organizer
      極限環境生物学会2021年度(第22回)年会
  • [Presentation] Structural and functional analysis of the interaction between family D-DNA polymerase and CMG-like helicase in the replisome of Thermococcus kodakarensis.2021

    • Author(s)
      沖啓輔、永田麻梨子、山上 健、沼田倫征、石野園子、大山拓次、石野良純
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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