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2021 Fiscal Year Annual Research Report

合成キノン類を駆使した呼吸鎖複合体-Iの基質認識機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20J13148
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

宇野 晋平  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2022-03-31
Keywords呼吸鎖複合体-I / ユビキノン / 光親和性標識 / ミトコンドリア / ケミカルバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

光反応性基であるジアジリンとヨウ素をmetaあるいはpara置換した2系統の光反応性UQ類を合成した。para体とmeta体を比較するとpara体のほうが約1Å程嵩高い。亜ミトコンドリア粒子(SMPs)を用いて複合体-Iにおける電子伝達活性を評価したところ、2系統のpUQ類は同程度の活性を示した。しかし、単離複合体-Iにおける電子受容活性を評価すると、meta体に対してpara体の活性が顕著に低下することがわかった。これは単離複合体-Iにおいてのみ、わずかな立体障害の差異を大きく反映していることを示していると考えられる。
その後、ヨウ素を放射性同位体125Iに置換して光親和性標識実験を行ったところ、複合体-Iのキノン反応ポケットを構成するサブユニットの1つであるND1が特異的に標識されることがわかった。SMPs中の“ネイティブ”複合体-Iと単離複合体-Iのそれぞれにおいて、標識されたND1を分離して消化酵素切断に供したところ、両者の間で結合部位にわずかな違いがあることがわかった。これらの結果は、“ネイティブ”複合体-Iと単離複合体-Iの間にはキノン反応ポケットの構造に差異があることを示唆している。
さらに、“ネイティブ”複合体-IにおいてND1サブユニットにおける結合部位を比較すると、大きく異っていることがわかった。さらに、キノン反応ポケット近傍に結合する複数の阻害剤を用いて光反応性キノンとの拮抗試験を行ったところ、光反応性キノンの側鎖構造を反映してそれぞれ異なる拮抗パターンを示すことがわかった。これらの結果は、光反応性キノンは側鎖構造に依存して異なる侵入経路を経て電子を受容することを示唆している。
以上の得られた結果は、現在論文としてまとめ投稿中である。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] The side chain of ubiquinone plays a critical role in Na+ translocation by the NADH-ubiquinone oxidoreductase (Na+-NQR) from Vibrio cholerae2022

    • Author(s)
      Ishikawa Moe、Masuya Takahiro、Kuroda Seina、Uno Shinpei、Butler Nicole L.、Foreman Sara、Murai Masatoshi、Barquera Blanca、Miyoshi Hideto
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      Volume: 1863 Pages: 148547~148547

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2022.148547

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける人工ユビキノン類の多様な反応機構2021

    • Author(s)
      宇野晋平
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] 光親和性ユビキノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン反応ポケットの構造特性の解明2021

    • Author(s)
      宇野晋平
    • Organizer
      日本農薬学会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける人工ユビキノン類の多様な反応機構2021

    • Author(s)
      宇野晋平
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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