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2021 Fiscal Year Annual Research Report

過冷却水中における協働的運動の支配因子:多自由度系における反応座標探索手法の開発

Research Project

Project/Area Number 20J14619
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

菊辻 卓真  大阪大学, 基礎工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2022-03-31
Keywordsソフトマター物理 / 計算科学 / 水素結合 / 過冷却水
Outline of Annual Research Achievements

過冷却水中で引き起こされる、水素結合破断に伴う水分子間の協働的運動を明らかにするために、3つの研究を行なった。
(1)過冷却水中での水素結合破断に伴う多体構造間の構造変化を理解するために、マルコフ状態間モデルを用いることで、水分子3分子間で引き起こされるアクセプター切り替え運動に伴う3分子間の構造および周囲の水素結合本数の変化を解析した。この研究により深い過冷却状態では水素結合ネットワークに沿って引き起こされるが顕著となることを明らかにした。
(2)過冷却水中でみられるケージ効果を理解するために、水素結合ネットワークのダイナミクスを基準に分子の運動をケージに囚われた状態とケージから解放された状態に分割を行なった。さらに連続時間型ランダムウォークモデルに則り、ケージの時間に対する特性を求め、全体の運動性との間を形式化した。これにより分子レベルの局所的な構造変化から、全体の運動性が示す過冷却水中での複雑な温度依存性を解明した。
(3) 分子動力学計算で得られた状態間での遷移確率の結果と分子構造の関係を深層学習により求め、説明可能AIを利用することで、遷移を決定する分子構造の抽出を行なった。深層学習を利用することで、過冷却水中での水素結合破断のように多くの分子を伴う運動についても、その遷移を支配する構造の特定が期待される。
この3つの研究結果についてそれぞれまとめ、論文として発表・発表準備中である。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Transition pathway of hydrogen bond switching in supercooled water analyzed by the Markov state model2021

    • Author(s)
      Takuma Kikutsuji, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 154 Pages: 234501

    • DOI

      10.1063/5.0055531

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Breakdown of the Stokes-Einstein relation in supercooled liquids: A cage-jump perspective2021

    • Author(s)
      Raffaele Pastore, Takuma Kikutsuji, Francesco Rusciano, Nobuyuki Matubayasi, Kang Kim, Francesco Greco
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 155 Pages: 114503

    • DOI

      10.1063/5.0059622

  • [Presentation] 過冷却水中での水素結合破断に伴う多体構造変化:マルコフプロセスで記述する遷移ネットワーク2021

    • Author(s)
      菊辻卓真,金鋼,松林伸幸
    • Organizer
      第23理論化学討論会
  • [Presentation] ケージ・ジャンプでモデル化される拡散係数と構造緩和時間2021

    • Author(s)
      菊辻卓真,金鋼, F. RusianoA, R. PastoreA, F. GrecoA, 松林伸幸
    • Organizer
      第35回分子シミュレーション討論会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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