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2021 Fiscal Year Annual Research Report

植物の葉器官のサイズ制御を司る内生代謝プログラムの解明

Research Project

Project/Area Number 20J20901
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

多部田 弘光  東京大学, 総合文化研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2023-03-31
Keywords植物 / 葉器官 / fugu5変異体 / 補償作用 / サイズ制御 / メタボローム解析
Outline of Annual Research Achievements

葉器官を構成する細胞の数が減少した場合、それを相補するかのように葉肉細胞が顕著に肥大する「補償作用」という現象が知られている。令和3年度も昨年度に引き続き、補償作用を示すfugu5変異体を用いて、葉を構成する細胞数と細胞サイズの協調性を担う鍵因子群の同定を目指した。
今年度中は、主に昨年度に特定した鍵代謝産物候補を対象に検証実験を試みた。そこで、添加実験系を構築した後、その影響を定量的に解析した。その結果、当該代謝産物は濃度依存的にfugu5の補償的細胞肥大を促進することが明確になった。
次に、ガスクロマトグラフィー質量分析装置及び液体クロマトグラフィー質量分析装置のを駆使した「マルチプラットフォームワイドターゲットメタボロミクス」を行ない、当該鍵代謝産物とその周辺代謝産物の変動を追跡した。その過程で、fugu5の子葉における三次元相関代謝ネットワークを構築し、大規模時系列代謝データを整理した。その結果、fugu5の補償的細胞肥大に関与すると考えられる新たな「鍵代謝経路」を見いだすことに成功した。
現在、同定された複数の鍵代謝産物が顕著な細胞肥大をもたらす作用機序を解明するため、RNA-Seq を用いたトランスクリプトームシーケンス解析に着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

令和3年度は、央代謝だけではなく、植物特化代謝産物にも焦点を当てたメタボローム解析を推進することで、細胞サイズの増大をもたらす鍵代謝産物の特定と、それに関する関連代謝経路の推定に成功した。また現在は遺伝学的手法により代謝産物の影響を確認するため、関連代謝経路に欠損を持つ変異体獲得を行なっており、fugu5との二重変異体の作出が順調に進んでいる。加えて、当初の予定通り、トランスクリプトームとメタボロームデータとの統合オミクス解析の準備を進めており、数理解析に最適なアルゴリズムの検討も同時に行なっている。
以上から、本研究課題の進捗状況は順調であるといえる。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度の研究成果をふまえ、今後以下のように実験を推進する。
(1) 得られる予定の代謝酵素の変異体を用いて、鍵代謝産物に関わる関連代謝反応がfugu5の補償的細胞肥大に及ぼす影響を定量化することで、細胞サイズの協調性を担う代謝経路のさらなる詳細な解明を目指す。
(2) 引き続き時系列トランスクリプトームシーケンス解析を進め、fugu5における統合オミクス解析を遂行し、内生代謝プログラムに寄与する鍵遺伝子群を同定する。
(3)得られた研究成果を速やかにまとめ、学術論文や学会発表等で報告する。

  • Research Products

    (16 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (15 results)

  • [Journal Article] An auxin signaling network translates low-sugar-state input into compensated cell enlargement in the fugu5 cotyledon2021

    • Author(s)
      Tabeta Hiromitsu、Watanabe Shunsuke、Fukuda Keita、Gunji Shizuka、Asaoka Mariko、Hirai Masami Yokota、Seo Mitsunori、Tsukaya Hirokazu、Ferjani Ali
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 17 Pages: e1009674

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1009674

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナの初期発生及びピロリン酸恒常性におけるPPsPase1,VHP2;1,VHP2:2の役割の解明2022

    • Author(s)
      東條宏史,多部田弘光,平井優美,JavotHelene,AliFerjani
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] hope-1 変異体の胚軸における遺伝学およびオミクス解析を駆使した分化維持機構の解明2022

    • Author(s)
      白鳥みづき,高橋和希,多部田弘光,古賀皓之,郡司玄,佐藤心朗,堀口吾朗,平井優美,塚谷裕 一 ,フェルジャニアリ
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ImportantrolesofPGDH-mediatedserinesynthesisinthallusgrowth,malegametogenesisand metabolisminMarchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      MengyaoWang,HiromitsuTabeta,KinukaOhtaka,AyukoKuwahara,KiminoriToyooka, MayukoSato,MayumiWakazaki,HiromichiAkashi,TakayukiKohchi,RyuichiNishihama, KeisukeYoshida,AliFerjani,MasamiYokotaHirai
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] fugu5 の初期発生に生じる代謝リプログラミングの解析と補償的細胞肥大を促進する鍵代謝産物の同定2022

    • Author(s)
      多部田弘光,佐藤心郎,郡司玄,塚谷裕一,平井優美,フェルジャニアリ
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] メタボローム解析によるfugu5変異体の補償的細胞肥大に関与する鍵代謝産物の探索2021

    • Author(s)
      多部田弘光,佐藤心郎,郡司玄,塚谷裕一,平井優美,フェルジャニアリ
    • Organizer
      新学術領域「植物構造オプト」若手ワークショップ
  • [Presentation] Class II補償作用に見られる細胞肥大はV-ATPaseを介して引き起こされる2021

    • Author(s)
      桑原隆志, 多部田弘光, 郡司玄, Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] Class I補償作用におけるV-ATPase活性および内生IAA量が与える影響の遺伝学的解析2021

    • Author(s)
      塚原郁美, 郡司玄, 多部田弘光, Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] 器官サイズや代謝制御におけるピロフォスファターゼPPsPase1の役割の解明2021

    • Author(s)
      東條 宏史,多部田 弘光,平井 優美, Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] hope-1の胚軸に自発的に生じるカルスの遺伝学的およびオミクス解析を駆使した形成メカニズムの解明2021

    • Author(s)
      白鳥 みづき, 高橋 和希, 多部田 弘光, 古賀 皓之, 郡司 玄, 佐藤 心朗, 堀口 吾朗, 平井 優美, 塚谷裕一, Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] ピロリン酸の過剰蓄積は子葉の初期発生において細胞自律的に影響する2021

    • Author(s)
      郡司 玄,川出健介,多部田 弘光,堀口吾朗,浅岡真理子,及川彰,平井 優美,塚谷 裕一,Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] fugu5の補償的細胞肥大を特異的に促進する鍵代謝産物の特定2021

    • Author(s)
      多部田 弘光, 郡司 玄, 塚谷 裕一, 平井 優美, Ferjani Ali
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会
  • [Presentation] Excess pyrophosphate triggers leaf developmental defects cell-autonomously in fugu52021

    • Author(s)
      Shizuka Gunji, Kensuke Kawade, Hiromitsu Tabeta, Gorou Horiguchi, Mariko Asaoka, Akira Oikawa, Masami Hirai, Hirokazu Tsukaya, Ali Ferjani
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] 器官サイズや代謝制御におけるピロフォスファターゼ PPsPase1 の役割の解明2021

    • Author(s)
      東條宏史,多部田弘光,平井優美,フェルジャニアリ
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] hope-1 の胚軸に自発的に生じるカルスの遺伝学的およびオミクス解析を駆使した形成メカニズ ムの解明2021

    • Author(s)
      白鳥みづき,高橋和希,多部田弘光,古賀皓之,郡司玄,佐藤心朗,堀口吾朗,平井優美, 塚谷裕一,フェルジャニアリ
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] メタボローム解析によるfugu5 変異体の補償的細胞肥大に関与する鍵代謝産物の探索2021

    • Author(s)
      多部田弘光,郡司玄,塚谷裕一,平井優美,フェルジャニアリ
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会

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Published: 2022-12-28  

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