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2021 Fiscal Year Research-status Report

Electron and NMR nano-crystallography for pharmaceutical formulation

Research Project

Project/Area Number 20K05483
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

西山 裕介  国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, ユニットリーダー (20373342)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords固体NMR / 電子回折 / 結晶構造 / 低分子医薬品 / 結晶多形
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題は、製剤中の低分子医薬品(API: active pharmaceutical ingredient)の結晶構造を一切の前提条件なしに解くことを目的とする。そのために、製剤中に含まれる微小な単結晶から3D電子回折法(microED)を用いて骨格構造を決め、固体NMRを用いて元素の帰属及び水素位置の決定を行う。初年度(2020年度)は、製剤中のAPIからのNMR信号の選択的観測法及び固体NMRを用いた原子核間距離の決定法の開発を行った。2021年度には、窒素原子の99%を占める14Nの同位体の活用、および固体NMR1H/1H相関測定の高精度化・高選択化を行った。1Hおよび14NともにAPIには欠かせない元素である一方、14NはNMR測定が難しく(そのため、ほとんどの窒素NMRでは低感度の15Nを観測する)、1Hは分解能が不足していた。そこで、1H-14Nの長距離相関固体NMR法を開発し信号の帰属の高速化を実現した。本研究はPhysChemChemPhys誌に掲載が決定し、非常に高い評価を得ている。その結果としてHot articleへの採択が決定し、またおもて表紙へのイラストの掲載も決定している。1H DQ/SQ、1H TQ/SQ相関固体NMRを法を開発し1Hの分解能向上を実現した。これらの基礎固体NMR技術を活用し、microED測定と双極子相互作用を用いた固体NMRによる定量距離測定による微小単結晶からの構造解析に成功した。本プロジェクトではmicroED測定だけでは、決めきれない窒素原子の位置(もしくは炭素・窒素の帰属)および、水素原子の位置を正確に決定するうえで固体NMRが重要な役割を果たす。このように二つの異なる手法を有機的に活用し、その基礎技術開発からプロジェクトを遂行することにより、本研究課題の目標達成に向けて着実に進展している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究計画にのっとってNMRを用いた製剤中のAPIの選択的観測法、水素位置の精密測定による塩・共結晶の判別方法などをすでに開発・応用している。本年度はさらに踏み込んだ1H/1H同種核相関測定固体NMR法の開発や、(溶液NMRでのHMBC法にあたる)1H-14Nの長距離相関測定NMR法の開発に成功した。これらの技術はAPIの構造決定に中心的な役割を果たす重要測定であり、特にmicroED法で得られる構造を精密化するうえでかなめとなる情報を与える。これらの新規開発手法とmicroED法と組み合わせることにより効率の良い結晶構造解析として結実した。このように、本研究課題に必要になる要素技術の開発およびその組み合わせの応用をバランスよく着実に進展させており、おおむね順調に進展していると考えて差しさわりはない。今後、等方化学シフトだけでは十分な情報が得られない問題も予想されるので、それに合わせて双極子相互作用の大きさや化学シフト異方性などの情報を得る手法の開拓にも着手する予定である。

Strategy for Future Research Activity

低分子医薬品のmicroEDおよび固体NMRによる解析を進めていく中で、1H/1H相関および14Nの活用の重要性がハイライトされるようになってきた。また、化学構造が未知の場合に対応するための施策も必要になると考えられる。これらの現状を鑑みて、相関固体NMR測定法のさらなる開発および、化学式の決定法に2022年度は取り組む。それにより完全に固体の状態での解析のみにてAPIの構造解析を目指す。microEDおよび固体NMR法では、化学式の決定には不十分であるため、当初計画には含まれていなかったが、MASSによる精密分子量測定を用いることを検討している。特に固体粉末から直接解析が可能なDART法を組み合わせることにより、低分子医薬品の構造解析に大きく寄与する手法になりうると期待している。研究範囲が当初の計画より広くなりつつあるが、十分本プロジェクトの中で遂行可能であり、最終目標達成のために必要な経路は見えてきていると考えている。

Causes of Carryover

3,854円の次年度使用額が発生したが、それぞれの科目の端数により生じたものであり、次年度の研究計画に影響を及ぼすものではない。

  • Research Products

    (26 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 11 results)

  • [Int'l Joint Research] TIFR Hyderabad(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      TIFR Hyderabad
  • [Int'l Joint Research] IT Ropar(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      IT Ropar
  • [Int'l Joint Research] Iowa State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Iowa State University
  • [Int'l Joint Research] University of Bordeaux(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      University of Bordeaux
  • [Int'l Joint Research] South China University of Technology(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      South China University of Technology
  • [Journal Article] 3次元電子回折とNMR結晶学2022

    • Author(s)
      西山 裕介
    • Journal Title

      応用物理

      Volume: 91 Pages: 82~85

    • DOI

      10.11470/oubutsu.91.2_82

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of remote proton-nitrogen correlations by 1H-detected 14N overtone solid-state NMR at fast MAS2022

    • Author(s)
      Duong Nghia Tuan、Nishiyama Yusuke
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 24 Pages: 10717-10726

    • DOI

      10.1039/D2CP00155A

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Separating an overlapped 1H peak and identifying its 1H-1H correlations with the use of single-channel 1H solid-state NMR at fast MAS2022

    • Author(s)
      Duong Nghia Tuan、Agarwal Vipin、Nishiyama Yusuke
    • Journal Title

      Solid State Nuclear Magnetic Resonance

      Volume: 117 Pages: 101774~101774

    • DOI

      10.1016/j.ssnmr.2022.101774

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Proton-detected 15N-1H dipolar coupling/1H chemical shift correlation experiment for the measurement of NH distances in biological solids under fast MAS solid-state NMR2022

    • Author(s)
      Nehra Ekta、Sehrawat Neelam、Kobayashi Takeshi、Nishiyama Yusuke、Pandey Manoj Kumar
    • Journal Title

      Journal of Magnetic Resonance Open

      Volume: 10-11 Pages: 100028~100028

    • DOI

      10.1016/j.jmro.2021.100028

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Protein resonance assignment by solid-state NMR based on 1H-detected 13C double-quantum spectroscopy at fast MAS2021

    • Author(s)
      Lends Alons、Berbon Melanie、Habenstein Birgit、Nishiyama Yusuke、Loquet Antoine
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular NMR

      Volume: 75 Pages: 417~427

    • DOI

      10.1007/s10858-021-00386-6

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Proton triple-quantum solid-state NMR spectroscopy at slow MAS ~10 kHz2021

    • Author(s)
      Zhang Rongchun、Agarwal Vipin、Nishiyama Yusuke
    • Journal Title

      Journal of Magnetic Resonance Open

      Volume: 8-9 Pages: 100020~100020

    • DOI

      10.1016/j.jmro.2021.100020

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure Solution of Nano-Crystalline Small Molecules Using MicroED and Solid-State NMR Dipolar-Based Experiments2021

    • Author(s)
      Duong Nghia Tuan、Aoyama Yoshitaka、Kawamoto Katsumi、Yamazaki Toshio、Nishiyama Yusuke
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 26 Pages: 4652~4652

    • DOI

      10.3390/molecules26154652

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Determination of the chemical shift tensor anisotropy and asymmetry of strongly dipolar coupled protons under fast MAS2021

    • Author(s)
      Kobayashi Takeshi、Perras Frederic A.、Nishiyama Yusuke
    • Journal Title

      Solid State Nuclear Magnetic Resonance

      Volume: 114 Pages: 101743~101743

    • DOI

      10.1016/j.ssnmr.2021.101743

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Efficient symmetry-based γ-encoded DQ recoupling sequences for suppression of t1-noise in solid-state NMR spectroscopy at fast MAS2021

    • Author(s)
      Nishiyama Yusuke、Agarwal Vipin、Zhang Rongchun
    • Journal Title

      Solid State Nuclear Magnetic Resonance

      Volume: 114 Pages: 101734~101734

    • DOI

      10.1016/j.ssnmr.2021.101734

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Selective 1H-1H recoupling via symmetry sequences in fully protonated samples at fast magic angle spinning2021

    • Author(s)
      Potnuru Lokeswara Rao、Duong Nghia Tuan、Sasank Budaraju、Raran-Kurussi Sreejith、Nishiyama Yusuke、Agarwal Vipin
    • Journal Title

      Journal of Magnetic Resonance

      Volume: 328 Pages: 107004~107004

    • DOI

      10.1016/j.jmr.2021.107004

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] coherence pathway selection: 位相廻しの決め方2021

    • Author(s)
      西山裕介
    • Organizer
      第69回 固体NMR・材料フォーラム
    • Invited
  • [Presentation] microED および固体 NMR を用いたマイクロ結晶の構造解析2021

    • Author(s)
      西山裕介
    • Organizer
      2021年度前期(春季)有機合成化学講習会
    • Invited
  • [Presentation] Quantitative Distance Measurements between 1H and X by Fast MAS Solid-State NMR2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMR crystallography with microED2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      IUCr 2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMR crystallography with microED2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      錯体学会
    • Invited
  • [Presentation] Quantitative Distance Measurements between 1H and Xby Fast MAS Solid-State NMR2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      Frontiers of NMR and MRI
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMR nano-crystallography with microED2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      The 4th Workshop of the Reaction Infography (R-ing) Unit
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMR 結晶学: microED 、固体 NMR 、計算科学の融合2021

    • Author(s)
      西山裕介
    • Organizer
      理研シンポジウム:計算で物事を理解する予測する
    • Invited
  • [Presentation] microEDおよび固体NMRをもちいた微結晶構造解析2021

    • Author(s)
      西山裕介
    • Organizer
      東海コンファレンス2021 in 愛知
    • Invited
  • [Presentation] Locating hydroen atoms at very accurate positions by solid-state NMR and microED2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      Pacifichem 2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Homonuclear and heteronuclear correlationsin fast MAS solid-state NMR2021

    • Author(s)
      Yusuke Nishiyama
    • Organizer
      NMRS2022
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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