• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the structure-function relationship and the sugar-recognition mechanism of novel mutidomain transglucosidases acting on starch

Research Project

Project/Area Number 20K05956
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

殿塚 隆史  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (50285194)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords糖転移酵素 / マルチドメイン酵素 / α-アミラーゼファミリー / 澱粉
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、マルチドメインで構成される糖転移酵素Rmar_0285およびFjoh_1408を材料とし、構造機能相関に関する研究を進めている。両酵素ともドメイン構成はN1-N2-N3-A-B-C-Dと予測され、これまでにRmar_0285のN3-A-B-Cの発現系を構築し、立体構造を決定している。本年度はRmar_0285 N3-A-B-Cをマルトテトラオースに作用させ、反応産物を経時的に集め1H-NMRによって解析した。その結果、経時的にα-1,6-グルコシド結合のシグナルが大きくなることから、Rmar_0285はマルトオリゴ糖に作用してα-1,6-グルコシドを生成させる酵素であることが明らかになった。
生成物の構造を決定するため、触媒残基の1つであるAsp563をAlaに置換した改変酵素Rmar_0285 N3-A-B-C D563Aを作製し、精製、結晶化を行った。触媒残基を改変していないRmar_0285 N3-A-B-Cをマルトテトラオースに作用させて得られた糖をRmar_0285 N3-A-B-C D563Aの結晶にソーキングし、結合した糖の構造を解析した。その結果、6(2)-α-マルトシルマルトトリオースという構造であると決定され、本結果より、Rmar_0285は分岐オリゴ糖を生成させる酵素であることを明らかにした。また、本酵素と関連する酵素の立体構造と機能についても解析を行った。
Rmar_0285およびFjoh_1408について、N末端側のドメインN1の発現系を構築した。ポリアクリルアミドゲルに澱粉を加え電気泳動を行ったところ、澱粉を加えていないゲルによる泳動と比較しRmar_0285 N1、Fjoh_1408 N1ともバンドがシフトしたことから、ドメインN1は糖結合能を有することを明らかにした。

  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Structural basis for proteolytic processing of Aspergillus sojae α-glucosidase L with strong transglucosylation activity2022

    • Author(s)
      Ding Yifu、Oyagi Ayako、Miyasaka Yuki、Kozono Takuma、Sasaki Nobumitsu、Kojima Yuka、Yoshida Makoto、Matsumoto Yuji、Yasutake Nozomu、Nishikawa Atsushi、Tonozuka Takashi
    • Journal Title

      Journal of Structural Biology

      Volume: 214 Pages: 107874~107874

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2022.107874

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Staphylococcus aureus が産生するセリンプロテアーゼ ETDの立体構造解析2023

    • Author(s)
      佐藤柊, 西藤公司, Xu Guo, Rokaia Fathi Said Ragab, Ahmed Elfadadney, 小薗拓馬, 西河淳, 殿塚隆史
    • Organizer
      量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] 担子菌Coprinopsis cinerea由来α-L-アラビノフラノシダーゼCcAbf62Cの立体構造解析2023

    • Author(s)
      風間理之, 山本紗央, 小薗拓馬, 吉田誠, 西河淳, 殿塚隆史
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] Aspergillus sojae α-グルコシダーゼAsojAgdLとアカルボースとの複合体の立体構造解析2022

    • Author(s)
      Ding Yifu, 宮坂祐希,小薗拓馬, 西河淳, 松本雄治, 安武望, 殿塚隆史
    • Organizer
      日本応用糖質科学会
  • [Presentation] Faecalibacterium duncaniae β-フルクトフラノシダーゼの立体構造解析2022

    • Author(s)
      窪田有紗, 松浦明香, 小薗拓馬, 西河淳, 遠藤明仁, 藤井匡, 栃尾巧, 殿塚隆史
    • Organizer
      日本応用糖質科学会

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi