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2021 Fiscal Year Research-status Report

細胞内グルタミンセンサーは ”特異的で弱い結合” をどのように達成しているのか

Research Project

Project/Area Number 20K06555
Research InstitutionHamamatsu University School of Medicine

Principal Investigator

谷川 美頼  浜松医科大学, 医学部, 特任助教 (50553658)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsアミノ酸 / センサー / ラパマイシン / TORC1
Outline of Annual Research Achievements

細胞内グルタミンセンサーであるPib2は、mMレベルの高濃度グルタミン存在時にTORC1と結合しTORC1の活性化を引き起こす。Pib2がグルタミン依存的にどのようにTORC1を活性化するのかを明らかにするために以下の解析を行った。
(1) TORC1-Pib2の構造解析
Pib2を大腸菌から組換えタンパク質として精製することを試みているが、Pib2は天然変性領域からなるため分解凝集をおこしやすく難航している。C末端両側にエピトープタグを付加することにより分解を受けていないPib2を高純度で精製することができたが、Pib2はC末端側に1アミノ酸が付加されるだけでTORC1活性化能を失った。したがってPib2のC末端側からの精製ではTORC1活性化能を有したPib2は精製できないことがわかった。そこで酵母にTORC1-Pib2キメラを発現させ精製した。この精製キメラTORC1はグルタミン添加により試験管内で活性化される。このキメラTORC1のグルタミンにより引き起こされる構造変化をクロスリンクMS解析により明らかにしようと試みた。その結果、グルタミンによりキメラ内で架橋されるペプチドに変化がみられた。現在この結果の再現性を確認している。
(2) Pib2の天然変性領域(IDR)欠失変異体の解析
IDRの段階的欠失変異体のTORC1活性化能をモニターした。その結果、N末端側半分のIDRと、Eモチーフとtailモチーフ間のIDRの一部はTORC1活性化能を抑制していることが明らかになった。この領域は近縁種のオルソログでも天然変性領域であることが配列より予測されるが、アミノ酸配列の相同性はみられない。このことより、Pib2のIDRはTORC1内の特定の分子との結合を通じてPib2の活性を抑制しているのではなく、IDRのゆらぎが活性を抑制している可能性が示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

Pib2が天然変性タンパク質であり精製が困難であるために研究が難航している。

Strategy for Future Research Activity

Pib2がどのようにTORC1と結合し、TORC1がそれによりどのように構造変化し活性化するのかをPib2-TORC1キメラタンパク質のクロスリンクMS、およびクライオ電顕による構造解析により明らかにしたい。

Causes of Carryover

コロナウィルスの影響により当該研究の補助を行うアルバイトの雇用を断念し、その費用を翌年度分とした。本年度はアルバイトを雇用する予定である。

  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] A glutamine sensor that directly activates TORC12021

    • Author(s)
      Tanigawa Mirai、Yamamoto Katsuyoshi、Nagatoishi Satoru、Nagata Koji、Noshiro Daisuke、Noda Nobuo N.、Tsumoto Kouhei、Maeda Tatsuya
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4 Pages: 1093

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02625-w

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] TORC1-Gtr経路の新規上流因子の同定を目指したスクリーニング2022

    • Author(s)
      谷川美頼、外山美奈、前田達哉
    • Organizer
      日本農芸化学会 2022年度大会
  • [Presentation] Pib2 is a glutamine sensor that directly activates TORC                           that directly activates TORC12021

    • Author(s)
      谷川美頼 、山本 勝良 、長門石 曉 、津本 浩平、能代 大輔 、 野田 展生、永田 宏次 、前田 達哉
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] RNAヘリカーゼDed1, Dbp1によるTORC1活性制御機構の解析2021

    • Author(s)
      谷川美頼、亀井理恵、館川宏之、前田達哉
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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