2020 Fiscal Year Research-status Report

Comparative phylogeopraphy of river fishes using environmental DNA sequencing

Research Project

Project/Area Number	20K06782
Research Institution	Tohoku University
Principal Investigator	田邉晶史東北大学, 生命科学研究科, 助教 (40549044)
Project Period (FY)	2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords	環境DNA
Outline of Annual Research Achievements	2020年度は実験室の環境整備を行い、採集した試料を迅速に、汚染を抑制して分析できるようになった。環境DNA試料の採集も予定していたが、残念ながらCOVID-19禍のため長期・遠距離の出張を見送らざるを得ず、試料を得ることができなかった。このため、分析する試料がまだ手元に集まっていない。研究の進捗を早めるため、調査対象とする河川を大きく絞り込むこととした。計画では全国の1級河川のうちできるだけ多くを調査する予定だったが、さらに半分ほどまで減らし、2021年度に迅速な調査を進められるように準備を進めた。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 4: Progress in research has been delayed. Reason 環境DNA試料の採集も予定していたが、残念ながらCOVID-19禍のため長期・遠距離の出張を見送らざるを得ず、試料を得ることができなかった。このため、分析する試料がまだ手元に集まっていない。
Strategy for Future Research Activity	研究の進捗を早めるため、調査対象とする河川を大きく絞り込むこととした。計画では全国の1級河川のうちできるだけ多くを調査する予定だったが、さらに半分ほどまで減らし、短期間で調査と分析を行う。
Causes of Carryover	環境DNA試料の採集旅行を予定していたが、残念ながらCOVID-19禍により長期・遠距離の出張を見送らざるを得なかったため。
Remarks	メタバーコーディングデータ分析パイプラインClaidentを大幅に改訂し、様々な機能を追加した。これに伴い、分析手順が大きく変わったため、シミュレーションで作成したデータを分析する例を用意した。また、これに基づいて分析手順を解説した環境DNA学会での講演、および研究集会での講演の動画を公開した。