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2021 Fiscal Year Research-status Report

ペプチド側鎖環化による新規二次構造の創出と制御法の開発

Research Project

Project/Area Number 20K06967
Research InstitutionNagasaki University

Principal Investigator

上田 篤志  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(薬学系), 准教授 (10732315)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsジ置換アミノ酸 / ペプチド / 側鎖環化 / 薬学 / 有機化学
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、5員環状のジ置換アミノ酸の側鎖にアリル基を導入したものを用いて、ペプチド側鎖上でのE選択的架橋形成反応を試みた。このジ置換アミノ酸をペプチドのiとi + 4番目に導入し、種々の条件検討を行なった。その結果、第2世代Grubbs触媒を用いてトルエン中40度で反応を行うとE:Z = 24:1の高いE選択性で目的のステープルペプチドを与えた。この際5員環の立体化学の組み合わせが重要であり、ミスマッチな組み合わせでは選択性、収率ともに悪く、二量体などの副生成物の生成も見られた。開発した本手法は様々なペプチド配列においてもE選択的架橋が可能であった。さらに固相合成にも適用可能であり、最高59:1のE選択性で目的の側鎖架橋ペプチドを与えた。
一方、一般的に用いられる非環状のジ置換アミノ酸を用いた場合では、アルファ位の立体化学がいずれの場合であっても約2:1の低い選択性しか得られなかった。架橋ペプチドのX線結晶構造にも違いが見られ、5員環状ジ置換アミノ酸を含有した架橋ペプチドではα-ヘリックス構造に近似していたのに対し、非環状のジ置換アミノ酸を用いた架橋ペプチドでは3(10)-ヘリックス構造を示していた。
またE選択性発現の機構を調べるため、E体とZ体の混合物に対して最適条件下で反応を行なったところ、E体とZ体の異性化反応が進行し、E体が多く得られた。さらに環状ジ置換アミノ酸と非環状ジ置換アミノ酸同士の組み合わせでは、約3:1のE選択性であった。これらの特徴は本研究における大きな成果であり、今後の側鎖架橋を利用した機能性ペプチド開発における大事な指針となりうる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画書に記載した内容に従い各項目に関しての研究を行った。

Strategy for Future Research Activity

環状ジ置換アミノ酸を用いるE選択的側鎖架橋の方法が見つかったので、この手法を用いてペプチドの構造や機能を制御するアプローチを検討する。またペプチドカップリングに関しても既存の方法の問題点を解決する手法の開発に取り組む。

Causes of Carryover

新型コロナウイルス感染拡大のため、研究自粛期間や成果発表を予定していた学会がキャンセルになった影響が大きい。合成実験に必要な試薬の購入に充てる予定。

  • Research Products

    (22 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] E-Selective Ring-Closing Metathesis in α-Helical Stapled Peptides Using Carbocyclic α,α-Disubstituted α-Amino Acids2022

    • Author(s)
      Ueda Atsushi、Makura Yui、Kakazu Sana、Kato Takuma、Umeno Tomohiro、Hirayama Kazuhiro、Doi Mitsunobu、Oba Makoto、Tanaka Masakazu
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 24 Pages: 1049~1054

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.1c04256

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X-ray Crystallographic Structure of α-Helical Peptide Stabilized by Hydrocarbon Stapling at i,i + 1 Positions2021

    • Author(s)
      Makura Yui、Ueda Atsushi、Kato Takuma、Iyoshi Akihiro、Higuchi Mei、Doi Mitsunobu、Tanaka Masakazu
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 22 Pages: 5364~5364

    • DOI

      10.3390/ijms22105364

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Asymmetric 1,4‐Addition Reactions Catalyzed by N‐Terminal Thiourea‐Modified Helical L‐Leu Peptide with Cyclic Amino Acids2021

    • Author(s)
      Sato Kazuki、Umeno Tomohiro、Ueda Atsushi、Kato Takuma、Doi Mitsunobu、Tanaka Masakazu
    • Journal Title

      Chemistry - A European Journal

      Volume: 27 Pages: 11216~11220

    • DOI

      10.1002/chem.202101252

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ジ置換アミノ酸N-カルボキシ無水物の合成とペプチドカップリング反応への展開2022

    • Author(s)
      大木 優、上田 篤志、井吉 彬太、松本 卓、田中 正一
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] β位にメチル基を持つ光学活性3員環アミノ酸の合成とそのペプチドの二次構造解析2022

    • Author(s)
      田中 正一、本多 湧大、伊藤 貴仁、加藤 巧馬、土井 光暢、大庭 誠、上田 篤志
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] N末でi,i+1位架橋したα-ヘリカルペプチドの構造解析と有機触媒への利用2022

    • Author(s)
      井吉 彬太、上田 篤志、真倉 唯、樋口 明、加藤 巧馬、佐藤 和樹、梅野 智大、土井 光暢、田中 正一
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] ジ置換アミノ酸を利用したヘリカルペプチドフォルダマーの合成と利用2022

    • Author(s)
      上田 篤志
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] Asymmetric 1,4-addition reactions catalyzed by N-terminal thiourea-modified helical peptide having cyclic amino acid2021

    • Author(s)
      Kazuki Sato, Tomohiro Umeno, Atsushi Ueda, Mitsunobu Doi, Takuma Kato, Masakazu Tanaka
    • Organizer
      ACS Spring 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] E-selective ring-closing metathesis for i, i+4 stapled peptides using five-membered carbocyclic α,α-disubstituted α-amino acids2021

    • Author(s)
      Yui Makura, Atsushi Ueda, Tomohiro Umeno, Takuma Kato, Sana Kakazu, Kazuhiro Hirayama, Mitsunobu Doi, Makoto Oba, Masakazu Tanaka
    • Organizer
      ACS Spring 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Synthesis of helical hydrocarbon-stapled oligopeptides using L-proline at the N-terminus2021

    • Author(s)
      Atsushi Ueda, Kazuki Sato, Mei Higuchi, Tomohiro Umeno, Masakazu Tanaka
    • Organizer
      ACS Spring 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Helical peptide-catalyzed asymmetric 1,4-adition reaction of 2-fluoro- and 2-bromomalonates to α,β-unsaturated ketone2021

    • Author(s)
      Atsushi Ueda, Akihiro Iyoshi, Arisa Sugiyama, Kazuki Sato, Masakazu Tanaka
    • Organizer
      ACS Spring 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヘリカルステープルペプチドのE/Z選択性とX線結晶構造解析2021

    • Author(s)
      嘉数 沙奈、上田 篤志、真倉 唯、梅野 智大、加藤 巧馬、土井 光暢、田中 正一
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第15回年会
  • [Presentation] N末をチオウレアで修飾したヘリカルペプチド触媒による不斉マイケル付加反応2021

    • Author(s)
      佐藤 和樹、梅野 智大、上田 篤志、土井 光暢、加藤 巧馬、田中 正一
    • Organizer
      創薬懇話会2021 in 京都
  • [Presentation] ヘリカルペプチド触媒を用いた2-ハロマロン酸エステルの不斉マイケル付加反応の開発2021

    • Author(s)
      井吉 彬太, 上田 篤志, 杉山 綾里紗, 佐藤 和樹, 田中 正一
    • Organizer
      第58回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] ヘリカルペプチド型ホスフィン配位子を用いた不斉触媒反応の開発2021

    • Author(s)
      西岡 良真, 梅野 智大, 土井 光暢, 加藤 巧馬, 上田 篤志, 大庭 誠, 田中 正一
    • Organizer
      第58回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] ヘリカルペプチドの閉環メタセシス反応における鎖状および環状ジ置換アミノ酸の効果に関する研究2021

    • Author(s)
      嘉数 沙奈, 上田 篤志, 真倉 唯, 田中 正一
    • Organizer
      第58回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] i,i+1位架橋したα-ヘリカルペプチドのX線結晶構造解析と触媒としての利用2021

    • Author(s)
      井吉 彬太,上田 篤志,真倉 唯,樋口 明,加藤 巧馬,佐藤 和樹,梅野 智大,土井 光暢,田中 正一
    • Organizer
      第47回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] 5員環状ジ置換アミノ酸を利用したペプチド側鎖のE選択的閉環メタセシス反応2021

    • Author(s)
      上田 篤志,真倉 唯,梅野 智大,加藤 巧馬,嘉数 沙奈,平山 和浩,土井 光暢,大庭 誠,田中 正一
    • Organizer
      第47回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] ジ置換アミノ酸N-カルボキシ無水物の簡便な合成法の開発とそのカップリング反応2021

    • Author(s)
      大木 優,上田 篤志,井吉 彬太,松本 卓,田中 正一
    • Organizer
      第50回複素環化学討論会
  • [Presentation] Development of phosphine ligands with helical peptide for enantioselective [3+2]cycloaddition reactions2021

    • Author(s)
      Ryoma Nishioka, Tomohiro Umeno, Mitsunobu Doi, Takuma Kato, Atsushi Ueda, Makoto Oba, Masakazu Tanaka
    • Organizer
      第58回ペプチド討論会
  • [Presentation] α位とβ位に2つの不斉中心を持つ三員環状ジ置換アミノ酸よりなるペプチドの二次構造解析2021

    • Author(s)
      本多 湧大、上田 篤志、伊藤 貴仁、加藤 巧馬、土井 光暢、田中 正一
    • Organizer
      第38回日本薬学会九州支部大会
  • [Presentation] ヘリカルペプチドの側鎖架橋におけるジ置換アミノ酸のα位立体化学の効果2021

    • Author(s)
      嘉数 沙奈、上田 篤志、真倉 唯、田中 正一
    • Organizer
      第38回日本薬学会九州支部大会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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