再発DLBCLの遺伝子学的解析、同一患者の初発腫瘍と再発腫瘍を比較する

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20K07416
• Research Institution: Tokai University
• Principal Investigator: 中村 直哉 東海大学, 医学部, 教授 (50227922)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: DLBCL / IGH / gene expression

Outline of Annual Research Achievements

経時的に２回以上のリンパ節もしくは腫瘍生検が行われた、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫（Diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL）23症例、46検体について、それぞれの病理検体（Formalin-fixed paraffin-embedded tissue, FFPE）の薄切切片からDNAを抽出し、免疫グロブリン重鎖遺伝子（Immunoglobulin heavy chain gene, IGH）のPCR増幅とSanger sequenceに行い、IGH可変領域（IGHV）およびIGH-CDR3領域の解析を行い、経時的に行われたDLBCLのB細胞クローンが同一であるもの（真のDLBCL再発）9例、異なるもの（真の再発ではない新規DLBCL発生）12例、比較できなかったもの3例であった。
全サンプルのFFPEからRNAを抽出し、730遺伝子を網羅するnCounter pan Cancer immune profiling panelを用いて、Gene expression profiling（GEP）を行った。全サンプルの解析では、Volcano plots法を用いると、初発サンプルで、ATG16L1, ATM, MAP2K2, TGFB1, CCR7, CD5, TCF7, IKBKG, PIN1, IRF3が有意に高く、再発サンプルで、CCL27, YTHDF2, MAPK8, PSMB7が優位に高かった。また、初発と再発で同じB細胞クローンと同定できた9例の解析では、初発サンプルで、ATM, BIRC5が優位に高く、再発サンプルで、ATF2を始めとする14遺伝子が高かった。全サンプル解析と共通の遺伝子はなく、同じクローンが再発するときに特徴的な遺伝子発現パターンを見出したと考える。今後、さらに詳細な検討を加える。