• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Research-status Report

HUS症例由来Escherichia albertiiにおける病原性遺伝子の解析

Research Project

Project/Area Number 20K07506
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

伊豫田 淳  国立感染症研究所, 細菌第一部, 室長 (70300928)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
KeywordsE. albertii
Outline of Annual Research Achievements

溶血性尿毒症症候群を発症した患者から分離したE.albertiiは志賀毒素(Stx)2型のサブタイプのうち2fを産生し、典型的な腸管出血性大腸菌(enterohemorrhagic Escherichia coli: EHEC)が保有する病原性遺伝子群であるlocus of enterocyte effacement (LEE) genesを共通に持つ。この菌株の詳細な全ゲノム解析から、EHECにおけるLEEの発現制御遺伝子として我々が以前に同定したpch遺伝子群(pchA-E)のうち、EHECにおける主たる発現制御遺伝子として機能しているpchAおよびpchBのうち、pchBと相同性の高い遺伝子が存在することを見出した。この遺伝子の破壊株を昨年度確立した遺伝子破壊法を用いて作製したところ、LEE遺伝子発現が著しく減少することが明らかとなり、E.albertiiのLEE遺伝子群における主たる発現制御遺伝子として機能していることが示唆された。EHECにおいてLEE遺伝子群の発現が上昇する培養条件をE.albertiiでテストしたところ、E.albertiiではEHECとは全く異なる培養条件下でLEE遺伝子群の発現上昇が起こることが確認された。以上の結果から、EHECとE.albertiiで共通に見出される発現制御遺伝子pchBがこれらの違いに重要であるかどうかを解析する必要性が生じた。そこで、pchBの転写レベルをモニター可能なプラスミドを構築したので、今後各種培養条件下におけるpchB転写活性を測定すると共に、EHECにおけるpch遺伝子の発現制御遺伝子として機能している遺伝子の影響をE.albertiiで解析したい。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度確立したE. albertiiにおける遺伝子破壊システムによって、当該株における主たる発現制御遺伝子を破壊することが出来たため、今後の研究の進展が期待できる。

Strategy for Future Research Activity

EHECとE.albertiiで共通に見出されるLEE遺伝子群の発現制御遺伝子pchBの発現制御レベルを解析するため、pchBのプロモーターを含む転写制御領域と考えられる遺伝子上流領域をプロモーターを欠損したリポーター遺伝子上にクローニングした発現プラスミドを構築し、EHECとE.albertiiで違いの見られるLEE遺伝子群の発現上昇条件において、転写活性を測定する予定である。転写レベルで違いがない場合は翻訳レベルでの制御の可能性について解析を行う予定である。

Causes of Carryover

次年度に遺伝子解析用ソフト、および高額な消耗品費等を計上する計画であるため。

  • Research Products

    (16 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Subtilase cytotoxin from Shiga-toxigenic Escherichia coli impairs the inflammasome and exacerbates enteropathogenic bacterial infection2022

    • Author(s)
      Tsutsuki Hiroyasu、Zhang Tianli、Yahiro Kinnosuke、Ono Katsuhiko、Fujiwara Yukio、Iyoda Sunao、Wei Fan-Yan、Monde Kazuaki、Seto Kazuko、Ohnishi Makoto、Oshiumi Hiroyuki、Akaike Takaaki、Sawa Tomohiro
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104050~104050

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104050

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The global population structure and evolutionary history of the acquisition of major virulence factor-encoding genetic elements in Shiga toxin-producing Escherichia coli O121:H192021

    • Author(s)
      Nishida Ruriko et al.
    • Journal Title

      Microbial Genomics

      Volume: 7 Pages: 000716

    • DOI

      10.1099/mgen.0.000716

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A novel endoplasmic stress mediator, Kelch domain containing 7B (KLHDC7B), increased Harakiri (HRK) in the SubAB-induced apoptosis signaling pathway2021

    • Author(s)
      Yahiro Kinnosuke、Ogura Kohei、Tsutsuki Hiroyasu、Iyoda Sunao、Ohnishi Makoto、Moss Joel
    • Journal Title

      Cell Death Discovery

      Volume: 7 Pages: 360

    • DOI

      10.1038/s41420-021-00753-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An outbreak of food poisoning due to <i>Escherichia coli</i> serotype O7:H4 carrying <i>astA</i> for enteroaggregative <i>E. coli</i> heat-stable enterotoxin1 (EAST1)2021

    • Author(s)
      Kashima K.、Sato M.、Osaka Y.、Sakakida N.、Kando S.、Ohtsuka K.、Doi R.、Chiba Y.、Takase S.、Fujiwara A.、Shimada S.、Ishii R.、Mizokoshi A.、Takano M.、Lee K.、Iyoda S.、Honda A.
    • Journal Title

      Epidemiology and Infection

      Volume: 149 Pages: e244

    • DOI

      10.1017/S0950268821002338

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Collateral effects of deletion of nlpD on rpoS and rpoS-dependent genes2021

    • Author(s)
      Tsunoi Manami、Iyoda Sunao、Iwase Tadayuki
    • Journal Title

      Journal of Clinical Investigation

      Volume: 131 Pages: e152693

    • DOI

      10.1172/JCI152693

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Stabilizing Genetically Unstable Simple Sequence Repeats in the Campylobacter jejuni Genome by Multiplex Genome Editing: a Reliable Approach for Delineating Multiple Phase-Variable Genes2021

    • Author(s)
      Yamamoto Shouji、Iyoda Sunao、Ohnishi Makoto
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 12 Pages: e0140121

    • DOI

      10.1128/mBio.01401-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] RNA‐binding protein Hfq downregulates locus of enterocyte effacement‐encoded regulators independent of small regulatory RNA in enterohemorrhagic <i>Escherichia coli</i>2021

    • Author(s)
      Sudo Naoki、Lee Kenichi、Sekine Yasuhiko、Ohnishi Makoto、Iyoda Sunao
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 117 Pages: 86~101

    • DOI

      10.1111/mmi.14799

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Diversity of the Tellurite Resistance Gene Operon in Escherichia coli2021

    • Author(s)
      Nguyen Thi Thu Huong、Kikuchi Taisei、Tokunaga Tadaaki、Iyoda Sunao、Iguchi Atsushi
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 681175

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.681175

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Whole-Genome Sequencing of Shiga Toxin?Producing <i>Escherichia coli</i> OX18 from a Fatal Hemolytic Uremic Syndrome Case2021

    • Author(s)
      Lee Kenichi、Iguchi Atsushi、Uda Kazuhiro、Matsumura Sohshi、Miyairi Isao、Ishikura Kenji、Ohnishi Makoto、Seto Junji、Ishikawa Kanako、Konishi Noriko、Obata Hiromi、Furukawa Ichiro、Nagaoka Hiromi、Morinushi Hirotaka、Hama Natsuki、Nomoto Ryohei、Nakajima Hiroshi、Kariya Hideaki、Hamasaki Mitsuhiro、Iyoda Sunao
    • Journal Title

      Emerging Infectious Diseases

      Volume: 27 Pages: 1509~1512

    • DOI

      10.3201/eid2705.204162

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] マルチプレックスゲノム編集を用いてCampylobacter jejuniの表現型を制御する2022

    • Author(s)
      山本章治,伊豫田淳,大西 真
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 大腸菌 O103:H2 国内分離株とデータベース株を用いた高精度系統 解析及び完全長配列決定株のゲノム構造比較2022

    • Author(s)
      谷口愛樹,中村佳司,後藤恭宏,李謙一,大岡唯祐,小椋義俊,大西真,伊豫田淳,林哲也
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 大腸菌における亜テルル酸耐性オペロンの多様性2022

    • Author(s)
      井口純,Thi Thu Huong Nguyen,菊地泰生,伊豫田淳
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 完全長配列を用いたEHEC O157 clade 8のゲノムと Stx2ファー ジの多様性解析2022

    • Author(s)
      宮田達弥,谷口愛樹,中村 佳司,後藤恭宏,小椋義俊,大西真,伊豫田淳,林哲也
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Presentation] SubABにより発現するKLHDC7BはHarakiriを誘導し細胞死を引き起こす2022

    • Author(s)
      八尋錦之助,小倉康平,津々木 博康,伊豫田淳,大西真
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 腸管出血性大腸菌O157における変異型亜テルル酸耐性遺伝子tehAによる耐性増強2022

    • Author(s)
      赤坂龍矢,松本裕子,李謙一,小泉充正,佐藤寿夫,明田幸宏,大西真,伊豫田淳
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
  • [Remarks] 腸管出血性大腸菌 (EHEC) 検査・診断マニュアル

    • URL

      https://www.niid.go.jp/niid/images/lab-manual/EHEC20210907.pdf

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi