2021 Fiscal Year Research-status Report
小児腎腫瘍（腎芽腫）における11p13-14の新規原因遺伝子同定と機能解析
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20K07579
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| Research Institution | Research Institute for Clinical Oncology Saitama Cancer Center |
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Principal Investigator |
春田 雅之 地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 研究員 (80392190)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 腎芽腫 / CGH＋ SNP array |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでに、腎芽腫の予後予測分子マーカー探索のため腎芽腫に特化したCGH＋ SNP arrayを開発した。このarrayを用い腎芽腫の染色体異常を解析したところ腎芽腫既知原因遺伝子WT1遺伝子（11p13）近傍に共通微小染色体異常領域（11p13-14領域 1.0 Mb）を見出した。申請者はこの領域にWT1遺伝子とは異なる腎芽腫の新規原因遺伝子があると仮説を立て、腎芽腫の新規原因遺伝子の同定および新規原因遺伝子の機能解析を実施し、腎芽腫の新規治療法のための基礎的な知見を得ることを目的に本研究を実施する。
腎芽腫32症例にてX1, X2, X3について遺伝子変異は認めなかった。しかしながら、X1, X2, X3については多くの腫瘍でmRNA発現消失または減少を認めた。そこで、今年度は発現消失のメカニズムを探るため各遺伝子のプロモーター領域のDNAメチル化解析を実施した。しかしながら、腎芽腫50症例において各遺伝子のプロモーター領域のDNAメチル化は認められず、DNAメチル化とは異なるメカニズムによって各遺伝子の発現が消失、減少している可能性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
SARS-CoV-2感染拡大に伴う研究環境の制約のため当初の計画から遅延している。また、各遺伝子の発現消失、減少のメカニズムがDNAメチル化とは異なったため、異なるアプローチでの解析が必要となった。
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| Strategy for Future Research Activity |
各遺伝子の発現消失、減少の原因を明らかにするため、より詳細にqPCRを用いたコピー数解析を実施するとともに、プロモーター領域の変異解析を実施する。また、CGH + SNP解析を実施する症例数をさらに増やす。細胞株を用い、各遺伝子のがん抑制遺伝子としての可能性を解析する。
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| Causes of Carryover |
SARS-CoV-2感染拡大に伴う研究環境の制約か大きく、研究が遅滞したため。次年度、各遺伝子のプロモーター領域のシークエンシング解析とin vitro実験に使用する。また、CGH + SNP解析の症例数をさらに増やす。
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[Journal Article] Platelet-to-Lymphocyte Ratio Predicts the Efficacy of Pembrolizumab in Patients With Urothelial Carcinoma.2022
Author(s)
Kurashina R, Ando K, Inoue M, Izumi K, Maruyama R, Mitani K, Takenobu H, Haruta M, Iizuka T, Kamijo T, Kageyama Y.
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Journal Title
Anticancer Res.
Volume: 42
Pages: 1131-1136
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Frequent breakpoints of focal deletion and uniparental disomy in 22q11.1 or 11.2 segmental duplication region reveal distinct tumorigenesis in rhabdoid tumor of the kidney2021
Author(s)
Haruta M, Arai Y, Okita H, Tanaka Y, Takimoto T, Kamijo T, Oue T, Souzaki R, Taguchi T, Kuwahara Y, Chin M, Nakadate H, Hiyama E, Ishida Y, Koshinaga T, Kaneko Y.
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Journal Title
Genes Chromosomes Cancer.
Volume: 60
Pages: 546-558
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Loss of p53 suppresses replication stress-induced DNA damage in ATRX-deficient neuroblastoma2021
Author(s)
Akter J, Katai Y, Sultana P, Takenobu H, Haruta M, Sugino RP, Mukae K, Satoh S, Wada T, Ohira M, Ando K, Kamijo T.
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Journal Title
Oncogenesis
Volume: 10
Pages: 73
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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